209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0722 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0287  predicted permease  53.98 
 
 		 815 aa  860    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05800  hypothetical protein  62.52 
 
 		 818 aa  943    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2957  hypothetical protein  54.04 
 
 		 810 aa  857    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133946  normal  0.10767 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000166  predicted ABC-type transport system permease component  64.01 
 
 		 818 aa  994    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0722  hypothetical protein  100 
 
 		 815 aa  1629    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000480127  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3019  efflux ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 		 809 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00602267  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3157  hypothetical protein  36.36 
 
 		 809 aa  428  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.513308  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1273  efflux ABC transporter permease  36.44 
 
 		 809 aa  424  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.924579 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3191  protein of unknown function DUF214  33.29 
 
 		 809 aa  413  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0495543  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  34.78 
 
 		 804 aa  416  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1124  hypothetical protein  33.17 
 
 		 809 aa  411  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.101154  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1159  hypothetical protein  36.19 
 
 		 810 aa  407  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184343 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00447  predicted inner membrane protein  34.13 
 
 		 804 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0535  efflux ABC transporter, permease protein  34.13 
 
 		 804 aa  393  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3120  hypothetical protein  33.75 
 
 		 804 aa  394  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749019 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00452  hypothetical protein  34.13 
 
 		 804 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0600  efflux ABC transporter, permease protein  33.88 
 
 		 804 aa  395  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.77559 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0431  efflux ABC transporter, permease protein  33.67 
 
 		 805 aa  394  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0575  efflux ABC transporter, permease protein  34 
 
 		 804 aa  393  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0545  efflux ABC transporter, permease protein  34.09 
 
 		 804 aa  395  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3114  protein of unknown function DUF214  34 
 
 		 804 aa  392  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1056  protein of unknown function DUF214  36.17 
 
 		 810 aa  388  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0557  efflux ABC transporter permease  33.97 
 
 		 804 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0555  efflux ABC transporter, permease protein  33.8 
 
 		 804 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0616  efflux ABC transporter permease  33.72 
 
 		 804 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0572  efflux ABC transporter permease  34.18 
 
 		 804 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.868504 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0562  efflux ABC transporter permease protein  33.62 
 
 		 804 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3003  protein of unknown function DUF214  34.46 
 
 		 810 aa  375  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.558274  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2310  ABC transporter, permease protein  28.34 
 
 		 836 aa  352  1e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.545589  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1487  ABC transporter, permease, putative  31.98 
 
 		 818 aa  343  9e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1698  hypothetical protein  31.3 
 
 		 823 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.405062 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  27.95 
 
 		 842 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2896  hypothetical protein  30.01 
 
 		 821 aa  336  9e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431502 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3446  ABC transporter, permease protein, putative  31.17 
 
 		 828 aa  332  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000339618  hitchhiker  0.000208184 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23050  hypothetical protein  30.74 
 
 		 833 aa  327  6e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.636342  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1046  hypothetical protein  32.21 
 
 		 828 aa  327  8.000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  28.85 
 
 		 835 aa  325  2e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1539  hypothetical protein  30.73 
 
 		 833 aa  324  4e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274903 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1545  hypothetical protein  30.73 
 
 		 833 aa  324  5e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2401  hypothetical protein  31.6 
 
 		 816 aa  324  5e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.678425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1480  hypothetical protein  30.73 
 
 		 833 aa  323  7e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4016  hypothetical protein  29.68 
 
 		 834 aa  319  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401086  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1918  hypothetical protein  30.01 
 
 		 835 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695603  hitchhiker  0.000000000000882803 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2266  permease, putative  28.27 
 
 		 838 aa  317  7e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1399  ABC transporter, permease protein  28.68 
 
 		 830 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2707  hypothetical protein  29.59 
 
 		 836 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2783  hypothetical protein  29.56 
 
 		 837 aa  313  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.667381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2066  hypothetical protein  27.42 
 
