More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0150 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0150  purine-binding chemotaxis protein CheW  100 
 
 		 153 aa  303  5.0000000000000004e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  37.06 
 
 		 185 aa  124  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  38.93 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  38.93 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  38.93 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  38.93 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  38.93 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  38.93 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  38.93 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  38.93 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  35.42 
 
 		 183 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3496  biotin synthase  40.29 
 
 		 179 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.296204  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  39.19 
 
 		 163 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  39.19 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2180  purine-binding chemotaxis protein  38.26 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.735055  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  39.19 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  39.44 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  39.44 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4377  CheW protein  38.51 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  37.76 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.31 
 
 		 170 aa  115  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  39.73 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  39.73 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  39.73 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  39.73 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  37.76 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  37.76 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  39.73 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  39.73 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  39.73 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  38.46 
 
 		 167 aa  114  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  39.42 
 
 		 162 aa  114  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  39.04 
 
 		 175 aa  114  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  39.04 
 
 		 174 aa  114  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  38.73 
 
 		 170 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  33.99 
 
 		 187 aa  113  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  38.73 
 
 		 164 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  38.73 
 
 		 164 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  34.56 
 
 		 155 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  34.56 
 
 		 155 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  37.76 
 
 		 165 aa  113  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  38.36 
 
 		 177 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  38.73 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  37.76 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  38.36 
 
 		 171 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  38.36 
 
 		 177 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  33.09 
 
 		 158 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  38.36 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  37.58 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  37.58 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  38.36 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  39.44 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  37.58 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  37.06 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  37.58 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  37.58 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  38.36 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  39.42 
 
 		 162 aa  111  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  38.73 
 
 		 170 aa  111  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  37.23 
 
 		 155 aa  112  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  39.42 
 
 		 162 aa  111  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  36.49 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  36.36 
 
 		 166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  36.43 
 
 		 160 aa  110  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  37.06 
 
 		 165 aa  110  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0728  CheW protein  43.65 
 
 		 185 aa  110  8.000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000233542  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  37.41 
 
 		 163 aa  110  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  36.43 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  36.36 
 
 		 167 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2144  chemotaxis protein cheW  34.01 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  36.05 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0568  CheW protein  38.24 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141879  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  37.67 
 
 		 178 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  37.67 
 
 		 178 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  37.06 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  37.5 
 
 		 175 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  38.03 
 
 		 171 aa  106  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  34.46 
 
 		 205 aa  106  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  34.78 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  36.03 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  38.24 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.78 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0727  CheW-like protein  34.67 
 
 		 166 aa  104  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1524  CheW protein  39.26 
 
 		 187 aa  104  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0532774 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0165  CheW protein  33.56 
 
 		 183 aa  104  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  35.42 
 
 		 163 aa  104  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  32.61 
 
 		 159 aa  103  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  34.31 
 
 		 158 aa  103  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.61 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  34.51 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  32.59 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  32.61 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5609  CheW protein  40 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  32.61 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  36 
 
 		 174 aa  102  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  34.03 
 
 		 163 aa  102  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  32.61 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  34.03 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.06 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  35.66 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>