More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0175 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0175  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
480 aa  993    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1092  coniferyl aldehyde dehydrogenase  58.95 
 
 
475 aa  584  1.0000000000000001e-165  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.500272  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000269  aldehyde dehydrogenase  55.1 
 
 
470 aa  557  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05634  aldehyde dehydrogenase  54.35 
 
 
470 aa  518  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0988  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  51.05 
 
 
475 aa  507  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3357  aldehyde dehydrogenase  51.28 
 
 
475 aa  504  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3332  aldehyde dehydrogenase  53.49 
 
 
474 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1028  Aldehyde Dehydrogenase  53.28 
 
 
474 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.889075 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1040  aldehyde dehydrogenase  53.28 
 
 
474 aa  495  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.820564 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1007  aldehyde dehydrogenase  53.06 
 
 
474 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3150  aldehyde dehydrogenase  52.75 
 
 
474 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3103  aldehyde dehydrogenase  53.1 
 
 
474 aa  490  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3683  coniferyl aldehyde dehydrogenase  51.91 
 
 
474 aa  486  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0872  aldehyde dehydrogenase  52.1 
 
 
474 aa  488  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0937  aldehyde dehydrogenase  51.72 
 
 
473 aa  484  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2855  coniferyl aldehyde dehydrogenase  52.93 
 
 
479 aa  484  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0841165  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2982  aldehyde dehydrogenase  51.2 
 
 
474 aa  481  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4064  aldehyde dehydrogenase  53.11 
 
 
479 aa  476  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0975  aldehyde dehydrogenase  49.57 
 
 
473 aa  477  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3251  aldehyde dehydrogenase  52.75 
 
 
474 aa  474  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3716  coniferyl aldehyde dehydrogenase  53.61 
 
 
476 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425789  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3428  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  50.23 
 
 
471 aa  436  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.841636  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04810  putative aldehyde dehydrogenase  48.6 
 
 
476 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0460  putative aldehyde dehydrogenase  48.39 
 
 
476 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4994  aldehyde dehydrogenase  47.26 
 
 
474 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3572  aldehyde dehydrogenase  47.07 
 
 
481 aa  431  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.072637  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5345  aldehyde dehydrogenase  47.42 
 
 
476 aa  423  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4187  aldehyde dehydrogenase  48.51 
 
 
476 aa  421  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5170  aldehyde dehydrogenase  47.58 
 
 
476 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0345  aldehyde dehydrogenase  47.11 
 
 
480 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.403687  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0418  coniferyl aldehyde dehydrogenase  49.66 
 
 
475 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5120  conifer aldehyde dehydrogenase, putative  47.31 
 
 
476 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6421  aldehyde dehydrogenase  43.79 
 
 
480 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2458  aldehyde dehydrogenase  43.5 
 
 
480 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0388363  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3090  aldehyde dehydrogenase  43.5 
 
 
480 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3072  aldehyde dehydrogenase  43.5 
 
 
480 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2938  coniferyl aldehyde dehydrogenase  46.21 
 
 
472 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2982  aldehyde dehydrogenase  43.95 
 
 
480 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3409  coniferyl aldehyde dehydrogenase  46.21 
 
 
472 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3273  coniferyl aldehyde dehydrogenase  46.21 
 
 
472 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2151  coniferyl aldehyde dehydrogenase  46.21 
 
 
472 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0409  coniferyl aldehyde dehydrogenase  46.21 
 
 
472 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0214  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  46.21 
 
 
472 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3118  aldehyde dehydrogenase  44.39 
 
 
480 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0226  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  45.97 
 
 
472 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7472  aldehyde dehydrogenase  43.48 
 
 
491 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0982  aldehyde dehydrogenase  44.21 
 
 
485 aa  371  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0117  aldehyde dehydrogenase  43.02 
 
 
476 aa  371  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1332  hypothetical protein  40.64 
 
 
462 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0192  coniferyl aldehyde dehydrogenase  45.97 
 
 
472 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0016  aldehyde dehydrogenase  43.43 
 
 
475 aa  366  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5677  aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 
491 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3068  aldehyde dehydrogenase  44.47 
 
 
480 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.919224 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6041  aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 
491 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0711456 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4636  aldehyde dehydrogenase  41.39 
 
 
490 aa  364  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325559  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3764  Aldehyde Dehydrogenase  42.7 
 
