238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0370 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  100 
 
 
217 aa  444  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  74.65 
 
 
214 aa  339  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  76.04 
 
 
213 aa  333  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  56.68 
 
 
210 aa  238  6.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  54.21 
 
 
215 aa  236  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  53.95 
 
 
210 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1414  outer membrane protein W  52.78 
 
 
212 aa  234  6e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0785515  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01230  outer membrane protein W  52.78 
 
 
212 aa  233  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2392  OmpW family protein  52.78 
 
 
212 aa  233  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01240  hypothetical protein  52.78 
 
 
212 aa  233  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1365  outer membrane protein W  52.78 
 
 
212 aa  233  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200008  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1743  outer membrane protein W  52.78 
 
 
212 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000820415  hitchhiker  0.000840764 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1425  outer membrane protein W  52.78 
 
 
212 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0528971  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2371  outer membrane protein W  52.78 
 
 
212 aa  233  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.535822  hitchhiker  0.00000160145 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2283  outer membrane protein W  50.69 
 
 
211 aa  233  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1876  outer membrane protein W  52.31 
 
 
212 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000262717 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2775  outer membrane protein W  54.21 
 
 
218 aa  232  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00794049  decreased coverage  0.0000209029 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  54.21 
 
 
214 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  55.34 
 
 
210 aa  231  6e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  52.34 
 
 
215 aa  229  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  53 
 
 
210 aa  227  8e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2589  outer membrane protein W  55.33 
 
 
214 aa  226  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000746821  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  53.27 
 
 
215 aa  226  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  53.27 
 
 
215 aa  226  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  53.18 
 
 
223 aa  226  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  50.68 
 
 
215 aa  224  6e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  52.29 
 
 
214 aa  224  7e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  52.51 
 
 
213 aa  224  8e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  54.13 
 
 
213 aa  223  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1864  outer membrane protein W  49.77 
 
 
212 aa  221  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.904155 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1859  outer membrane protein W  49.77 
 
 
212 aa  221  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1596  outer membrane protein W  49.77 
 
 
212 aa  221  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.597068 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1922  outer membrane protein W  49.77 
 
 
212 aa  221  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0854242  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1414  outer membrane protein W  49.31 
 
 
212 aa  221  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.157023  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  47.93 
 
 
211 aa  220  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  47.47 
 
 
211 aa  219  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  47.47 
 
 
211 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1334  outer membrane protein W  47.49 
 
 
215 aa  216  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2861  outer membrane protein W  50.93 
 
 
214 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00340553  unclonable  0.0000000000012731 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  50.68 
 
 
215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  48.6 
 
 
214 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1485  outer membrane protein W  48.6 
 
 
214 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0850248  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1236  OmpW family protein  47.44 
 
 
203 aa  202  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  45.5 
 
 
224 aa  201  6e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  44.74 
 
 
228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1035  outer membrane protein OprG precursor  44.2 
 
 
232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11270  outer membrane protein OprG precursor  44.2 
 
 
232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0679  outer membrane protein OmpW  48.31 
 
 
228 aa  190  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  47.62 
 
 
218 aa  186  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1265  outer membrane protein precursor  47.3 
 
 
209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000128049  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0549  OmpW family protein  46.6 
 
 
227 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.742148 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0504  OmpW family protein  46.57 
 
 
227 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00488825  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0539  OmpW family protein  45.59 
 
 
227 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.870065 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0030  OmpW  46.38 
 
 
227 aa  176  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0557  OmpW family protein  46.08 
 
 
227 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.443014 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06590  OmpW family outer membrane porin  41.59 
 
 
224 aa  171  6.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5029  OmpW  44.08 
 
 
232 aa  170  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0700  OmpW family protein  43.38 
 
 
202 aa  169  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.496076  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3824  OmpW family protein  44.39 
 
 
237 aa  169  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06610  OmpW family outer membrane porin  41.89 
 
 
226 aa  168  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3873  OmpW family protein  44.66 
 
 
227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.627912 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0029  OmpW family outer membrane protein  39.17 
 
 
237 aa  155  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  42.79 
 
 
216 aa  156  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1299  OmpW family protein  43.54 
 
 
202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0529248  normal  0.202577 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0238  OmpW  38.43 
 
 
209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  40.18 
 
 
217 aa  146  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2507  outer membrane protein  39.38 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1169  OmpW family protein  39.38 
 
 
201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122792  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2012  OmpW family protein  38.86 
 
 
200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4566  OmpW family protein  33.98 
 
 
230 aa  121  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  32.88 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0194  OmpW  37.09 
 
 
227 aa  119  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  36.73 
 
 
206 aa  119  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  37.16 
 
 
204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0979  OmpW family protein  36.54 
 
 
223 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3220  OmpW family protein  36.36 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185502  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  35.32 
 
 
219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035393  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  32.64 
 
 
241 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1823  OmpW family protein  34.31 
 
 
209 aa  112  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219711  hitchhiker  0.000000160297 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  34.55 
 
 
195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  34.55 
 
 
195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3636  OmpW family protein  35.8 
 
 
211 aa  108  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.779637  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3593  OmpW family protein  30.86 
 
 
241 aa  108  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192087  hitchhiker  0.00000065316 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0363  OmpW family outer membrane porin  30.29 
 
 
241 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  34.72 
 
 
239 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3286  OmpW family protein  30.5 
 
 
224 aa  106  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208435  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  34.26 
 
 
239 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1968  OmpW family protein  33.49 
 
 
228 aa  105  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0734  OmpW  35.62 
 
 
200 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1326  OmpW family outer membrane protein  34.2 
 
 
209 aa  103  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0285584  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  33.64 
 
 
216 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3800  outer membrane protein  35.08 
 
 
233 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  33.19 
 
 
241 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5886  OmpW family outer membrane protein  32.39 
 
 
245 aa  99  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1052  OmpW  34.9 
 
 
211 aa  98.2  8e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0777  OmpW family protein  34.39 
 
 
267 aa  96.7  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.262846 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0946  putative outer membrane protein precursor of unknown function  31.76 
 
 
243 aa  95.5  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2313  OmpW family protein  31.28 
 
 
222 aa  95.5  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742705  normal  0.203031 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1946  OmpW family outer membrane porin  30.63 
 
 
218 aa  95.1  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000112582  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2790  OmpW family protein  30.54 
 
 
240 aa  94.7  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>