258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0447 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000111  aspartate aminotransferase  78.63 
 
 		 395 aa  672    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05719  aromatic amino acid aminotransferase  79.13 
 
 		 398 aa  671    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0447  aromatic amino acid aminotransferase  100 
 
 		 393 aa  822    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0789  aromatic amino acid aminotransferase  62.85 
 
 		 395 aa  537  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0630  aromatic amino acid aminotransferase  48.72 
 
 		 394 aa  392  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2635  aromatic amino acid aminotransferase  46.41 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.574688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0121  aromatic amino acid aminotransferase  47.45 
 
 		 406 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1320  aromatic amino acid aminotransferase  44.56 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4016  aromatic amino acid aminotransferase  44.81 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000187367  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2545  aromatic amino acid aminotransferase  46.17 
 
 		 406 aa  378  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0886  aromatic amino acid aminotransferase  46.17 
 
 		 394 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2228  aromatic amino acid aminotransferase  41.27 
 
 		 397 aa  365  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.207544  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1733  aromatic amino acid aminotransferase  42.78 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.162633  hitchhiker  0.000702513 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1113  aromatic amino acid aminotransferase  43.04 
 
 		 396 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.614481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1004  aromatic amino acid aminotransferase  42.78 
 
 		 396 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0709004  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1096  aromatic amino acid aminotransferase  42.78 
 
 		 396 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1031  aromatic amino acid aminotransferase  42.78 
 
 		 396 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.643394  hitchhiker  0.0066077 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1063  aromatic amino acid aminotransferase  42.78 
 
 		 396 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000263956 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7524  aromatic amino acid aminotransferase  43.77 
 
 		 394 aa  362  5.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1951  aromatic amino acid aminotransferase  42.53 
 
 		 396 aa  362  8e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0169777  hitchhiker  0.00556928 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1750  aromatic amino acid aminotransferase  42.78 
 
 		 396 aa  362  8e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.270408  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2406  aromatic amino acid aminotransferase  42.78 
 
 		 396 aa  361  1e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1974  aromatic amino acid aminotransferase  43.04 
 
 		 396 aa  361  1e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00339161  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2282  aromatic amino acid aminotransferase  43.04 
 
 		 396 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00982578  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1921  aromatic amino acid aminotransferase  42.78 
 
 		 396 aa  360  3e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0115062  hitchhiker  0.00000000119915 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2070  aromatic amino acid aminotransferase  42.03 
 
 		 397 aa  359  4e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0652807  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2063  aromatic amino acid aminotransferase  42.53 
 
 		 396 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0705193  unclonable  0.00000000000361956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4005  aromatic amino acid aminotransferase  45.66 
 
 		 396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143022  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2399  aromatic amino acid aminotransferase  42.78 
 
 		 396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000566266  unclonable  0.00000997439 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2057  aromatic amino acid aminotransferase  42.53 
 
 		 396 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00131277  unclonable  0.0000291193 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2225  aromatic amino acid aminotransferase  40 
 
 		 398 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2045  aromatic amino acid aminotransferase  42.53 
 
 		 396 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00201234  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2411  aromatic amino acid aminotransferase  40 
 
 		 397 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0265912  hitchhiker  0.0000197761 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2121  aromatic amino acid aminotransferase  41.01 
 
 		 397 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0183717  normal  0.0291877 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2067  aromatic amino acid aminotransferase  42.53 
 
 		 396 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.217652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1027  aromatic amino acid aminotransferase  41.77 
 
 		 396 aa  354  1e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0212839  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00932  aspartate aminotransferase, PLP-dependent  41.77 
 
 		 396 aa  354  1e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00626502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2715  Aspartate transaminase  41.77 
 
 		 396 aa  354  1e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0131246  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00939  hypothetical protein  41.77 
 
 		 396 aa  354  1e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00958049  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2668  aromatic amino acid aminotransferase  41.77 
 
 		 396 aa  354  1e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0040813  normal  0.145428 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1232  aromatic amino acid aminotransferase  42.42 
 
 		 397 aa  354  1e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1036  aromatic amino acid aminotransferase  41.77 
 
 		 396 aa  354  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2390  aromatic amino acid aminotransferase  41.77 
 
 		 396 aa  354  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0218945  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2192  aromatic amino acid aminotransferase  41.77 
 
 		 396 aa  354  1e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.330977 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2020  aromatic amino acid aminotransferase  40.76 
 
 		 397 aa  354  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00317803  hitchhiker  0.00000201349 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2126  aromatic amino acid aminotransferase  42.28 
 
 		 396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.621421  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1955  aromatic amino acid aminotransferase  40.76 
 
 		 397 aa  353  4e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227805 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2024  aromatic amino acid aminotransferase  40.25 
 
 		 397 aa  353  4e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01010  aromatic amino acid aminotransferase  40.76 
 
 		 396 aa  352  5e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00165068  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1089  aromatic amino acid aminotransferase  41.52 
 
 		 396 aa  352  7e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00147404  normal  0.202333 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1447  aromatic amino acid aminotransferase  41.77 
 
