More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0980 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  100 
 
 		 177 aa  348  2e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02672  cytochrome b561, putative  38.38 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  38.82 
 
 		 195 aa  117  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  38.42 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2495  putative cytochrome B561  39.55 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.943457 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  36.47 
 
 		 193 aa  111  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  37.57 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  36.47 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  34.64 
 
 		 187 aa  107  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  36.16 
 
 		 188 aa  104  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  34.81 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  32.39 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  35.83 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  37.28 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  36.05 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  34.66 
 
 		 182 aa  99  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  35.63 
 
 		 197 aa  98.2  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  39.2 
 
 		 178 aa  97.8  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  32.77 
 
 		 196 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  33.33 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  33.33 
 
 		 184 aa  95.5  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000195  cytochrome b561  35.26 
 
 		 179 aa  95.9  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000187144  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  32.77 
 
 		 184 aa  95.9  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  35.75 
 
 		 188 aa  95.1  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  32.57 
 
 		 189 aa  94.7  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  32.2 
 
 		 186 aa  94  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05925  cytochrome b561  34.68 
 
 		 179 aa  93.6  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  36.78 
 
 		 174 aa  93.2  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  37.85 
 
 		 183 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  34.3 
 
 		 196 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  30.86 
 
 		 183 aa  92  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  31.76 
 
 		 186 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  35.93 
 
 		 188 aa  90.1  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  33.14 
 
 		 182 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  32.6 
 
 		 183 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  31.98 
 
 		 186 aa  89  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  34.81 
 
 		 186 aa  89  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  30.81 
 
 		 187 aa  89  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  32.42 
 
 		 183 aa  89.4  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0686  cytochrome b561  35.47 
 
 		 188 aa  89  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  31.76 
 
 		 186 aa  88.2  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  32.04 
 
 		 183 aa  88.2  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  31.76 
 
 		 186 aa  88.2  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  31.76 
 
 		 186 aa  88.2  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  32.42 
 
 		 183 aa  87.8  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  31.87 
 
 		 183 aa  87.8  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  30.29 
 
 		 183 aa  87  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  38.15 
 
 		 172 aa  87.4  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  33.33 
 
 		 183 aa  86.7  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  33.14 
 
 		 186 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  32.04 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  32.04 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2129  cytochrome B561  34.09 
 
 		 198 aa  86.3  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000482046  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  33.89 
 
 		 178 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  31.18 
 
 		 186 aa  85.9  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  32.78 
 
 		 184 aa  85.5  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  32.57 
 
 		 177 aa  85.1  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1216  cytochrome b561  30.86 
 
 		 183 aa  85.1  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000559854  normal  0.299312 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  35.56 
 
 		 182 aa  84.3  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1029  cytochrome b561  37.36 
 
 		 181 aa  84  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145738  normal  0.0105144 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  32.93 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  35.91 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  33.9 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2791  cytochrome B561  30.68 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  32.78 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1120  cytochrome B561  33.52 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000137011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  32.57 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  32.95 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1610  cytochrome B561  30.51 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.726643  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2876  cytochrome B561  32 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.379711  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  30.53 
 
 		 188 aa  80.9  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  30.53 
 
 		 188 aa  80.9  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  30.53 
 
 		 188 aa  80.9  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  30.53 
 
 		 188 aa  80.9  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  30.53 
 
 		 188 aa  80.9  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2093  cytochrome B561  32.77 
 
 		 175 aa  80.9  0.000000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  30 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  30 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  31.52 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  30 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  32.2 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4003  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  29.67 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288533  normal  0.223807 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  31.05 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  29.89 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4656  cytochrome B561  36.53 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  31.67 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  33.33 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0472  putative cytochrome b561  29.71 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.73245e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  33.33 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  32.2 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  34.08 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  33.9 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  35.06 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  32.78 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  30.16 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  28.66 
 
 		 173 aa  77  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2152  cytochrome B561  35.42 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00081786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2495  cytochrome B561  32.73 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349664  normal  0.512394 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  28.89 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2101  cytochrome B561  32.73 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>