118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0116 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0116  hcp protein  100 
 
 		 172 aa  362  1e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1025  hcp protein  99.42 
 
 		 172 aa  362  2e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2514  Hcp1 family type VI secretion system effector  83.72 
 
 		 172 aa  313  8e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.908248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1195  hypothetical protein  82.56 
 
 		 172 aa  310  9e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1182  hypothetical protein  82.56 
 
 		 172 aa  309  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1211  hypothetical protein  82.56 
 
 		 172 aa  309  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0180  hypothetical protein  77.91 
 
 		 172 aa  295  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4256  type VI secretion system effector, Hcp1 family  77.33 
 
 		 172 aa  294  5e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0344  type VI secretion system effector, Hcp1 family  76.74 
 
 		 172 aa  294  5e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2697  type VI secretion system effector, Hcp1 family  76.74 
 
 		 172 aa  293  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.788661  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1606  type VI secretion system effector, Hcp1 family  76.74 
 
 		 172 aa  293  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0054  type VI secretion system effector, Hcp1 family  76.74 
 
 		 172 aa  292  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0061  type VI secretion system effector, Hcp1 family  77.33 
 
 		 172 aa  292  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0312  hypothetical protein  77.33 
 
 		 172 aa  291  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3906  hypothetical protein  77.33 
 
 		 172 aa  291  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0385  Hcp1 family type VI secretion system effector  77.33 
 
 		 172 aa  291  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0647  type VI secretion system effector, Hcp1 family  76.74 
 
 		 172 aa  291  4e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3239  type VI secretion system effector, Hcp1 family  76.16 
 
 		 172 aa  290  6e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0417  type VI secretion system effector, Hcp1 family  76.16 
 
 		 172 aa  290  6e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1163  type VI secretion system effector, Hcp1 family  76.16 
 
 		 172 aa  290  6e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.838462  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1501  type VI secretion system effector, Hcp1 family  76.16 
 
 		 172 aa  290  6e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2558  type VI secretion system effector, Hcp1 family  76.16 
 
 		 172 aa  290  6e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2826  type VI secretion system effector, Hcp1 family  76.16 
 
 		 172 aa  290  6e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1113  hcp  73.26 
 
 		 172 aa  276  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1233  hypothetical protein  73.26 
 
 		 172 aa  276  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.189483 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0241  hypothetical protein  72.09 
 
 		 172 aa  276  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0243  hypothetical protein  72.09 
 
 		 172 aa  276  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0249  hypothetical protein  72.09 
 
 		 172 aa  276  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0058  hypothetical protein  70.35 
 
 		 172 aa  265  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3233  Hcp1 family type VI secretion system effector  69.41 
 
 		 171 aa  263  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1153  Hcp1 family type VI secretion system effector  68.05 
 
 		 171 aa  249  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.465729  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2118  hypothetical protein  65.29 
 
 		 171 aa  238  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4082  hcp protein  65.68 
 
 		 171 aa  238  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000915297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2615  hcp protein  65.68 
 
 		 171 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191752 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1188  secreted protein Hcp  62.5 
 
 		 173 aa  230  7.000000000000001e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4487  hypothetical protein  57.56 
 
 		 172 aa  221  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5435  secreted protein Hcp  58.24 
 
 		 172 aa  218  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2045  hypothetical protein  57.06 
 
 		 171 aa  216  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2328  hypothetical protein  57.06 
 
 		 171 aa  216  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03240  secreted protein Hcp  58.24 
 
 		 172 aa  214  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000126332  hitchhiker  9.98491e-17 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43070  secreted protein Hcp  58.24 
 
 		 172 aa  214  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000428975  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44890  secreted protein Hcp  58.24 
 
 		 172 aa  214  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00654526  normal  0.188551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69560  secreted protein Hcp  58.24 
 
 		 172 aa  214  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00260129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1247  secreted protein Hcp  57.65 
 
 		 172 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000449  Hcp protein  52.33 
 
 		 172 aa  199  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000134513  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1357  secreted protein Hcp-2 (haemolysin co-regulated protein)  53.49 
 
