More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0294 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0294  maltose ABC transporter periplasmic protein  100 
 
 		 406 aa  822    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.491527  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001328  maltose/maltodextrin ABC transporter substrate binding periplasmic protein MalE  92.03 
 
 		 392 aa  735    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05214  maltose ABC transporter periplasmic protein  89.7 
 
 		 416 aa  732    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4421  maltose ABC transporter periplasmic protein  66.67 
 
 		 396 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100315 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4572  maltose ABC transporter periplasmic protein  66.67 
 
 		 396 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0168981 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4571  maltose ABC transporter periplasmic protein  66.67 
 
 		 396 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.552535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4623  maltose ABC transporter periplasmic protein  66.67 
 
 		 396 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.108824 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4486  maltose ABC transporter periplasmic protein  66.67 
 
 		 396 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03906  maltose ABC transporter periplasmic protein  65.66 
 
 		 396 aa  550  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3962  extracellular solute-binding protein family 1  65.66 
 
 		 396 aa  550  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0378  maltose ABC transporter periplasmic protein  67.1 
 
 		 403 aa  550  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4274  maltose ABC transporter periplasmic protein  65.66 
 
 		 396 aa  550  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03866  hypothetical protein  65.66 
 
 		 396 aa  550  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4586  maltose ABC transporter periplasmic protein  65.66 
 
 		 396 aa  550  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3995  maltose ABC transporter periplasmic protein  65.4 
 
 		 396 aa  548  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0495972  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5515  maltose ABC transporter periplasmic protein  65.66 
 
 		 396 aa  550  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.241432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3914  maltose ABC transporter periplasmic protein  67.1 
 
 		 403 aa  550  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0306  maltose ABC transporter periplasmic protein  67.1 
 
 		 403 aa  550  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000110695  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4496  maltose ABC transporter periplasmic protein  65.66 
 
 		 396 aa  550  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4472  maltose ABC transporter periplasmic protein  64.99 
 
 		 397 aa  546  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0238  maltose ABC transporter periplasmic protein  65.91 
 
 		 396 aa  545  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.941451 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3132  maltose ABC transporter periplasmic protein  55.47 
 
 		 395 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559599  normal  0.0111617 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5151  extracellular solute-binding protein family 1  45.48 
 
 		 400 aa  358  8e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.385349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  34.75 
 
 		 397 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  33.88 
 
 		 391 aa  208  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  33.88 
 
 		 391 aa  206  5e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  33.96 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  33.96 
 
 		 392 aa  203  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1262  extracellular solute-binding protein  32.02 
 
 		 408 aa  202  8e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0854  extracellular solute-binding protein family 1  31.99 
 
 		 398 aa  189  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.124504  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1321  extracellular solute-binding protein family 1  30.6 
 
 		 410 aa  182  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1438  extracellular solute-binding protein  33.42 
 
 		 400 aa  183  6e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000172655  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2958  extracellular solute-binding protein family 1  30.1 
 
 		 410 aa  179  8e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.347864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1120  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  31.33 
 
 		 419 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000383609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1500  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 393 aa  169  6e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  31.27 
 
 		 413 aa  169  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16190  extracellular solute-binding protein family 1  30 
 
 		 401 aa  169  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5891  extracellular solute-binding protein family 1  32.01 
 
 		 402 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.403986 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03790  maltose-binding periplasmic protein  32.8 
 
 		 467 aa  166  5.9999999999999996e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0386362 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4064  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein, putative  32.21 
 
 		 419 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0421403  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3754  maltose-maltodextrin ABC-related solute binding protein  31.49 
 
 		 419 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000542287  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3770  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  31.97 
 
 		 419 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000087749  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  29.56 
 
 		 390 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3922  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  31.97 
 
 		 419 aa  163  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0134813  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4138  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  31.49 
 
 		 419 aa  163  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00348898  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4229  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  31.97 
 
 		 419 aa  163  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4032  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  31.97 
 