 
472 aa  364  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0172  coniferyl aldehyde dehydrogenase  43.35 
 
 
472 aa  363  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.424655 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2579  aldehyde dehydrogenase  43.08 
 
 
478 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1085  aldehyde dehydrogenase  41.57 
 
 
490 aa  359  6e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.327666 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1058  aldehyde dehydrogenase family protein  43.25 
 
 
466 aa  358  9.999999999999999e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0704571  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1336  hypothetical protein  39.79 
 
 
469 aa  358  9.999999999999999e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1294  aldehyde dehydrogenase  41.5 
 
 
511 aa  358  9.999999999999999e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5413  coniferyl aldehyde dehydrogenase (CALDH)  41.32 
 
 
477 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.073023  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1325  aldehyde dehydrogenase  41.76 
 
 
465 aa  355  1e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489656  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0996  aldehyde dehydrogenase family protein  42.56 
 
 
470 aa  354  2e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2304  aldehyde dehydrogenase  42.95 
 
 
476 aa  354  2.9999999999999997e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6016  coniferyl aldehyde dehydrogenase (CALDH)  42.41 
 
 
483 aa  353  5e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596098  normal  0.623763 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0048  aldehyde dehydrogenase  40.54 
 
 
483 aa  351  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2547  Aldehyde Dehydrogenase  44.12 
 
 
481 aa  349  6e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.975135  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5205  aldehyde dehydrogenase  45.73 
 
 
498 aa  348  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2747  aldehyde dehydrogenase  43.26 
 
 
510 aa  348  1e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.120582  normal  0.0601156 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3253  aldehyde dehydrogenase  40.22 
 
 
487 aa  347  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0133422  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5226  aldehyde dehydrogenase  39.13 
 
 
479 aa  347  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0158  aldehyde dehydrogenase  46.6 
 
 
467 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3195  aldehyde dehydrogenase  43.89 
 
 
496 aa  347  3e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3971  Aldehyde Dehydrogenase  43.26 
 
 
469 aa  345  1e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1251  aldehyde dehydrogenase  47.19 
 
 
478 aa  344  2e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.502305  hitchhiker  0.0082854 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3272  aldehyde dehydrogenase  43.94 
 
 
472 aa  342  7e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0225308 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1991  aldehyde dehydrogenase  41.34 
 
 
460 aa  342  1e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408159  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4344  aldehyde dehydrogenase  42.13 
 
 
475 aa  340  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.261334  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2218  aldehyde dehydrogenase  43.72 
 
 
474 aa  341  2e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0696851 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4813  Aldehyde Dehydrogenase  41.69 
 
 
479 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167418  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3382  Aldehyde Dehydrogenase  44.02 
 
 
472 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4268  Aldehyde Dehydrogenase  40 
 
 
462 aa  340  4e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0607  aldehyde dehydrogenase  37.58 
 
 
484 aa  337  2.9999999999999997e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549994  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4903  Aldehyde Dehydrogenase  41.65 
 
 
479 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0679006  normal  0.531166 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1351  Aldehyde Dehydrogenase  45.3 
 
 
472 aa  335  9e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0782  aldehyde dehydrogenase  40.27 
 
 
484 aa  334  2e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.790584  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0438  aldehyde dehydrogenase  37.17 
 
 
484 aa  334  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0433999  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0334  Aldehyde Dehydrogenase  41.61 
 
 
465 aa  333  5e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1378  aldehyde dehydrogenase  39.64 
 
 
470 aa  328  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.283338  hitchhiker  0.000287193 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1503  aldehyde dehydrogenase  40.69 
 
 
477 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0440  aldehyde dehydrogenase  39.71 
 
 
483 aa  323  4e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461443  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3846  aldehyde dehydrogenase  41.42 
 
 
477 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0165  Aldehyde Dehydrogenase  38.01 
 
 
459 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0486514 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1636  aldehyde dehydrogenase  37.84 
 
 
473 aa  317  2e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.290647  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3615  aldehyde dehydrogenase  38.46 
 
 
460 aa  317  3e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.30982  normal  0.838762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4336  aldehyde dehydrogenase  37.44 
 
 
494 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.215144  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0821  Aldehyde Dehydrogenase  37.95 
 
 
475 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0672695  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2120  aldehyde dehydrogenase  38.63 
 
 
474 aa  311  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.536292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>