224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0412 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02451  aspartate kinase  69.21 
 
 
474 aa  707    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003602  aspartokinase associated with ectoin biosynthesis  68.79 
 
 
473 aa  701    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0412  aspartate kinase  100 
 
 
474 aa  990    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000111891  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1162  aspartate kinase  50.54 
 
 
481 aa  480  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.546114  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0149  aspartate kinase  49.57 
 
 
485 aa  473  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1029  aspartate kinase  47.18 
 
 
480 aa  457  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0959  aspartate kinase  45.82 
 
 
470 aa  455  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.209402  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0521  aspartate kinase  49.78 
 
 
507 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1192  aspartate kinase  47.52 
 
 
477 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.670085 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0554  aspartate kinase  44.96 
 
 
478 aa  409  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.56437  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2953  aspartate kinase  45.91 
 
 
480 aa  402  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.125059 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3012  aspartate kinase  44.04 
 
 
488 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.844971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3243  aspartate kinase  41.77 
 
 
460 aa  345  1e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000151227  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2045  aspartate kinase  43.6 
 
 
465 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0654189  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2001  aspartate kinase  42.52 
 
 
463 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2115  aspartate kinase  43.38 
 
 
465 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0840008  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1815  aspartate kinase  43.23 
 
 
465 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1347  aspartate kinase  40.31 
 
 
470 aa  317  3e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0442684  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0587  aspartate kinase  40.09 
 
 
466 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.525939  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0676  aspartate kinase  25.59 
 
 
468 aa  98.2  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3187  aspartate kinase  24.13 
 
 
467 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0425815  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6475  aspartate kinase  23.9 
 
 
446 aa  92  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1983  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.79 
 
 
819 aa  91.7  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0259928  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0259  aspartate kinase  28.33 
 
 
468 aa  89.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.889739  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2222  aspartate kinase  29.34 
 
 
823 aa  89.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0577  aspartate kinase  28.72 
 
 
468 aa  89  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.798745  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1642  aspartate kinase  27.18 
 
 
468 aa  87.4  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3079  aspartate kinase  25.66 
 
 
467 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244781  hitchhiker  0.00296029 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5429  aspartate kinase  24.95 
 
 
815 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.788208  normal  0.56505 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1253  aspartate kinase  22.5 
 
 
465 aa  83.2  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.312523  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0073  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  22.13 
 
 
817 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2330  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.24 
 
 
822 aa  80.1  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2703  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  23.65 
 
 
823 aa  79.7  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0346  aspartate kinase  24.18 
 
 
465 aa  79  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0087  aspartate kinase  25.32 
 
 
465 aa  77.8  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0531987  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1749  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.79 
 
 
834 aa  77.4  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4514  aspartate kinase  21.67 
 
 
818 aa  77  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3054  aspartate kinase  23.61 
 
 
465 aa  75.5  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4508  aspartate kinase  23.65 
 
 
478 aa  75.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.995886  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2542  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  23.28 
 
 
815 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.573411  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0142  aspartate kinase  24.22 
 
 
463 aa  74.7  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2575  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  24.43 
 
 
815 aa  74.7  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0401  aspartate kinase  26.51 
 
 
462 aa  74.3  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.271601 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69242  aspartate kinase (L-aspartate 4-P- transferase)  26.56 
 
 
536 aa  74.3  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0299  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  21.9 
 
 
819 aa  74.3  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0142  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  24.62 
 
 
820 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000979597  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1127  aspartate kinase  22.34 
 
 
470 aa  72.4  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.892413  hitchhiker  0.00887106 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0264  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  22.13 
 
 
819 aa  70.1  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0271796 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1754  aspartate kinase  22.36 
 
 
467 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2818  aspartate kinase III  23.94 
 
 
471 aa  68.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47956  predicted protein  22.31 
 
 
541 aa  68.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07425  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  23.28 
 
 
814 aa  68.6  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.148859  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3804  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  22.38 
 
 
815 aa  67.4  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08859  aspartate kinase, putative (Eurofung)  26.1 
 
 
525 aa  67.4  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.777655  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3152  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  21.34 
 
 
818 aa  67  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.817335  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1980  aspartate kinase  23.1 
 
 
469 aa  65.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0255525  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1940  aspartate kinase I  36.97 
 
 
408 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.604323  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2735  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  22.86 
 
 
822 aa  65.1  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.331448  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0861  aspartate kinase  22.68 
 
 
472 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0843  aspartate kinase  24.1 
 
 
468 aa  64.7  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1230  aspartate kinase  30.1 
 
 
411 aa  64.3  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3005  aspartate kinase  25.89 
 
 
469 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0222  aspartate kinase  24.15 
 
 
462 aa  64.7  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.774613  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1449  aspartate kinase, monofunctional class  26.06 
 
 
405 aa  63.9  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1271  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  22.86 
 
 
822 aa  63.5  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.279623  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3086  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  22.86 
 
 
822 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00361224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3721  aspartate kinase  23.55 
 
 
444 aa  62.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.14309  normal  0.63585 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1304  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  22.86 
 
 
822 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1227  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  22.86 
 
 
822 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248469  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2060  aspartate kinase III  22.82 
 
 
471 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.913174  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1820  aspartate kinase  24.5 
 
 
466 aa  61.6  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000320312  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2023  aspartate kinase III  27.66 
 
 
471 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1358  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.44 
 
 
835 aa  60.8  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2491  aspartate kinase III  20.21 
 
 
456 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6874  aspartate kinase  22.37 
 
 
440 aa  60.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.52096 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0541  aspartate kinase  24.2 
 
 
442 aa  60.5  0.00000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116539  hitchhiker  0.00000501097 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2333  aspartate kinase  31.2 
 
 
437 aa  59.3  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299294  normal  0.136558 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1494  aspartate kinase  24.06 
 
 
804 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2189  aspartate kinase  27.59 
 
 
446 aa  58.5  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1425  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.44 
 
 
835 aa  58.9  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2445  aspartate kinase III  22.55 
 
 
471 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.805892  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0411  aspartate kinase  28.71 
 
 
804 aa  58.9  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.204569  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1067  aspartate kinase I  35.34 
 
 
413 aa  58.2  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  normal  0.0457717 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0461  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  24.44 
 
 
868 aa  58.2  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03711  aspartate kinase III  26.17 
 
 
450 aa  58.2  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0402  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  24.24 
 
 
868 aa  57.8  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1138  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  21.65 
 
 
822 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.592327  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1209  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  21.77 
 
 
822 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00814  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.09 
 
 
835 aa  57.8  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661327  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1482  aspartate kinase III  23.2 
 
 
469 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216774  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1139  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  21.97 
 
 
822 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0421485  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1656  aspartate kinase  21.88 
 
 
878 aa  57  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3415  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  22.61 
 
 
822 aa  56.2  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02030  aspartate kinase, putative  34.21 
 
 
654 aa  56.2  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.4958  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2740  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  22.57 
 
 
825 aa  56.2  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363981  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16060  aspartate kinase  22.97 
 
 
458 aa  56.2  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  hitchhiker  0.000000275523 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22113  bifunctional aspartokinase  24.2 
 
 
870 aa  55.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0407  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  25.71 
 
 
857 aa  55.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0784  aspartate kinase  30.73 
 
 
451 aa  55.8  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3659  aspartate kinase I  36.44 
 
 
409 aa  55.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.142763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>