27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0373 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000184  putative lipase  53.37 
 
 
802 aa  793  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00112998  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0373  putative lipase  100 
 
 
796 aa  1606  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05818  extracellular lipase  36.44 
 
 
826 aa  417  1e-115  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2934  hypothetical protein  29.17 
 
 
827 aa  224  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2693  hypothetical protein  28.89 
 
 
827 aa  222  2e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  3.15404e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1673  hypothetical protein  28.96 
 
 
827 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  7.08466e-06  hitchhiker  0.00599619 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2791  hypothetical protein  28.68 
 
 
827 aa  220  7e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  7.77581e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2714  hypothetical protein  28.68 
 
 
827 aa  220  7e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.60154e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2395  hypothetical protein  28.84 
 
 
824 aa  212  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  2.2798e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1529  hypothetical protein  28.7 
 
 
828 aa  207  7e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00333125  hitchhiker  5.14631e-09 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1535  hypothetical protein  28.46 
 
 
828 aa  206  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000356269  hitchhiker  0.00903713 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1469  hypothetical protein  28.35 
 
 
827 aa  204  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  8.92624e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2120  hypothetical protein  28.63 
 
 
826 aa  204  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000487086  normal  0.788805 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1192  hypothetical protein  27.63 
 
 
866 aa  201  5e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1650  hypothetical protein  27.61 
 
 
832 aa  201  6e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  3.05835e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2408  hypothetical protein  27.5 
 
 
828 aa  197  9e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0178589  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1693  hypothetical protein  28.31 
 
 
828 aa  189  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  3.31771e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2904  hypothetical protein  27.82 
 
 
823 aa  181  3e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000289565  normal  0.061749 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2472  hypothetical protein  27.79 
 
 
839 aa  177  9e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00113127  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2182  hypothetical protein  25.65 
 
 
872 aa  168  3e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000870738  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2571  hypothetical protein  27.47 
 
 
829 aa  142  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01894  hypothetical protein  31.03 
 
 
856 aa  141  4e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.128925  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1215  MECDP-synthase  27.1 
 
 
993 aa  72.8  3e-11  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000222829  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2036  hypothetical protein  30 
 
 
939 aa  70.9  9e-11  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0890  hypothetical protein  30.6 
 
 
832 aa  63.2  2e-08  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0004283  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0034  hypothetical protein  24.1 
 
 
975 aa  52  5e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.272533  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0720  hypothetical protein  28.57 
 
 
255 aa  45.4  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>