71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0192 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0192  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  600  1e-170  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2043  beta-lactamase domain-containing protein  53.17 
 
 
283 aa  307  1e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493734  normal  0.574906 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1322  beta-lactamase domain protein  46.05 
 
 
293 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1386  beta-lactamase domain protein  46.39 
 
 
293 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3164  beta-lactamase domain-containing protein  46.82 
 
 
307 aa  259  5e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2783  beta-lactamase domain-containing protein  47.19 
 
 
307 aa  258  6e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0376946  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3165  beta-lactamase domain-containing protein  46.82 
 
 
307 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.808585  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3308  beta-lactamase domain-containing protein  46.82 
 
 
307 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1206  beta-lactamase domain protein  46.82 
 
 
307 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.734556  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1156  beta-lactamase domain-containing protein  45.04 
 
 
299 aa  256  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3628  beta-lactamase domain protein  41.32 
 
 
293 aa  256  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  45.93 
 
 
295 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3474  metallo-beta-lactamase family protein  46.44 
 
 
299 aa  256  4e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  45.93 
 
 
295 aa  255  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3100  beta-lactamase domain-containing protein  44.68 
 
 
287 aa  253  2e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0968  metallo-beta-lactamase family protein  44.15 
 
 
295 aa  253  2e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1090  beta-lactamase domain-containing protein  44.33 
 
 
299 aa  253  4e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1090  beta-lactamase domain-containing protein  44.33 
 
 
299 aa  252  6e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1020  beta-lactamase domain-containing protein  44.15 
 
 
295 aa  251  7e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3253  hypothetical protein  43.77 
 
 
295 aa  251  8e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0891036  hitchhiker  1.47175e-08 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3840  beta-lactamase domain-containing protein  42.96 
 
 
294 aa  248  9e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2350  beta-lactamase domain protein  43.94 
 
 
291 aa  246  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4421  beta-lactamase domain-containing protein  42.11 
 
 
291 aa  245  8e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951601  normal  0.632005 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3489  beta-lactamase domain protein  41.57 
 
 
293 aa  244  1e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.383942  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1032  beta-lactamase domain-containing protein  41.2 
 
 
291 aa  242  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4474  Beta-lactamase-like  44.41 
 
 
292 aa  239  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2218  Beta-lactamase-like  46.39 
 
 
291 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3173  metallo-beta-lactamase family protein  41.18 
 
 
486 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3136  metallo-beta-lactamase family protein  41.18 
 
 
404 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1401  beta-lactamase domain-containing protein  41.51 
 
 
317 aa  236  3e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3190  metallo-beta-lactamase family protein  41.18 
 
 
395 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376596  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1880  metallo-beta-lactamase family protein  41.18 
 
 
404 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2729  metallo-beta-lactamase family protein  41.18 
 
 
404 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97914  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1429  metallo-beta-lactamase family protein  40.79 
 
 
444 aa  236  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34824  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2018  metallo-beta-lactamase family protein  41.18 
 
 
395 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0896  metallo-beta-lactamase family protein  41.18 
 
 
404 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.723759  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0456  beta-lactamase domain protein  41.89 
 
 
303 aa  234  1e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1475  hypothetical protein  40.75 
 
 
317 aa  233  3e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  45.63 
 
 
296 aa  232  4e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1754  beta-lactamase domain protein  42.01 
 
 
299 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0337  hypothetical protein  38.36 
 
 
304 aa  193  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18325  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4778  beta-lactamase domain-containing protein  37.89 
 
 
289 aa  192  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140958  normal  0.142084 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000936  metallo-beta-lactamase family protein  37.93 
 
 
288 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00963821  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3038  beta-lactamase domain-containing protein  37.46 
 
 
288 aa  189  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.332043 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1097  beta-lactamase domain-containing protein  35.32 
 
 
298 aa  184  2e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6473  beta-lactamase domain protein  35.84 
 
 
293 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1806  beta-lactamase domain-containing protein  35.29 
 
 
293 aa  179  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2292  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37.08 
 
 
299 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0736  beta-lactamase domain-containing protein  35.08 
 
 
266 aa  166  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0019476  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5480  beta-lactamase domain-containing protein  32.21 
 
 
273 aa  152  6e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000722949 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4380  putative cytoplasmic protein  32.53 
 
 
273 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.46635e-23 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0280  Zn-dependent hydrolase  32.13 
 
 
293 aa  148  1e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0400931  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  29.44 
 
 
292 aa  114  2e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03565  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00280)  28.73 
 
 
302 aa  101  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  3.15394e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0655  metal dependent phosphohydrolase  24.11 
 
 
278 aa  76.6  4e-13  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0656  metal dependent phosphohydrolase  24.8 
 
 
301 aa  58.9  9e-08  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1677  metallo-beta-lactamase family protein  22.43 
 
 
299 aa  58.5  1e-07  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  23.67 
 
 
318 aa  53.1  6e-06  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  21.29 
 
 
302 aa  49.7  5e-05  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  25.13 
 
 
323 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5991  beta-lactamase domain-containing protein  21.05 
 
 
274 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.144532  normal  0.0646735 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  26.9 
 
 
319 aa  47  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  25.83 
 
 
319 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  21.43 
 
 
312 aa  43.9  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3244  metal dependent phosphohydrolase  22.8 
 
 
526 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744931  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  25.66 
 
 
319 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  24.46 
 
 
298 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.1498e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  24.81 
 
 
332 aa  43.5  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  26.98 
 
 
337 aa  42.7  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  38.89 
 
 
333 aa  42.7  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3706  Beta-lactamase-like  21.43 
 
 
417 aa  42.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>