260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0235 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  100 
 
 
239 aa  468  1e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1188  putative branched-chain amino acid transport protein  74.11 
 
 
237 aa  337  1e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06280  hypothetical protein  70.71 
 
 
247 aa  325  3e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001440  AzlC family protein  70.67 
 
 
236 aa  323  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  59.91 
 
 
273 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  58.72 
 
 
273 aa  267  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  58.99 
 
 
285 aa  267  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  59.91 
 
 
293 aa  267  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  58.99 
 
 
273 aa  267  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  56.36 
 
 
255 aa  266  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  57.46 
 
 
255 aa  266  3e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  56.16 
 
 
238 aa  258  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  54.43 
 
 
286 aa  259  4e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  60.78 
 
 
231 aa  252  4e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  60.59 
 
 
230 aa  248  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  53.54 
 
 
245 aa  239  4e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  51.77 
 
 
252 aa  229  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3248  hypothetical protein  51.33 
 
 
247 aa  227  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351031  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3299  AzlC-like  50.65 
 
 
232 aa  216  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1991  AzlC family protein  52.04 
 
 
230 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.823633  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3310  AzlC family protein  52.04 
 
 
230 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294738  normal  0.172837 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2385  AzlC family protein  52.04 
 
 
230 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1897  AzlC family protein  51.98 
 
 
233 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  46.82 
 
 
244 aa  195  6e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  46.82 
 
 
244 aa  194  8e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2854  putative branched-chain amino acid transport protein AzlC  43.36 
 
 
242 aa  192  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.608526  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2443  branched-chain amino acid exporter, LIV- E family  45.45 
 
 
246 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1356  AzlC family protein  43.53 
 
 
246 aa  186  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  41.67 
 
 
258 aa  145  7e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  34.07 
 
 
250 aa  137  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  35.65 
 
 
244 aa  135  7e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  35.87 
 
 
249 aa  120  2e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  33.33 
 
 
253 aa  118  8e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  37.04 
 
 
255 aa  117  2e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  31.8 
 
 
292 aa  117  2e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  31.02 
 
 
265 aa  115  8e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  34.69 
 
 
255 aa  114  1e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  5.58659e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  31.05 
 
 
246 aa  114  1e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  31.65 
 
 
280 aa  114  2e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  31.65 
 
 
255 aa  113  2e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  2.3066e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  36.78 
 
 
257 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  1.53015e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  36.78 
 
 
257 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  30.29 
 
 
257 aa  112  7e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  35.16 
 
 
250 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  32.41 
 
 
228 aa  110  2e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  33.91 
 
 
242 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  32.47 
 
 
253 aa  108  7e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  31.98 
 
 
244 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  31.46 
 
 
228 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  34.95 
 
 
247 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  33.04 
 
 
242 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  32.97 
 
 
242 aa  106  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  33.33 
 
 
241 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  33.85 
 
 
241 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  33.85 
 
 
241 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  33.85 
 
 
241 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  33.85 
 
 
241 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  31.19 
 
 
234 aa  103  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  33.33 
 
 
241 aa  102  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  32.82 
 
 
241 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  29.96 
 
 
240 aa  102  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  32.31 
 
 
241 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  32.31 
 
 
241 aa  101  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  32.09 
 
 
247 aa  101  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  31.86 
 
 
242 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2851  AzlC-like protein  36.52 
 
 
243 aa  99  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1955  AzlC-like protein  32.95 
 
 
242 aa  97.1  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.552602  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  29.94 
 
 
233 aa  95.9  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  31.72 
 
 
233 aa  93.6  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  33.15 
 
 
242 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  27.96 
 
 
229 aa  92.4  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  33.16 
 
 
240 aa  92.4  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1603  AzlC family protein  29.44 
 
 
238 aa  92  8e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315939  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  28.96 
 
 
233 aa  90.9  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  28.25 
 
 
235 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  28.25 
 
 
235 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  31.42 
 
 
234 aa  90.9  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  28.7 
 
 
235 aa  89.7  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1025  AzlC family protein  29.44 
 
 
238 aa  89.7  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0979622  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0661  AzlC family protein  28.97 
 
 
239 aa  89  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0710886  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1477  AzlC family protein  32.76 
 
 
238 aa  88.6  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  28.63 
 
 
242 aa  87.4  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  28.87 
 
 
244 aa  87.4  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01830  AzlC family protein  32.57 
 
 
236 aa  87.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.79674  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0311  AzlC family protein  27.92 
 
 
238 aa  87.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  30.91 
 
 
241 aa  87.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0768  AzlC family protein  28.97 
 
 
234 aa  86.7  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.390341  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1048  AzlC family protein  35.67 
 
 
239 aa  85.9  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0563  AzlC-like  28.88 
 
 
276 aa  84.3  1e-15  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973282  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1274  AzlC family protein  29.89 
 
 
241 aa  84.3  2e-15  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  29.85 
 
 
240 aa  84  2e-15  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0732  AzlC family protein  34.76 
 
 
217 aa  83.6  2e-15  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100734  normal  0.28736 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  26.36 
 
 
240 aa  83.2  3e-15  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  28.74 
 
 
238 aa  83.2  3e-15  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0944  AzlC family protein  28.49 
 
 
235 aa  83.2  3e-15  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.77629e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  29.31 
 
 
258 aa  80.5  2e-14  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2058  AzlC family protein  29.65 
 
 
238 aa  80.1  3e-14  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3946  AzlC family protein  28.37 
 
 
246 aa  79.7  3e-14  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3535  AzlC family protein  26.46 
 
 
234 aa  80.1  3e-14  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.485711  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3724  AzlC family protein  30.43 
 
 
235 aa  79.7  4e-14  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>