169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0188 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0188  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  347  6e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0777  rhodanese-like protein  68.22 
 
 		 139 aa  180  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.808709  normal  0.0344492 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4736  rhodanese domain-containing protein  62.02 
 
 		 144 aa  174  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.163303 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2088  hypothetical protein  63.5 
 
 		 169 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0947585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3452  rhodanese-like protein  66.67 
 
 		 139 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647498  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4914  rhodanese domain-containing protein  66.67 
 
 		 139 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367762  normal  0.616913 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5891  Rhodanese domain protein  62.79 
 
 		 146 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6431  rhodanese domain-containing protein  60.94 
 
 		 134 aa  161  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.940174 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2063  rhodanese-like protein  60.94 
 
 		 144 aa  158  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2642  rhodanese domain-containing protein  58.91 
 
 		 145 aa  158  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  57.03 
 
 		 136 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5372  rhodanese domain-containing protein  68.99 
 
 		 139 aa  154  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0673577  normal  0.0625322 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1235  rhodanese domain-containing protein  54.96 
 
 		 142 aa  153  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3698  rhodanese domain-containing protein  65.89 
 
 		 141 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562484  normal  0.386083 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1986  rhodanese domain-containing protein  55.38 
 
 		 137 aa  150  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4865  rhodanese domain-containing protein  65.89 
 
 		 139 aa  148  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22928  hitchhiker  0.000154413 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4349  rhodanese domain-containing protein  65.89 
 
 		 139 aa  148  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000446887 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4402  rhodanese domain-containing protein  57.36 
 
 		 141 aa  144  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  57.03 
 
 		 136 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4425  Rhodanese domain protein  52.76 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2149  rhodanese domain protein  50.78 
 
 		 131 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.262587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1761  rhodanese-like domain-containing protein  59.7 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.637912  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0834  rhodanese-like domain-containing protein  62.2 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974825  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0054  rhodanese-like domain-containing protein  62.2 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0184557  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0963  rhodanese domain-containing protein  62.7 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.144935  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0871  rhodanese domain-containing protein  62.7 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1566  rhodanese-like domain-containing protein  62.2 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2213  rhodanese-like domain-containing protein  62.7 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00171016  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2147  Rhodanese domain protein  42.15 
 
 		 138 aa  94.4  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7122  rhodanese domain-containing protein  44.53 
 
 		 159 aa  92.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3657  Rhodanese domain protein  34.17 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03114  hypothetical protein  35.96 
 
 		 133 aa  85.5  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0450436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2078  rhodanese domain-containing protein  31.03 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.04221  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2472  rhodanese domain-containing protein  31.03 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.86428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4212  Rhodanese domain protein  37.14 
 
 		 241 aa  77.8  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.204414  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0872  rhodanese domain-containing protein  33.64 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  38.98 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  36.89 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 226 aa  67  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  36.96 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 189 aa  57.4  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  29.69 
 
 		 146 aa  57.4  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  31.48 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 227 aa  54.3  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 230 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  31.71 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 224 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 224 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 223 aa  53.9  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 224 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 224 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 224 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  29.35 
 
 		 221 aa  53.9  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  30.89 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  35.37 
 
 		 218 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  35.63 
 
 		 218 aa  51.2  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  30.68 
 
 		 144 aa  51.2  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2645  Rhodanese domain protein  35.16 
 
 		 147 aa  51.2  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.799  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 227 aa  50.8  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 231 aa  50.8  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 218 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  31.25 
 
 		 115 aa  50.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  32.95 
 
 		 222 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  28.57 
 
 		 247 aa  49.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  36.25 
 
 		 252 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 235 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 235 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 235 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  42.22 
 
 		 527 aa  48.5  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0349  rhodanese domain-containing protein  34.83 
 
 		 141 aa  48.5  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  29.55 
 
 		 148 aa  48.1  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  32.11 
 
 		 170 aa  47.8  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 124 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  27.61 
 
 		 568 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  27.61 
 
 		 568 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  32.94 
 
 		 124 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4884  rhodanese-like protein  30.21 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  29.63 
 
 		 569 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2930  thiosulfate sulfurtransferase  36.27 
 
 		 533 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  31.82 
 
 		 222 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  32.26 
 
 		 112 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  38.33 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5326  rhodanese-like domain protein  29.17 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  27.27 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.5 
 
 		 388 aa  46.6  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  30.34 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 226 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  31.4 
 
 		 226 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3684  rhodanese domain-containing protein  30.3 
 
 		 555 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1903  rhodanese domain-containing protein  30.48 
 
 		 211 aa  45.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.931871  decreased coverage  0.00875739 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  36.78 
 
 		 549 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0504  rhodanese domain-containing protein  35.37 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>