More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0339 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2625  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  66.23 
 
 		 483 aa  637    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02427  6-phosphogluconate dehydrogenase  92.12 
 
 		 482 aa  922    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0339  6-phosphogluconate dehydrogenase  100 
 
 		 482 aa  994    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00114124  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1215  6-phosphogluconate dehydrogenase  64.03 
 
 		 482 aa  659    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000332109  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003325  6-phosphogluconate dehydrogenase decarboxylating  93.78 
 
 		 482 aa  937    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0635  6-phosphogluconate dehydrogenase  69.1 
 
 		 484 aa  672    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4083  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  63.6 
 
 		 484 aa  642    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642645  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2404  6-phosphogluconate dehydrogenase  65.55 
 
 		 484 aa  673    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2110  6-phosphogluconate dehydrogenase  67.08 
 
 		 489 aa  687    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1654  6-phosphogluconate dehydrogenase  80.25 
 
 		 484 aa  795    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0057587  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0685  6-phosphogluconate dehydrogenase  88.36 
 
 		 482 aa  894    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2752  6-phosphogluconate dehydrogenase  75.26 
 
 		 482 aa  773    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0340  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  59.92 
 
 		 485 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.101232  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03954  hypothetical protein similar to 6-phosphogluconate dehydrogenase (Eurofung)  60.21 
 
 		 490 aa  582  1.0000000000000001e-165  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0543109 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2297  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  59.71 
 
 		 490 aa  582  1.0000000000000001e-165  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.799207  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69500  6-phosphogluconate dehydrogenase  60.66 
 
 		 508 aa  578  1e-164  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.239936  normal  0.16474 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01050  phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating), putative  59.05 
 
 		 491 aa  568  1e-161  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2279  6-phosphogluconate dehydrogenase  59.7 
 
 		 471 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000283239  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0326  6-phosphogluconate dehydrogenase  59.7 
 
 		 469 aa  558  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1061  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  55.65 
 
 		 477 aa  545  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.142467  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0925  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.85 
 
 		 480 aa  529  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0631  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.48 
 
 		 471 aa  530  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3177  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.8 
 
 		 469 aa  525  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.635161 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0420  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.05 
 
 		 471 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0828  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.05 
 
 		 471 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.742561  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0469  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.05 
 
 		 471 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2376  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.05 
 
 		 471 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2515  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.05 
 
 		 471 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.864381  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1798  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.05 
 
 		 471 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1601  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.13 
 
 		 468 aa  522  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0758  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.37 
 
 		 501 aa  521  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1569  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.13 
 
 		 468 aa  522  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2436  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.8 
 
 		 469 aa  524  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2535  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.8 
 
 		 469 aa  524  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0208  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.36 
 
 		 469 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0166  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.36 
 
 		 469 aa  520  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0159  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.36 
 
 		 469 aa  520  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0157  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.36 
 
 		 469 aa  520  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2847  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.58 
 
 		 468 aa  520  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2181  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.93 
 
 		 470 aa  518  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.296225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0186  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.36 
 
 		 469 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0164  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.36 
 
 		 469 aa  520  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4715  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.99 
 
 		 469 aa  519  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.246176  decreased coverage  0.00597476 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1628  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  54.49 
 
 		 468 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00766748  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1202  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.7 
 
 		 468 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.141646  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3620  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.72 
 
 		 470 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2962  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.49 
 
 		 468 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4459  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.72 
 
 		 470 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3285  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.3 
 
 		 470 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3907  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.72 
 
 		 470 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01931  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.49 
 
 		 468 aa  514  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2320  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.49 
 
 		 468 aa  513  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2183  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.06 
 
 		 468 aa  513  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000119365  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4676  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.87 
 
 		 470 aa  513  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0753605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1031  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.27 
 
 		 468 aa  513  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01917  hypothetical protein  54.49 
 
 		 468 aa  514  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2210  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.93 
 
 		 469 aa  514  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.828318  normal  0.666462 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1204  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.37 
 
 		 468 aa  513  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1694  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  54.7 
 
 		 474 aa  514  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1320  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.16 
 
 		 468 aa  514  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0119731  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0642  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.94 
 
 		 472 aa  514  1e-144  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000463294  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1613  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.27 
 
 		 468 aa  513  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3801  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.08 
 
 		 470 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.835565 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1608  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.94 
 
 		 468 aa  511  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.222702 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2642  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.85 
 
 		 468 aa  508  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0333  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.49 
 
 		 479 aa  508  9.999999999999999e-143  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2307  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.85 
 
 		 468 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97354  hitchhiker  0.00484467 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5973  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.56 
 
 		 469 aa  502  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.91163  normal  0.882355 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2206  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.85 
 
 		 468 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.553067  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2260  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.85 
 
 		 468 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00724007 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2309  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.85 
 
 		 468 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00877145 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2420  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.85 
 
 		 468 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.511918  hitchhiker  0.0040278 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3014  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.09 
 
 		 468 aa  504  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000146076  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16410  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  51.06 
 
 		 479 aa  494  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1834  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.29 
 
 		 473 aa  491  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0892  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  50.21 
 
 		 477 aa  491  1e-137  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.305911  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1582  6-phosphogluconate dehydrogenase  50.85 
 
 		 482 aa  488  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0292783 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2839  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.61 
 
 		 486 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2069  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.91 
 
 		 479 aa  486  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.531978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3297  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.27 
 
 		 475 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2599  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.83 
 
 		 523 aa  486  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2812  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.61 
 
 		 486 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0746874  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2856  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.61 
 
 		 486 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.904014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1729  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  50.85 
 
 		 484 aa  483  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.235564  normal  0.119479 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11872  6-phosphogluconate dehydrogenase  50.64 
 
 		 483 aa  484  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000287104  normal  0.308881 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2765  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.78 
 
 		 468 aa  484  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5683  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  51.18 
 
 		 479 aa  484  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.696376  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2810  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.78 
 
 		 468 aa  484  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1766  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.37 
 
 		 478 aa  483  1e-135  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000232976  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1889  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  51.28 
 
 		 483 aa  484  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0324159  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3359  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.82 
 
 		 484 aa  483  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal  0.983915 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1071  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.58 
 
 		 468 aa  480  1e-134  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3598  6-phosphogluconate dehydrogenase  49.79 
 
 		 486 aa  478  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2309  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.17 
 
 		 473 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.627768 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0833  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  49.17 
 
 		 490 aa  479  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2258  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.17 
 
 		 473 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0571  6-phosphogluconate dehydrogenase  48.17 
 
 		 464 aa  476  1e-133  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3089  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.17 
 
 		 489 aa  476  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.609606 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0039  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.03 
 
 		 471 aa  474  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.554725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2449  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  49.47 
 
 		 478 aa  470  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>