165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0675 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0675  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  208  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0550  Excinuclease ABC C subunit domain protein  66.25 
 
 
100 aa  113  7.999999999999999e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0606  hypothetical protein  63.75 
 
 
94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.383877  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3592  GIY-YIG nuclease superfamily protein  60.42 
 
 
113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394656  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3638  GIY-YIG nuclease superfamily protein  61.36 
 
 
100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03022  hypothetical protein  65 
 
 
100 aa  111  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4475  GIY-YIG nuclease superfamily protein  65 
 
 
100 aa  111  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02973  hypothetical protein  65 
 
 
100 aa  111  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3616  GIY-YIG nuclease superfamily protein  65 
 
 
100 aa  111  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0543  GIY-YIG nuclease superfamily protein  65 
 
 
100 aa  111  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.792444 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3347  GIY-YIG nuclease superfamily protein  65 
 
 
100 aa  111  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3451  GIY-YIG nuclease superfamily protein  65 
 
 
100 aa  111  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3459  GIY-YIG nuclease superfamily protein  62.5 
 
 
120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3457  GIY-YIG nuclease superfamily protein  62.5 
 
 
120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3528  GIY-YIG nuclease superfamily protein  62.5 
 
 
120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3565  GIY-YIG nuclease superfamily protein  62.5 
 
 
120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3625  GIY-YIG nuclease superfamily protein  61.25 
 
 
120 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.791399  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0821  GIY-YIG nuclease superfamily protein  65.82 
 
 
103 aa  103  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594813  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3712  GIY-YIG nuclease superfamily protein  61.18 
 
 
95 aa  102  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3578  GIY-YIG nuclease superfamily protein  60.47 
 
 
95 aa  102  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4013  GIY-YIG nuclease superfamily protein  60.47 
 
 
95 aa  102  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3453  Excinuclease ABC C subunit domain protein  64.94 
 
 
100 aa  100  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.472079  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000538  excinuclease ABC C subunit  57.83 
 
 
106 aa  100  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.559483  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0597  GIY-YIG nuclease superfamily protein  64.94 
 
 
99 aa  100  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05350  hypothetical protein  60.24 
 
 
104 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3334  Excinuclease ABC C subunit domain protein  61.04 
 
 
100 aa  97.4  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.692644  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1731  Excinuclease ABC C subunit domain protein  58.14 
 
 
91 aa  94.7  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.26715  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0507  excinuclease ABC subunit C  55.29 
 
 
117 aa  94.4  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2824  excinuclease ABC subunit C  50.57 
 
 
92 aa  91.3  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0115  excinuclease ABC subunit C  53.49 
 
 
90 aa  90.5  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4217  excinuclease ABC subunit C  53.57 
 
 
163 aa  90.1  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0137  excinuclease ABC subunit C  53.49 
 
 
139 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0489368 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0136  excinuclease ABC subunit C  54.32 
 
 
140 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.228252 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0133  excinuclease ABC subunit C  54.32 
 
 
119 aa  87  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0140  Excinuclease ABC C subunit domain protein  54.43 
 
 
166 aa  87  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0136  excinuclease ABC subunit C  53.09 
 
 
147 aa  87  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0141  excinuclease ABC subunit C  53.16 
 
 
92 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0131  excinuclease ABC subunit C  51.85 
 
 
141 aa  84.3  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0136  excinuclease ABC subunit C  53.16 
 
 
167 aa  84.3  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0098  excinuclease ABC subunit C  47.19 
 
 
107 aa  83.6  9e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807182  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0972  GIY-YIG nuclease superfamily protein  51.72 
 
 
105 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4762  excinuclease ABC subunit C  48.78 
 
 
95 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000128421 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1452  excinuclease ABC subunit C  48.28 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00178124  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0080  excinuclease ABC subunit C  47.44 
 
 
117 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.76446  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11350  GIY-YIG nuclease superfamily protein  56.25 
 