 		 172 aa  197  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1202  secreted protein Hcp-1 (haemolysin co-regulated protein)  52.91 
 
 		 173 aa  194  5.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_35  secreted protein Hcp-2 (haemolysin co-regulated protein)  52.33 
 
 		 172 aa  194  6e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05871  hypothetical protein  51.81 
 
 		 166 aa  187  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0533  type VI secretion system effector, Hcp1 family  72.22 
 
 		 124 aa  179  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0868  hcp protein  41.42 
 
 		 162 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2539  secreted protein Hcp  43.03 
 
 		 171 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0301409  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3174  hcp protein  33.14 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5261  hypothetical protein  34.94 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0619  hypothetical protein  34.94 
 
 		 161 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0130418 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1626  type VI secretion system effector, Hcp1 family  35.33 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0280  hypothetical protein  33.14 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0731  hypothetical protein  36.36 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2506  hypothetical protein  36.36 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0803  Hcp1 family type VI secretion system effector  36.36 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3256  Hcp1 family type VI secretion system effector  36.55 
 
 		 167 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5212  hypothetical protein  34.94 
 
 		 161 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0782  hypothetical protein  35.66 
 
 		 163 aa  107  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3645  Hcp1 family type VI secretion system effector  37.06 
 
 		 161 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2816  hypothetical protein  37.04 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0171  hypothetical protein  35.17 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000104194 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2981  hypothetical protein  35.17 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000297859 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3506  type VI secretion system effector, Hcp1 family  35.71 
 
 		 159 aa  104  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0013  secreted protein Hcp, potential oxidative stress protein  33.73 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3644  type VI secretion system effector, Hcp1 family  34.52 
 
 		 159 aa  102  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3128  hypothetical protein  33.57 
 
 		 163 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2696  type VI secretion system effector, Hcp1 family  32.74 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.441294  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1198  hypothetical protein  36.63 
 
 		 159 aa  98.2  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00141696  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1304  Hcp1 family type VI secretion system effector  36.63 
 
 		 159 aa  98.2  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.543696  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0441  type VI secretion system effector, Hcp1 family  34.57 
 
 		 159 aa  98.2  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2983  hypothetical protein  32.94 
 
 		 159 aa  98.2  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3060  Hcp1 family type VI secretion system effector  32.94 
 
 		 159 aa  98.2  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0406  hypothetical protein  36.63 
 
 		 159 aa  98.2  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191771  hitchhiker  0.0000230132 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4078  type VI secretion system effector, Hcp1 family  32.35 
 
 		 159 aa  97.1  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00339373  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1885  hypothetical protein  32.94 
 
 		 190 aa  97.1  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0109727  hitchhiker  0.0000606082 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4049  type VI secretion system effector, Hcp1 family  32.53 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1788  hypothetical protein  31.4 
 
 		 163 aa  95.5  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0251  Hcp1 family type VI secretion system effector  35.33 
 
 		 159 aa  95.1  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0741  type VI secretion system effector, Hcp1 family  32.53 
 
 		 155 aa  94.7  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.155948  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3977  type VI secretion system effector, Hcp1 family  33.73 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0159  hypothetical protein  30.12 
 
 		 161 aa  90.9  8e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354123  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2272  type VI secretion system effector, Hcp1 family  32.54 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1346  hypothetical protein  33.13 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1459  Hcp1 family type VI secretion system effector  33.13 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.303873  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4027  type VI secretion system effector, Hcp1 family  34.13 
 
 		 159 aa  89  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363751  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0224  hypothetical protein  30.23 
 
 		 160 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.156413  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0226  hypothetical protein  30.23 
 
 		 160 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0574  type VI secretion system effector, Hcp1 family  30.72 
 
 		 182 aa  85.1  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.237126  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0019  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  84.3  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.965697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3004  hypothetical protein  31.82 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00118578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4093  type VI secretion system effector, Hcp1 family  30.46 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1588  hypothetical protein  28.65 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00504704  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1216  HNH endonuclease domain-containing protein  30.41 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.516867  normal  0.131262 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1097  type VI secretion system effector, Hcp1 family  31.33 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3284  hcp  65.22 
 
 		 66 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.360217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>