More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0198 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0198  tagE protein  100 
 
 
313 aa  634    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1891  peptidase M23B  64.82 
 
 
314 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  59.05 
 
 
317 aa  372  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  57.14 
 
 
317 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1544  peptidase M23B  44.74 
 
 
336 aa  248  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.216338  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0367  tagE protein  43.69 
 
 
302 aa  243  5e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  38.77 
 
 
337 aa  222  4.9999999999999996e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00995  hypothetical protein  37.07 
 
 
333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1568  peptidase M23B  37.58 
 
 
317 aa  212  7e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  36.05 
 
 
333 aa  211  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  39.26 
 
 
299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  34.19 
 
 
319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1041  peptidase, M23/M37 family  34.35 
 
 
302 aa  186  6e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.432604  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0735  M24/M37 family peptidase  35.25 
 
 
296 aa  182  6e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0510667  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  36.18 
 
 
316 aa  182  7e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  33.97 
 
 
300 aa  175  9e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1105  M24/M37 family peptidase  33.65 
 
 
300 aa  172  5.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  34.63 
 
 
293 aa  169  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1995  peptidase M23B  32.47 
 
 
309 aa  166  4e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0470  M24/M37 family peptidase  35.09 
 
 
268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  42.86 
 
 
262 aa  143  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  48.09 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  45.39 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  39.08 
 
 
233 aa  124  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  45.52 
 
 
323 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  47.97 
 
 
569 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  41.62 
 
 
321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  34.75 
 
 
414 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  37.23 
 
 
325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1077  Peptidase M23  50.86 
 
 
507 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.391765  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  44.53 
 
 
238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  44.09 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  45.3 
 
 
312 aa  114  3e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  32.92 
 
 
399 aa  113  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  40.58 
 
 
442 aa  112  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  44.54 
 
 
527 aa  112  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  43.17 
 
 
443 aa  112  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  32.51 
 
 
399 aa  112  9e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  42.64 
 
 
442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1036  metalloprotease  46.55 
 
 
458 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193125  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  40.82 
 
 
324 aa  110  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  39.29 
 
 
490 aa  110  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  42.75 
 
 
321 aa  109  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  44.7 
 
 
305 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  44.7 
 
 
305 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  44.7 
 
 
305 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  32.74 
 
 
300 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  47.01 
 
 
533 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  40.74 
 
 
305 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  41.18 
 
 
343 aa  107  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  33.65 
 
 
330 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  40.88 
 
 
445 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  40.98 
 
 
441 aa  107  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  42.28 
 
 
464 aa  106  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  35.98 
 
 
288 aa  106  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  44.63 
 
 
491 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  38.46 
 
 
223 aa  105  8e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  31.9 
 
 
301 aa  105  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2416  hypothetical protein  32.58 
 
 
410 aa  105  9e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000144361  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0251  M23 peptidase domain protein  33.86 
 
 
341 aa  105  9e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2026  hypothetical protein  32.87 
 
 
438 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148125  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  39.73 
 
 
229 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  30.34 
 
 
316 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  36.69 
 
 
433 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  40.62 
 
 
328 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  33.58 
 
 
323 aa  104  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2139  hypothetical protein  32.87 
 
 
438 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000192356  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  37.34 
 
 
387 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  41.22 
 
 
247 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  43.86 
 
 
430 aa  103  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  42.11 
 
 
524 aa  103  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  36.97 
 
 
274 aa  103  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06306  peptidase  44.83 
 
 
439 aa  103  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  46.96 
 
 
419 aa  103  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  32.58 
 
 
439 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  32.58 
 
 
439 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  32.58 
 
 
439 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2044  hypothetical protein  32.58 
 
 
439 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.713076  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  38.93 
 
 
308 aa  103  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  42.97 
 
 
541 aa  103  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  41.32 
 
 
412 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  32.58 
 
 
439 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  34.34 
 
 
430 aa  103  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  30.34 
 
 
290 aa  102  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  38.06 
 
 
440 aa  102  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  41.32 
 
 
420 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  39.68 
 
 
310 aa  103  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  38.55 
 
 
309 aa  102  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  30.66 
 
 
313 aa  102  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  42.15 
 
 
464 aa  102  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  41.32 
 
 
421 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  41.32 
 
 
400 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  41.32 
 
 
421 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  37.95 
 
 
384 aa  102  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  41.32 
 
 
687 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0074  peptidase M23B  44.63 
 
 
513 aa  102  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  39.53 
 
 
423 aa  102  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  40 
 
 
490 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  42.98 
 
 
464 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  36.81 
 
 
402 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>