 
87 aa  82.4  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.651931  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0879  endo/excinuclease domain-containing protein  46.84 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1139  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.1 
 
 
80 aa  81.6  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2126  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.44 
 
 
105 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3553  GIY-YIG nuclease superfamily protein  51.81 
 
 
93 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.158193 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1011  GIY-YIG nuclease superfamily protein  54.32 
 
 
113 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5743  excinuclease ABC subunit C  43.75 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.6194  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0038  excinuclease ABC subunit C  50.62 
 
 
97 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4401  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  41.11 
 
 
95 aa  78.6  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2257  Excinuclease ABC C subunit domain protein  50 
 
 
91 aa  78.6  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0145  endonuclease  49.4 
 
 
106 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0544  excinuclease ABC subunit C  48.75 
 
 
86 aa  77.8  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0876  excinuclease ABC subunit C  43.75 
 
 
237 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.644539 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3752  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.68 
 
 
84 aa  77.8  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0145  hypothetical protein  49.38 
 
 
122 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1080  GIY-YIG nuclease superfamily protein  51.9 
 
 
113 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.984225  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0980  GIY-YIG nuclease superfamily protein  46.39 
 
 
100 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0979  GIY-YIG nuclease superfamily protein  51.85 
 
 
113 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.888476  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2326  excinuclease ABC subunit C  41.25 
 
 
291 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2171  excinuclease ABC subunit C  39.08 
 
 
110 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000951078 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4244  GIY-YIG nuclease superfamily protein  47.78 
 
 
94 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2461  excinuclease ABC subunit C  41.25 
 
 
296 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.976587  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4370  excinuclease ABC subunit C  48.75 
 
 
84 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5558  excinuclease ABC subunit C  44.32 
 
 
90 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1438  excinuclease ABC subunit C  44.3 
 
 
86 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1262  endo/excinuclease domain protein  49.43 
 
 
105 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.505421  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1103  excinuclease ABC subunit C  48.75 
 
 
87 aa  75.1  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2636  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.05 
 
 
77 aa  74.7  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.303825  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1952  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.87 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3398  hypothetical protein  39.53 
 
 
116 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.711714  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1804  excinuclease ABC subunit C  38.37 
 
 
295 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2416  excinuclease ABC subunit C  38.37 
 
 
299 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2420  excinuclease ABC subunit C  38.37 
 
 
285 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.180406 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3617  putative excinuclease, subunit C  46.25 
 
 
98 aa  73.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3600  excinuclease ABC subunit C  47.56 
 
 
159 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2327  excinuclease ABC subunit C  51.9 
 
 
99 aa  73.9  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.418538  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2759  excinuclease ABC subunit C  46.75 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00570056  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1115  Excinuclease ABC C subunit domain protein  38.37 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0737  endo/excinuclease domain-containing protein  39.53 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1238  endo/excinuclease domain-containing protein  39.53 
 
 
284 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13970  predicted endonuclease containing a URI domain protein  47.67 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2276  endo/excinuclease domain-containing protein  39.53 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3008  endo/excinuclease domain-containing protein  39.53 
 
 
334 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.975273  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1079  excinuclease ABC, C subunit, N-terminal  42.5 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1589  endo/excinuclease domain-containing protein  39.53 
 
 
322 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.942614  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2472  excinuclease ABC subunit C  40.48 
 
 
86 aa  72  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.897508 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2943  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45.45 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1603  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.03 
 
 
88 aa  70.9  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000181458  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2851  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45.45 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0018  Excinuclease ABC C subunit domain protein  43.9 
 
 
93 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2278  excinuclease ABC subunit C  43.21 
 
 
89 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0732686  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03940  Excinuclease ABC C subunit domain protein  38.82 
 
 
86 aa  69.7  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0019  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.46 
 
 
93 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2084  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.51 
 
 
88 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000359134  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2891  excinuclease ABC subunit C  41.67 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.625064  normal  0.178968 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0682  excinuclease ABC subunit C  40.51 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000227073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>