 		 396 aa  352  8e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.295787  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4970  aromatic amino acid aminotransferase  41.27 
 
 		 396 aa  350  2e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11391  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2308  aromatic amino acid aminotransferase  41.75 
 
 		 401 aa  350  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0907189  unclonable  0.0000000247869 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1999  aromatic amino acid aminotransferase  39.24 
 
 		 397 aa  348  6e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1687  aromatic amino acid aminotransferase  41.52 
 
 		 399 aa  348  1e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.262918  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2350  aromatic amino acid aminotransferase  38.73 
 
 		 397 aa  347  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0028  aromatic amino acid aminotransferase  41.33 
 
 		 399 aa  347  2e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53010  aromatic amino acid aminotransferase  43.9 
 
 		 399 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2301  aromatic amino acid aminotransferase  41.75 
 
 		 401 aa  345  5e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.359356  hitchhiker  0.0000000291416 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0838  aromatic amino acid aminotransferase  41.01 
 
 		 396 aa  346  5e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4445  aromatic amino acid aminotransferase  40.05 
 
 		 398 aa  345  7e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056127 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2228  aromatic amino acid aminotransferase  38.73 
 
 		 397 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000156913  normal  0.0325247 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1945  aromatic amino acid aminotransferase  38.73 
 
 		 397 aa  344  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3114  aromatic amino acid aminotransferase  44.42 
 
 		 398 aa  343  4e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.384285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4646  aromatic amino acid aminotransferase  43.38 
 
 		 399 aa  343  4e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198884  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2156  aromatic amino acid aminotransferase  38.73 
 
 		 397 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0020376  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2206  aromatic amino acid aminotransferase  38.48 
 
 		 397 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000624444  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1729  aromatic amino acid aminotransferase  41.01 
 
 		 401 aa  340  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0015695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1805  aromatic amino acid aminotransferase  39.9 
 
 		 397 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0271034  normal  0.497498 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4501  aromatic amino acid aminotransferase  38.23 
 
 		 397 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2215  aromatic amino acid aminotransferase  38.23 
 
 		 397 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00106889  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1976  aromatic amino acid aminotransferase  40.51 
 
 		 396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0279387  normal  0.804208 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2560  aromatic amino acid aminotransferase  40.51 
 
 		 396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000517501  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2650  aromatic amino acid aminotransferase  40.51 
 
 		 396 aa  336  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000706287  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3552  aromatic amino acid aminotransferase  41.16 
 
 		 398 aa  335  5.999999999999999e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.571583  normal  0.0997527 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003143  aspartate aminotransferase  39.75 
 
 		 396 aa  335  9e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3390  aromatic amino acid aminotransferase  39.95 
 
 		 397 aa  335  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1668  aromatic amino acid aminotransferase  38.48 
 
 		 397 aa  335  1e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0301688  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01890  aromatic amino acid aminotransferase  40.25 
 
 		 399 aa  335  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1497  aromatic amino acid aminotransferase  42.86 
 
 		 397 aa  334  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1635  aromatic amino acid aminotransferase  39.49 
 
 		 396 aa  328  7e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0826561  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1976  aromatic amino acid aminotransferase  38.99 
 
 		 396 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0721225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0911  aromatic amino acid aminotransferase  41.3 
 
 		 411 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1664  aromatic amino acid aminotransferase  39.75 
 
 		 396 aa  323  2e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.233263  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2055  aromatic amino acid aminotransferase  38.99 
 
 		 396 aa  320  3e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1783  aromatic amino acid aminotransferase  38.99 
 
 		 396 aa  319  7e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00163536  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3509  aromatic amino acid aminotransferase  41.6 
 
 		 389 aa  315  8e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0763  aromatic amino acid aminotransferase  41.58 
 
 		 401 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.615005  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3642  aromatic amino acid aminotransferase  40.2 
 
 		 397 aa  311  9e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.463621  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3504  aromatic amino acid aminotransferase  39.65 
 
 		 397 aa  311  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5386  aromatic amino acid aminotransferase  39.74 
 
 		 391 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.773593  normal  0.409565 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03468  aromatic amino acid aminotransferase  40.05 
 
 		 400 aa  306  6e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1504  aromatic amino acid aminotransferase  38.23 
 
 		 398 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0021  aromatic amino acid aminotransferase  39.53 
 
 		 400 aa  302  6.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000117324 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0407  aromatic amino acid aminotransferase  36.71 
 
 		 396 aa  301  1e-80  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.761548  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3787  aromatic amino acid aminotransferase  37.72 
 
 		 398 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0972413  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0702  aromatic amino acid aminotransferase  38.89 
 
 		 397 aa  300  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2738  aromatic amino acid aminotransferase  38.27 
 
 		 398 aa  300  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187643  normal  0.404838 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20090  aromatic amino acid aminotransferase  37.97 
 
 		 398 aa  301  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5384  aromatic amino acid aminotransferase  39.8 
 
 		 399 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261503  normal  0.0944664 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>