14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0596 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0596  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  297  4e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  4.33635e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000120  hypothetical protein  77.93 
 
 		 145 aa  246  9e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107595  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05728  hypothetical protein  77.93 
 
 		 145 aa  244  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0586  hypothetical protein  60.69 
 
 		 145 aa  200  6e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.669917  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0832  hypothetical protein  30.47 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3856  hypothetical protein  28.12 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0783  hypothetical protein  26.87 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0252082  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3190  hypothetical protein  26.98 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.197114  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0675  hypothetical protein  28.12 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3635  hypothetical protein  28.12 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0155201  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3758  hypothetical protein  28.12 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.307291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3567  hypothetical protein  28.12 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0775  hypothetical protein  31.58 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166535  normal  0.0251261 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0749  hypothetical protein  31.58 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0457515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>