186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0216 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0216  glucosamine-6-phosphate deaminase  100 
 
 
266 aa  555  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000962  glucosamine-6-phosphate deaminase  91.35 
 
 
266 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000448819  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07002  glucosamine-6-phosphate deaminase  90.23 
 
 
266 aa  513  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2812  glucosamine-6-phosphate deaminase  84.79 
 
 
266 aa  479  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0731  glucosamine-6-phosphate deaminase  80.83 
 
 
266 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.611373  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0839  glucosamine-6-phosphate deaminase  80.83 
 
 
266 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0790  glucosamine-6-phosphate deaminase  80.83 
 
 
266 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0803  glucosamine-6-phosphate deaminase  80.83 
 
 
266 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0743  glucosamine-6-phosphate deaminase  80.83 
 
 
266 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.248454 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1193  glucosamine-6-phosphate deaminase  80.45 
 
 
266 aa  462  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455857  decreased coverage  0.0000186217 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00635  glucosamine-6-phosphate deaminase  79.32 
 
 
266 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69394  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2959  glucosamine-6-phosphate isomerase  79.32 
 
 
266 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.485164  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0769  glucosamine-6-phosphate deaminase  79.32 
 
 
266 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0136799  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00626  hypothetical protein  79.32 
 
 
266 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.60182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0722  glucosamine-6-phosphate deaminase  79.32 
 
 
266 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.372156  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0703  glucosamine-6-phosphate deaminase  79.32 
 
 
266 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00284745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2978  glucosamine-6-phosphate deaminase  79.32 
 
 
266 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0698  glucosamine-6-phosphate deaminase  79.32 
 
 
266 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0261175  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0573  glucosamine-6-phosphate deaminase  79.32 
 
 
266 aa  459  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1114  glucosamine-6-phosphate deaminase  80.61 
 
 
266 aa  456  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.646109  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1027  glucosamine-6-phosphate deaminase  80.99 
 
 
268 aa  456  1e-127  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1227  glucosamine-6-phosphate deaminase  80.23 
 
 
266 aa  452  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.207086  normal  0.0742829 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2909  glucosamine-6-phosphate deaminase  79.09 
 
 
266 aa  448  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.614639  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2942  glucosamine-6-phosphate deaminase  79.09 
 
 
266 aa  447  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0338  glucosamine-6-phosphate deaminase  79.09 
 
 
266 aa  448  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0368594  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2997  glucosamine-6-phosphate deaminase  79.09 
 
 
266 aa  448  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1203  glucosamine-6-phosphate deaminase  77.95 
 
 
266 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3128  glucosamine-6-phosphate deaminase  75.67 
 
 
266 aa  434  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0490  glucosamine-6-phosphate deaminase  71.48 
 
 
266 aa  398  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.532501 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1208  glucosamine-6-phosphate isomerase  62.74 
 
 
277 aa  361  7.0000000000000005e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0337  glucosamine-6-phosphate deaminase  63.12 
 
 
270 aa  359  3e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2135  glucosamine-6-phosphate isomerase  63.5 
 
 
276 aa  356  1.9999999999999998e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000621697  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0150  glucosamine-6-phosphate deaminase  62.6 
 
 
268 aa  347  8e-95  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0803  glucosamine-6-phosphate deaminase  60.08 
 
 
263 aa  344  8e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01418  glucosamine-6-phosphate deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G00480)  57.14 
 
 
358 aa  332  4e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.313025  normal  0.0950866 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01050  Glucosamine-6-phosphate isomerase, putative  55.77 
 
 
339 aa  308  5e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1348  glucosamine-6-phosphate isomerase  51.74 
 
 
261 aa  256  3e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000459802 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62706  Glucosamine-6-phosphate isomerase (Glucosamine-6-phosphate deaminase) (GNPDA) (GlcN6P deaminase)  48.76 
 
 
252 aa  245  4.9999999999999997e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0943  glucosamine-6-phosphate isomerase  43.89 
 
 
264 aa  223  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0718256  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0760  glucosamine-6-phosphate isomerase  43.89 
 
 
263 aa  219  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0815  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.59 
 
 
268 aa  218  6e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1219  glucosamine-6-phosphate isomerase  48.11 
 
 
256 aa  218  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2077  glucosamine-6-phosphate isomerase  47.42 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1652  glucosamine-6-phosphate isomerase  43.4 
 
