More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0557 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0557  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 
394 aa  825    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.921771  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0102  peptide methionine sulfoxide reductase  71.2 
 
 
381 aa  552  1e-156  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000793  peptide methionine sulfoxide reductase  68.31 
 
 
380 aa  550  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06690  peptide methionine sulfoxide reductase  68.85 
 
 
380 aa  541  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  55.12 
 
 
368 aa  427  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1427  peptide methionine sulfoxide reductase  48.47 
 
 
416 aa  403  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.208524  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  50.65 
 
 
397 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  54.12 
 
 
353 aa  404  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1043  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  51.25 
 
 
416 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.734062 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1630  methionine-R-sulfoxide reductase  53.82 
 
 
323 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00819616  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2264  methionine-R-sulfoxide reductase  50.87 
 
 
351 aa  375  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2646  methionine-R-sulfoxide reductase  52.01 
 
 
320 aa  368  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00677049  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3954  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  51.3 
 
 
321 aa  365  1e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5561  peptide methionine sulfoxide reductase  51.04 
 
 
321 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5388  peptide methionine sulfoxide reductase  50.45 
 
 
321 aa  354  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.52931  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5531  peptide methionine sulfoxide reductase  50.45 
 
 
321 aa  353  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5290  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  50.45 
 
 
321 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5115  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  50.45 
 
 
321 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5687  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  50.45 
 
 
321 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5617  peptide methionine sulfoxide reductase  50.15 
 
 
321 aa  352  7e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0373  methionine-R-sulfoxide reductase  50.89 
 
 
328 aa  352  8.999999999999999e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5569  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  50.15 
 
 
321 aa  351  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5132  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  50.15 
 
 
321 aa  350  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0809549  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5230  methionine-R-sulfoxide reductase  48.81 
 
 
321 aa  344  2e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05500  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  45.96 
 
 
385 aa  305  7e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4592  methionine-R-sulfoxide reductase  45.4 
 
 
368 aa  298  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  42.98 
 
 
735 aa  289  7e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1045  methionine-R-sulfoxide reductase  41.42 
 
 
364 aa  281  1e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0906  methionine-R-sulfoxide reductase  39.43 
 
 
375 aa  269  5.9999999999999995e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1893  methionine-R-sulfoxide reductase  39.09 
 
 
405 aa  265  8.999999999999999e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00784315  unclonable  2.29788e-16 
 
 
-
 
NC_002950  PG2088  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  43.03 
 
 
352 aa  261  1e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1385  methionine-R-sulfoxide reductase  42.69 
 
 
359 aa  261  2e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1374  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  43.6 
 
 
590 aa  259  5.0000000000000005e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0147038 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1314  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  40.18 
 
 
316 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.147945  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1088  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  41.98 
 
 
611 aa  251  2e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1839  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  39.13 
 
 
348 aa  247  2e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.94451  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1633  peptide methionine sulfoxide reductase family protein  38.68 
 
 
346 aa  241  1e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00891353  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0592  hypothetical protein  39.47 
 
 
329 aa  239  5e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000314472  hitchhiker  0.000621287 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0709  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  39.29 
 
 
317 aa  236  4e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00161368  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1279  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  37.74 
 
 
337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1363  peptide methionine sulfoxide reductase-like protein  38.31 
 
 
338 aa  226  6e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.312066  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1085  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  38.17 
 
 
332 aa  222  7e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3054  methionine-R-sulfoxide reductase  67.35 
 
 
155 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000457549  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2424  methionine-R-sulfoxide reductase  66.67 
 
 
158 aa  219  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.072868 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1104  methionine sulfoxide reductase B  70.67 
 
 
167 aa  215  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1104  methionine sulfoxide reductase B  70.67 
 
 
167 aa  215  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3626  methionine-R-sulfoxide reductase  56.47 
 
 
212 aa  212  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0190524 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2376  methionine sulfoxide reductase B  63.16 
 
 
187 aa  212  9e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1234  methionine-R-sulfoxide reductase  63.64 
 
 
290 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0160878 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0249  methionine-R-sulfoxide reductase  35.22 
 
