More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0686 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02167  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase (anaerobic), large subunit, FAD/NAD(P)-binding  67.78 
 
 
542 aa  712    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1418  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  67.78 
 
 
542 aa  712    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.556923  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1021  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  56.52 
 
 
552 aa  640    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1410  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  67.78 
 
 
542 aa  711    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.656406 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0397  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  80.92 
 
 
560 aa  899    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2469  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  67.19 
 
 
542 aa  713    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.357992 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2524  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  67.19 
 
 
542 aa  713    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2393  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  67.98 
 
 
542 aa  715    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02126  hypothetical protein  67.78 
 
 
542 aa  712    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2512  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  67.19 
 
 
542 aa  713    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2420  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  67.19 
 
 
542 aa  712    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2382  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  67.78 
 
 
542 aa  712    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4148  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  65.31 
 
 
556 aa  699    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00376439  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3378  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  67.78 
 
 
542 aa  712    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2539  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  67.78 
 
 
542 aa  712    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2623  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  67.78 
 
 
542 aa  712    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3991  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  65.43 
 
 
551 aa  707    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.172557  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0686  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  100 
 
 
547 aa  1129    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0227  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  65.99 
 
 
551 aa  712    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3957  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  65.12 
 
 
556 aa  700    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0512  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  63.88 
 
 
562 aa  680    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000682192  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2805  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  68.57 
 
 
542 aa  726    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.701913 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0200  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  65.1 
 
 
547 aa  699    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207234  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2628  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  67.19 
 
 
542 aa  712    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.710716  normal  0.455755 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0248  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  64.62 
 
 
552 aa  687    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0402203  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0200  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  66.35 
 
 
547 aa  696    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0341607 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3299  FAD dependent oxidoreductase  45.19 
 
 
559 aa  458  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4111  FAD dependent oxidoreductase  44.88 
 
 
556 aa  426  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0402229 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0071  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  42.38 
 
 
556 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2622  FAD dependent oxidoreductase  41.33 
 
 
514 aa  399  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0001851  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2962  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  42.06 
 
 
556 aa  392  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0933  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  39.89 
 
 
556 aa  390  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0218972  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2516  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  40.3 
 
 
572 aa  386  1e-106  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.191896 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2844  FAD dependent oxidoreductase  42.51 
 
 
533 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676215  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1471  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  39.71 
 
 
585 aa  382  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.390324  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1521  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  42.39 
 
 
535 aa  375  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0946096  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2102  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  41.75 
 
 
512 aa  375  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.150536 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1228  FAD dependent oxidoreductase  39.25 
 
 
516 aa  369  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.677137  normal  0.683893 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1123  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  40.23 
 
 
582 aa  365  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3499  FAD dependent oxidoreductase  40.19 
 
 
522 aa  359  6e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.426927 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1438  FAD dependent oxidoreductase  38.28 
 
 
539 aa  352  1e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.198287  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0332  FAD dependent oxidoreductase  42.02 
 
 
445 aa  293  8e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2572  FAD dependent oxidoreductase  42.35 
 
 
407 aa  282  9e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.22049 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1177  FAD dependent oxidoreductase  40.63 
 
 
435 aa  272  1e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.624502 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1127  FAD dependent oxidoreductase  39.67 
 
 
384 aa  261  2e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46832  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3076  FAD dependent oxidoreductase  41.09 
 
 
408 aa  248  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0583  FAD dependent oxidoreductase  36.34 
 
 
389 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.6721  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1336  FAD dependent oxidoreductase  32.41 
 
 
545 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1126  FAD dependent oxidoreductase  35.69 
 
 
392 aa  243  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2532  FAD dependent oxidoreductase  33.46 
 
 
545 aa  233  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.941625  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5204  FAD dependent oxidoreductase  39.8 
 
 
424 aa  231  4e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0880  FAD dependent oxidoreductase  31.68 
 
 
486 aa  230  4e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1419  FAD dependent oxidoreductase  33.27 
 
 
545 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1317  FAD dependent oxidoreductase  33.27 
 
 
545 aa  230  5e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1799  FAD dependent oxidoreductase  34.25 
 
 
432 aa  225  1e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000252779  normal  0.373628 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  30.97 
 
 
556 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  31.45 
 
 
543 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  32.02 
 
 
574 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  31.88 
 
 
547 aa  147  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 
545 aa  145  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  30.28 
 
 
559 aa  143  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.9 
 
 
591 aa  139  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  28.63 
 
 
603 aa  137  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2412  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 
552 aa  137  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  29.93 
 
 
559 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 
519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.87 
 
 
583 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  29.94 
 
 
546 aa  134  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.16 
 
 
585 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 
576 aa  133  7.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 
559 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 
525 aa  131  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  29.21 
 
 
550 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  29.11 
 
 
573 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 
533 aa  130  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 
543 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 
496 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.51 
 
 
525 aa  129  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2576  FAD dependent oxidoreductase  28.34 
 
 
508 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 
595 aa  128  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  32.89 
 
 
528 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  27.87 
 
 
562 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 
582 aa  126  9e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  32.16 
 
 
560 aa  126  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  28.9 
 
 
529 aa  126  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 
578 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1198  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.02 
 
 
551 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2133  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.4 
 
 
526 aa  124  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 
574 aa  124  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 
532 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  28.7 
 
 
700 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.03 
 
 
605 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 
569 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 
568 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33290  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.82 
 
 
522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.954815  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4577  FAD dependent oxidoreductase  30.58 
 
 
559 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.31 
 
 
530 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 
532 aa  120  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2773  FAD dependent oxidoreductase  30.44 
 
 
507 aa  120  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114338  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 
531 aa  120  7e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>