 
266 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0766585  normal  0.955714 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0844  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.75 
 
 
262 aa  209  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0960  glucosamine-6-phosphate deaminase  42.8 
 
 
261 aa  209  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160778  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0631  glucosamine-6-phosphate isomerase  48.39 
 
 
259 aa  209  5e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676761  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0236  glucosamine-6-phosphate isomerase  41.91 
 
 
250 aa  205  7e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4131  hypothetical protein  44.83 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.311207  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1961  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.83 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1521  glucosamine-6-phosphate isomerase  43.55 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2749  glucosamine-6-phosphate deaminase  45.33 
 
 
261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2744  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.13 
 
 
242 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2590  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.96 
 
 
260 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1433  glucosamine-6-phosphate deaminase  43.98 
 
 
253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.111516  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1049  glucosamine-6-phosphate isomerase  40.49 
 
 
260 aa  196  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2431  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.73 
 
 
242 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3512  glucosamine-6-phosphate isomerase  40.08 
 
 
268 aa  194  9e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1008  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.57 
 
 
268 aa  192  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0823298  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00670  glucosamine-6-phosphate isomerase  39.36 
 
 
260 aa  192  6e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.898664  normal  0.115582 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1006  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  42.57 
 
 
655 aa  190  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156439 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2216  glucosamine-6-phosphate isomerase  40.66 
 
 
251 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22920  glucosamine-6-phosphate isomerase  44.17 
 
 
241 aa  188  9e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0237  glucosamine-6-phosphate isomerase  43.36 
 
 
260 aa  187  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2791  glucosamine-6-phosphate isomerase  39.76 
 
 
642 aa  186  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0405  glucosamine-6-phosphate isomerase  40.83 
 
 
253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1822  glucosamine-6-phosphate isomerase  47.6 
 
 
303 aa  182  4.0000000000000006e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000307533  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1731  glucosamine-6-phosphate isomerase  41.85 
 
 
245 aa  180  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.598204  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3582  glucosamine-6-phosphate isomerase  40.36 
 
 
236 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000420118  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0209  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.26 
 
 
270 aa  178  1e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.147948  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2322  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.56 
 
 
259 aa  177  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116436 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13500  glucosamine-6-phosphate isomerase  38.08 
 
 
265 aa  175  8e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0485171  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4483  glucosamine-6-phosphate isomerase  40.78 
 
 
261 aa  174  9e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.543122  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2021  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  39.15 
 
 
647 aa  174  9.999999999999999e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4557  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  36.57 
 
 
670 aa  173  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.296514  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06760  glucosamine-6-phosphate isomerase  39.57 
 
 
249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000583825  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4812  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  36.98 
 
 
642 aa  172  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.116561  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1660  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  39.75 
 
 
637 aa  172  6.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0749  glucosamine-6-phosphate isomerase  38.46 
 
 
242 aa  171  1e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2155  glucosamine-6-phosphate isomerase  37.92 
 
 
242 aa  171  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.998917 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3813  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  40.54 
 
 
646 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5415  glucosamine-6-phosphate isomerase  39.48 
 
 
657 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2029  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  37.25 
 
 
637 aa  166  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.458898  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6570  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  38.21 
 
 
641 aa  165  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220945  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1508  glucosamine-6-phosphate isomerase  39.44 
 
 
252 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4142  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  40.87 
 
 
639 aa  157  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.513919 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0167  glucosamine-6-phosphate isomerase  36.1 
 
 
244 aa  157  1e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0765559  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2772  glucosamine-6-phosphate isomerase  34.82 
 
 
246 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0644  glucosamine-6-phosphate isomerase  40 
 
 
236 aa  156  3e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1656  glucosamine-6-phosphate isomerase  35.12 
 
 
240 aa  156  4e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0180  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  38.57 
 
 
262 aa  155  9e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1549  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.15 
 
 
271 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000670802  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2381  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  35.39 
 
 
642 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3702  glucosamine-6-phosphate isomerase  36.05 
 
 
247 aa  149  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355712  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0128  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.89 
 
 
255 aa  149  5e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0498  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  33.46 
 
 
654 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4074  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.27 
 
 
262 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843542 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4121  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.27 
 
 
262 aa  145  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.850292  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3964  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.27 
 
 
262 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4273  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.27 
 
 
262 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>