 		 838 aa  312  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134664  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1680  protein of unknown function DUF214  29.38 
 
 		 842 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.432743  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2686  hypothetical protein  29.5 
 
 		 842 aa  312  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1662  hypothetical protein  30.97 
 
 		 817 aa  311  4e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000552359  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  26.37 
 
 		 840 aa  309  1.0000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2209  hypothetical protein  26.1 
 
 		 819 aa  306  9.000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.795386  normal  0.224518 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2618  hypothetical protein  31.48 
 
 		 842 aa  302  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.855589  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2366  hypothetical protein  29.71 
 
 		 827 aa  297  5e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.197088  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2926  ABC transporter, permease, putative  29.72 
 
 		 835 aa  293  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  28.31 
 
 		 829 aa  292  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2390  hypothetical protein  29.94 
 
 		 831 aa  290  7e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.652609  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1989  hypothetical protein  28.22 
 
 		 827 aa  285  3.0000000000000004e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662339  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0684  hypothetical protein  31.89 
 
 		 829 aa  282  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.852275  normal  0.517784 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2560  hypothetical protein  30.49 
 
 		 834 aa  280  7e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00315514  hitchhiker  0.00000000000119307 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27140  hypothetical protein  29.29 
 
 		 830 aa  280  9e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  28.68 
 
 		 831 aa  280  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  27.87 
 
 		 832 aa  276  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2465  protein of unknown function DUF214  25.84 
 
 		 840 aa  274  5.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205544  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  28.84 
 
 		 844 aa  273  9e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  28.41 
 
 		 844 aa  273  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  28.04 
 
 		 835 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  27.79 
 
 		 826 aa  264  4.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  27.26 
 
 		 870 aa  263  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1029  hypothetical protein  28.5 
 
 		 869 aa  262  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  28.33 
 
 		 843 aa  261  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2015  hypothetical protein  27.92 
 
 		 844 aa  261  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2303  hypothetical protein  29.29 
 
 		 871 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0846  hypothetical protein  27.11 
 
 		 858 aa  256  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1602  hypothetical protein  29.05 
 
 		 874 aa  255  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000566259 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1668  hypothetical protein  29.03 
 
 		 871 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2280  hypothetical protein  29.03 
 
 		 871 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1315  protein of unknown function DUF214  26.89 
 
 		 861 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156464 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0934  hypothetical protein  28.43 
 
 		 869 aa  251  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  26.4 
 
 		 840 aa  251  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3255  hypothetical protein  27.56 
 
 		 839 aa  249  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0335123  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5607  hypothetical protein  28.51 
 
 		 871 aa  247  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0998  hypothetical protein  29.11 
 
 		 863 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0792753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3824  hypothetical protein  27.34 
 
 		 843 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4056  protein of unknown function DUF214  26.91 
 
 		 838 aa  244  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2785  protein of unknown function DUF214  26.57 
 
 		 857 aa  243  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.482364  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2318  hypothetical protein  28.61 
 
 		 871 aa  242  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2196  hypothetical protein  27.97 
 
 		 834 aa  241  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3458  hypothetical protein  26.76 
 
 		 857 aa  240  8e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.840481  normal  0.470717 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0008  protein of unknown function DUF214  29.95 
 
 		 836 aa  240  1e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3245  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  26.2 
 
 		 860 aa  239  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1259  efflux ABC transporter, permease protein  28.27 
 
 		 880 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356208  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1251  efflux ABC transporter, permease protein  28.16 
 
 		 883 aa  239  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0810  putative transmembrane protein  27.5 
 
 		 856 aa  238  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0551  hypothetical protein  26.85 
 
 		 823 aa  238  4e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.454209  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1400  putative permease  28.55 
 
 		 1108 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0898  hypothetical protein  29.17 
 
 		 851 aa  234  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0944  hypothetical protein  26.74 
 
 		 853 aa  234  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.69332 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2066  hypothetical protein  27.99 
 
 		 835 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>