 		 419 aa  163  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 		 395 aa  162  9e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2714  extracellular solute-binding protein  31.81 
 
 		 419 aa  162  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182746  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0199  extracellular solute-binding protein  31.71 
 
 		 423 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.136897  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0205  extracellular solute-binding protein  31.71 
 
 		 423 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4119  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  31.01 
 
 		 419 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000674051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0940  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.65 
 
 		 409 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3841  extracellular solute-binding protein  31.49 
 
 		 419 aa  159  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000013033  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3883  maltose/maltodextrin ABC transporter periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  31.54 
 
 		 411 aa  156  6e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.265603 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0914  maltose/maltodextrin ABC transporter, periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  30.99 
 
 		 411 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.459005  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2652  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  31.65 
 
 		 408 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0968  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 		 411 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155665  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2574  extracellular solute-binding protein family 1  29.85 
 
 		 401 aa  153  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000602333  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  30.19 
 
 		 397 aa  151  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3325  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  30.77 
 
 		 422 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0832  multiple sugar transport system substrate-binding protein  28.29 
 
 		 416 aa  150  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.669088  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  28.96 
 
 		 424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  32.08 
 
 		 415 aa  146  5e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1118  extracellular solute-binding protein family 1  29.29 
 
 		 400 aa  146  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2338  maltose-binding periplasmic protein precursor  30.89 
 
 		 408 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5856  extracellular solute-binding protein family 1  30.56 
 
 		 450 aa  143  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.399636 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2873  extracellular solute-binding protein family 1  29.72 
 
 		 425 aa  142  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22450  maltose-binding periplasmic protein  29.36 
 
 		 439 aa  139  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.326435  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0744  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 		 432 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0587531  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0701  extracellular solute-binding protein family 1  27.4 
 
 		 432 aa  135  9e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1276  extracellular solute-binding protein family 1  28.68 
 
 		 417 aa  135  9e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000485827  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 		 406 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2162  extracellular solute-binding protein family 1  28.07 
 
 		 415 aa  134  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.183799  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0694  extracellular solute-binding protein family 1  26.48 
 
 		 415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.333505 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 		 440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12290  maltose-binding periplasmic protein  28.77 
 
 		 422 aa  130  5.0000000000000004e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0134652  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3077  extracellular solute-binding protein family 1  27.7 
 
 		 417 aa  129  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1527  extracellular solute-binding protein family 1  26.94 
 
 		 412 aa  129  9.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2135  maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein MalE  29.48 
 
 		 410 aa  127  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4686  extracellular solute-binding protein family 1  28.9 
 
 		 444 aa  126  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.749978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13860  maltose-binding periplasmic protein  26.88 
 
 		 412 aa  126  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2152  extracellular solute-binding protein family 1  27.1 
 
 		 415 aa  123  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.410183  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0632  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 		 434 aa  121  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.708501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4136  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  29.57 
 
 		 400 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1485  extracellular solute-binding protein family 1  27.02 
 
 		 424 aa  119  7.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4267  extracellular solute-binding protein family 1  29.36 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0206  extracellular solute-binding protein family 1  27.79 
 
 		 433 aa  114  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4289  extracellular solute-binding protein family 1  28.44 
 
 		 400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1865  extracellular solute-binding protein  27.93 
 
 		 454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1617  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 460 aa  110  6e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0986  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.265801 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 		 418 aa  107  4e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3696  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 		 546 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.772784  normal  0.201816 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1151  extracellular solute-binding protein family 1  25.16 
 
 		 400 aa  106  8e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2174  extracellular solute-binding protein family 1  24.12 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.128166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2649  extracellular solute-binding protein family 1  26.97 
 
 		 400 aa  101  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1781  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 		 413 aa  95.5  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1853  maltose ABC transporter substrate binding protein  27.27 
 
 		 409 aa  92.8  9e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225735  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04140  maltose-binding periplasmic protein  23.72 
 
 		 449 aa  91.7  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>