More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0478 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000189  5'-nucleotidase  64.55 
 
 
578 aa  750    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000310598  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05914  5'-nucleotidase  62.74 
 
 
585 aa  752    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0478  putative 5`-nucleotidase  100 
 
 
580 aa  1201    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000584896  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0450  5'-nucleotidase  47.04 
 
 
579 aa  517  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1300  5'-nucleotidase  44.39 
 
 
592 aa  474  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.291258  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1111  metallophosphoesterase  44.9 
 
 
578 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.443136  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2657  5'-nucleotidase domain-containing protein  44.4 
 
 
581 aa  464  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1223  metallophosphoesterase  44.07 
 
 
583 aa  463  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1294  metallophosphoesterase  44.07 
 
 
583 aa  464  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.260824  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1224  metallophosphoesterase  44.25 
 
 
583 aa  464  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.618653  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3317  5'-nucleotidase, putative  43.36 
 
 
583 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1539  metallophosphoesterase  42.83 
 
 
577 aa  456  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.337659 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2370  5'-nucleotidase, putative  44.14 
 
 
573 aa  456  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.405664 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1285  5'-nucleotidase  43.32 
 
 
586 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.64405 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1368  metallophosphoesterase  42.93 
 
 
580 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.198191  normal  0.0110218 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1427  5'-nucleotidase  42.36 
 
 
581 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3010  5'-nucleotidase domain-containing protein  43.03 
 
 
581 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1252  5'-nucleotidase-like protein  42.91 
 
 
580 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2995  5'-nucleotidase domain-containing protein  42.86 
 
 
581 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3153  5'-nucleotidase domain protein  42.86 
 
 
581 aa  452  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867594 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2772  putative 5'-nucleotidase  31.5 
 
 
664 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000553351  hitchhiker  0.00604315 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0349  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  30.83 
 
 
591 aa  260  6e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0357  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  31.67 
 
 
607 aa  244  3e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  32.68 
 
 
581 aa  242  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  31.91 
 
 
558 aa  237  5.0000000000000005e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2800  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.86 
 
 
601 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.906182  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0538  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  29.33 
 
 
584 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.68 
 
 
523 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  30.22 
 
 
523 aa  217  4e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1134  5'-nucleotidase  30.07 
 
 
625 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00179734  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  29.26 
 
 
555 aa  211  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  27.53 
 
 
663 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.95 
 
 
533 aa  198  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  28.57 
 
 
529 aa  197  5.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43694  predicted protein  28.16 
 
 
663 aa  195  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.553489  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  28.76 
 
 
526 aa  194  4e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.2 
 
 
627 aa  192  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  27.69 
 
 
520 aa  189  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  28.54 
 
 
532 aa  187  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4022  5'-nucleotidase  29.17 
 
 
641 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.887399 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.83 
 
 
607 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.81 
 
 
605 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  26.9 
 
 
638 aa  179  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0692  5'-nucleotidase  29.07 
 
 
637 aa  178  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0157449 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0670  5'-nucleotidase  29.07 
 
 
637 aa  177  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.785834  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  26.07 
 
 
659 aa  177  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5725  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.65 
 
 
672 aa  175  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.695831 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  25.88 
 
 
657 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.16 
 
 
587 aa  158  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2431  5'-nucleotidase precursor  27.63 
 
 
619 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.157561  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05939  conserved hypothetical protein  27.96 
 
 
582 aa  150  6e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  25.85 
 
 
504 aa  138  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.04 
 
 
515 aa  134  5e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  25.31 
 
 
523 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.29 
 
 
508 aa  129  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.98 
 
 
509 aa  117  5e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.05 
 
 
517 aa  116  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4342  metallophosphoesterase  30.56 
 
 
313 aa  111  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.266194  normal  0.291471 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  24.17 
 
 
518 aa  110  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  23.18 
 
 
520 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  23.18 
 
 
523 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  23.18 
 
 
520 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  0.180073 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  24.17 
 
 
518 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0036  5'-Nucleotidase domain-containing protein  23.18 
 
 
523 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0257777 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  24.17 
 
 
518 aa  107  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  23.99 
 
 
518 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  24.17 
 
 
518 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  23.37 
 
 
530 aa  101  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  21.33 
 
 
516 aa  100  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0324  metallophosphoesterase  27.57 
 
 
313 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0297927  normal  0.111016 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1793  metallophosphoesterase  29.8 
 
 
302 aa  100  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0998  5'-Nucleotidase domain protein  24.26 
 
 
515 aa  99.8  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  23.69 
 
 
517 aa  99  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.32 
 
 
503 aa  98.6  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2185  metallophosphoesterase  29.35 
 
 
315 aa  98.2  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.123783  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0441  5'-Nucleotidase domain protein  23.85 
 
 
520 aa  96.7  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000373841  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.47 
 
 
508 aa  95.5  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.47 
 
 
508 aa  95.5  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  25.57 
 
 
489 aa  94  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  21.5 
 
 
1181 aa  93.2  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0023  cell wall anchor domain-containing protein  24.18 
 
 
772 aa  92.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.244704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0023  cell wall anchor domain-containing protein  24.18 
 
 
772 aa  92.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0275377  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  21.12 
 
 
1175 aa  90.1  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  22.79 
 
 
1215 aa  90.1  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2669  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.49 
 
 
569 aa  89  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000803412  normal  0.0151204 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1908  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.83 
 
 
572 aa  89.4  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00316066  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0972  5'-Nucleotidase domain protein  27.69 
 
 
481 aa  89  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  22.67 
 
 
1202 aa  87.8  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2272  5'-Nucleotidase domain protein  23.48 
 
 
698 aa  85.5  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1038  metallophosphoesterase  30.11 
 
 
638 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27161  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1235  5'-Nucleotidase domain protein  25.8 
 
 
613 aa  85.1  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.798144  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1474  5'-nucleotidase domain-containing protein  21.95 
 
 
491 aa  84.3  0.000000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4253  twin-arginine translocation pathway signal  30.83 
 
 
565 aa  83.6  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417802  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3228  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.58 
 
 
549 aa  83.2  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00425735  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1926  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.93 
 
 
568 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2257  5'-nucleotidase family protein  22.11 
 
 
533 aa  82  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000083157  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04020  conserved hypothetical protein  23.68 
 
 
788 aa  82.4  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.43338  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1083  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.36 
 
 
549 aa  82.8  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000234705  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1753  UshA protein  23.44 
 
 
508 aa  81.6  0.00000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0581  5'-Nucleotidase domain protein  22.46 
 
 
504 aa  80.9  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>