More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0450 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  100 
 
 		 317 aa  644    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  69.87 
 
 		 323 aa  444  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  66.36 
 
 		 325 aa  436  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  67.31 
 
 		 324 aa  433  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  58.5 
 
 		 313 aa  370  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1653  1-phosphofructokinase  48.88 
 
 		 312 aa  296  4e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000747305  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1925  1-phosphofructokinase  48.56 
 
 		 312 aa  294  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  49.52 
 
 		 312 aa  287  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  49.2 
 
 		 312 aa  285  5.999999999999999e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0795  1-phosphofructokinase  49.36 
 
 		 312 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412726  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02097  1-phosphofructokinase  49.36 
 
 		 312 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00508947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1490  1-phosphofructokinase  49.36 
 
 		 312 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119891  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2305  1-phosphofructokinase  49.36 
 
 		 312 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000269227  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02056  hypothetical protein  49.36 
 
 		 312 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2315  1-phosphofructokinase  49.36 
 
 		 312 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000477642  hitchhiker  0.000599069 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3304  1-phosphofructokinase  49.36 
 
 		 312 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000243379  normal  0.0139965 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1480  1-phosphofructokinase  49.36 
 
 		 312 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00345053  unclonable  0.000000014871 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2762  1-phosphofructokinase  49.36 
 
 		 312 aa  282  4.0000000000000003e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2465  1-phosphofructokinase  49.36 
 
 		 312 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000474355  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  49.36 
 
 		 312 aa  281  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2555  1-phosphofructokinase  49.36 
 
 		 312 aa  281  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0672567  hitchhiker  0.000484792 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2353  1-phosphofructokinase  49.36 
 
 		 312 aa  281  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2444  1-phosphofructokinase  49.36 
 
 		 312 aa  281  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105747  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2441  1-phosphofructokinase  49.36 
 
 		 312 aa  281  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  hitchhiker  0.00000493552 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2682  1-phosphofructokinase  48.56 
 
 		 312 aa  277  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000785688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1525  1-phosphofructokinase  48.56 
 
 		 312 aa  277  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144942  normal  0.0682972 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2763  1-phosphofructokinase  48.56 
 
 		 312 aa  277  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0176318  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  48.7 
 
 		 313 aa  275  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3229  1-phosphofructokinase  47.92 
 
 		 313 aa  271  9e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000483919 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  48.04 
 
 		 315 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0955  1-phosphofructokinase  45.78 
 
 		 313 aa  255  6e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1584  1-phosphofructokinase  44.69 
 
 		 315 aa  252  7e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0822  1-phosphofructokinase  45.78 
 
 		 313 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.866329  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  45.1 
 
 		 315 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18260  1-phosphofructokinase  44.81 
 
 		 314 aa  249  5e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00550374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  44.77 
 
 		 315 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  46.41 
 
 		 315 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  44.52 
 
 		 306 aa  241  9e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  43.83 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2647  PfkB  43.59 
 
 		 322 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150018  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  41.67 
 
 		 326 aa  215  5.9999999999999996e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  41.02 
 
 		 330 aa  198  7.999999999999999e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2896  1-phosphofructokinase  38.61 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.931372  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  39.1 
 
 		 327 aa  192  5e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  39.24 
 
 		 318 aa  191  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  39.3 
 
 		 315 aa  189  8e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  37.1 
 
 		 317 aa  185  9e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  35.39 
 
 		 315 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  36.81 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  34.3 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  31.82 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  34.73 
 
 		 318 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00488  1-phosphofructokinase  35.76 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  30.97 
 
 		 308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  30.87 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  34.41 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  31.19 
 
 		 311 aa  159  6e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0907  1-phosphofructokinase  35.95 
 
 		 349 aa  159  8e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1793  tagatose-6-phosphate kinase  32.04 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.354584  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  28.95 
 
 		 302 aa  157  3e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2664  1-phosphofructokinase  36.9 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.877221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  33.22 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  29.52 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0611  1-phosphofructokinase  38.17 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  33.23 
 
 		 324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0434  1-phosphofructokinase  38.4 
 
 		 328 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.89166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1787  1-phosphofructokinase  38.78 
 
 		 328 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  31.6 
 
 		 310 aa  152  8e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  29.87 
 
 		 310 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  30.07 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0109  1-phosphofructokinase  28.57 
 
 		 302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  31.27 
 
 		 303 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  31.27 
 
 		 303 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  31.27 
 
 		 303 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  30.19 
 
 		 306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  30.94 
 
 		 303 aa  145  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  28.16 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  28.78 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  29.13 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  30.89 
 
 		 316 aa  143  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  32.47 
 
 		 314 aa  143  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  28.57 
 
 		 306 aa  142  5e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  30.82 
 
 		 303 aa  142  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  26.3 
 
 		 305 aa  142  6e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  28.34 
 
 		 315 aa  142  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  30.16 
 
 		 303 aa  142  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  29.12 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  31.27 
 
 		 303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4251  ribokinase-like domain-containing protein  34.63 
 
 		 331 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.598338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  29.74 
 
 		 303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  31.71 
 
 		 303 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  28.06 
 
 		 311 aa  139  7.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  31.71 
 
 		 303 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  30.94 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0744  1-phosphofructokinase  33.22 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0611075  normal  0.168241 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  30.43 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  28.3 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  28.1 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  29.87 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>