 
309 aa  210  3e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1955  peptide methionine sulfoxide reductase, putative  64.14 
 
 
202 aa  207  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.81622  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0985  protein-methionine-S-oxide reductase  62.84 
 
 
181 aa  207  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000265676  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0704  methionine sulfoxide reductase B  67.14 
 
 
191 aa  206  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1484  methionine sulfoxide reductase A  52.98 
 
 
177 aa  204  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1513  methionine sulfoxide reductase A  52.98 
 
 
177 aa  204  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3952  methionine-R-sulfoxide reductase  65.69 
 
 
141 aa  202  7e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0722  peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB  37.87 
 
 
309 aa  202  8e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0217  methionine-R-sulfoxide reductase  62.94 
 
 
148 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.627751 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1000  methionine sulfoxide reductase A  50.88 
 
 
174 aa  201  3e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0264  peptide methionine sulfoxide reductase  48.54 
 
 
211 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0249  peptide methionine sulfoxide reductase  46.6 
 
 
214 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294417 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0859  peptide methionine sulfoxide reductase  50.29 
 
 
183 aa  196  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3055  peptide methionine sulfoxide reductase  52.94 
 
 
242 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.195694 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2482  peptide methionine sulfoxide reductase  47.62 
 
 
213 aa  193  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000558183  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  44.06 
 
 
211 aa  192  9e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1776  protein-methionine-S-oxide reductase  41.94 
 
 
212 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0416821  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2990  peptide methionine sulfoxide reductase  47.83 
 
 
198 aa  190  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2072  methionine sulfoxide reductase B  58.78 
 
 
152 aa  190  4e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91893  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0807  peptide methionine sulfoxide reductase  48.55 
 
 
174 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2651  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
175 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0559  methionine sulfoxide reductase A  48.09 
 
 
212 aa  189  9e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  46.93 
 
 
260 aa  187  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2286  methionine-R-sulfoxide reductase  64.03 
 
 
153 aa  187  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1688  peptide methionine sulfoxide reductase  48.84 
 
 
178 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1663  peptide methionine sulfoxide reductase  48.84 
 
 
178 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.652364  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1964  peptide methionine sulfoxide reductase  48.84 
 
 
178 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327953  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1931  peptide methionine sulfoxide reductase  48.84 
 
 
178 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2114  peptide methionine sulfoxide reductase  47.22 
 
 
209 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.905031  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  57.24 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4211  methionine-R-sulfoxide reductase  64.18 
 
 
158 aa  184  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1848  peptide methionine sulfoxide reductase  48.26 
 
 
178 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1523  peptide methionine sulfoxide reductase  49.14 
 
 
212 aa  182  8.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1443  peptide methionine sulfoxide reductase  48.24 
 
 
178 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165248  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1704  peptide methionine sulfoxide reductase  47.67 
 
 
178 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3441  peptide methionine sulfoxide reductase  45.36 
 
 
198 aa  182  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1885  peptide methionine sulfoxide reductase  47.67 
 
 
178 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3494  peptide methionine sulfoxide reductase  47.67 
 
 
178 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1711  peptide methionine sulfoxide reductase  47.67 
 
 
178 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2572  peptide methionine sulfoxide reductase  44.69 
 
 
223 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1846  peptide methionine sulfoxide reductase  47.67 
 
 
178 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  59.29 
 
 
311 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5708  methionine-R-sulfoxide reductase  62.41 
 
 
154 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226554  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1188  peptide methionine sulfoxide reductase  46.82 
 
 
208 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000171924  decreased coverage  0.000921348 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7199  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 
150 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.929536  normal  0.310731 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0118  hypothetical protein  46.89 
 
 
191 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1106  methionine-R-sulfoxide reductase  62.12 
 
 
157 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1125  peptide methionine sulfoxide reductase  43.93 
 
 
201 aa  177  3e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000367889  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1980  peptide methionine sulfoxide reductase  41.5 
 
 
204 aa  177  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5470  methionine-R-sulfoxide reductase  64.39 
 
 
153 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  54.55 
 
 
184 aa  177  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>