More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0550 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  100 
 
 		 224 aa  467  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  73.66 
 
 		 224 aa  358  5e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  73.66 
 
 		 224 aa  354  6.999999999999999e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  69.2 
 
 		 224 aa  336  9.999999999999999e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  67.71 
 
 		 225 aa  320  9.000000000000001e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  67.27 
 
 		 234 aa  316  2e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  66.52 
 
 		 224 aa  315  4e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  67.71 
 
 		 226 aa  314  7e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  65.77 
 
 		 230 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  66.52 
 
 		 245 aa  311  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  66.52 
 
 		 245 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  66.07 
 
 		 245 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  66.52 
 
 		 227 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  63.51 
 
 		 238 aa  304  6e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  64.13 
 
 		 238 aa  304  7e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  63.23 
 
 		 238 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  61.71 
 
 		 225 aa  301  5.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  61.71 
 
 		 225 aa  301  7.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  61.71 
 
 		 225 aa  301  7.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1837  nucleotidase  62.95 
 
 		 224 aa  301  7.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  61.71 
 
 		 225 aa  301  7.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1948  nucleotidase  62.95 
 
 		 224 aa  301  7.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103765  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  61.71 
 
 		 225 aa  301  7.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2289  nucleotidase  62.95 
 
 		 224 aa  301  7.000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  61.26 
 
 		 225 aa  300  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  61.26 
 
 		 225 aa  298  6e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  61.26 
 
 		 225 aa  298  6e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  61.71 
 
 		 225 aa  297  9e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  60.36 
 
 		 225 aa  293  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  60.36 
 
 		 225 aa  293  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  60.36 
 
 		 225 aa  293  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  60.36 
 
 		 225 aa  293  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  60.36 
 
 		 225 aa  293  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0368  nucleotidase  62.16 
 
 		 233 aa  293  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  61.26 
 
 		 225 aa  289  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  58.56 
 
 		 229 aa  278  5e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3427  nucleotidase  58.93 
 
 		 226 aa  270  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  56.95 
 
 		 224 aa  266  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0779  nucleotidase  57.85 
 
 		 228 aa  266  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.655006  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  42.24 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0743  HAD family hydrolase  42.24 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1884  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  38.33 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3370  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  38.33 
 
 		 236 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.013018  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3362  HAD superfamily hydrolase  37.89 
 
 		 236 aa  146  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0552975  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3145  HAD superfamily hydrolase  37.89 
 
 		 236 aa  145  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3392  HAD superfamily hydrolase  37.89 
 
 		 236 aa  145  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3367  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  37.89 
 
 		 236 aa  145  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3132  HAD superfamily hydrolase  37.89 
 
 		 236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3039  HAD superfamily hydrolase  37.89 
 
 		 236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0500536  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3346  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  38.33 
 
 		 236 aa  145  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3072  HAD family hydrolase  37.89 
 
 		 236 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302299  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5532  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.6 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5420  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  32 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5588  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.04 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5202  HAD family hydrolase  32 
 
 		 231 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5537  HAD superfamily hydrolase  31.11 
 
 		 231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5088  HAD superfamily hydrolase  32 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5105  HAD superfamily hydrolase  32 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5503  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.56 
 
 		 231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5260  HAD superfamily hydrolase  31.56 
 
 		 231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397097  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5658  HAD superfamily hydrolase  31.56 
 
 		 231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3817  HAD family hydrolase  32.35 
 
 		 242 aa  125  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000009679  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0740  HAD superfamily hydrolase  33.48 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.96225  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  33.33 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  30.7 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1259  HAD family hydrolase  30.87 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.380734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1234  HAD family hydrolase  30.87 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3750  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.18 
 
 		 231 aa  111  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0412  HAD family hydrolase  30.13 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.46 
 
 		 227 aa  108  5e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0240  HAD superfamily hydrolase  33.16 
 
 		 232 aa  108  6e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.13 
 
 		 229 aa  108  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.36954 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  32.68 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  32.68 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1759  hydrolase  27.56 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3999  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.44 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815808  hitchhiker  0.00000000000557769 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0667  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.07 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.84 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0804  nucleotidase  33.14 
 
 		 201 aa  101  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1281  HAD superfamily hydrolase  29.69 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  29.06 
 
 		 231 aa  99  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0446  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.56 
 
 		 240 aa  99  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1604  HAD superfamily hydrolase  28.18 
 
 		 230 aa  96.7  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00646761  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0780  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.79 
 
 		 228 aa  96.3  3e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  31 
 
 		 235 aa  95.5  5e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3624  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.67 
 
 		 231 aa  95.5  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795882  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.97 
 
 		 254 aa  93.2  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.21 
 
 		 225 aa  89  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00341069  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  27.68 
 
 		 230 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.57 
 
 		 223 aa  85.9  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  27.68 
 
 		 230 aa  85.1  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  27.68 
 
 		 231 aa  84.7  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  27.68 
 
 		 231 aa  84.7  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  35.29 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  27.23 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.79 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  34.17 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29 
 
 		 260 aa  81.6  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  40.38 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0154  HAD family hydrolase  26.87 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>