More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0100 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  595  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  37.04 
 
 		 274 aa  215  5e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  37.41 
 
 		 274 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  35.04 
 
 		 274 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  35.04 
 
 		 274 aa  198  7e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  35.04 
 
 		 274 aa  198  7e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  35.04 
 
 		 274 aa  198  7e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  34.42 
 
 		 277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  32.48 
 
 		 274 aa  189  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  33.21 
 
 		 274 aa  188  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  32.12 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  32.12 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  35.24 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  31.86 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  34.98 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  34.48 
 
 		 275 aa  135  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  37.14 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  35.1 
 
 		 292 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  32.58 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  32.06 
 
 		 287 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  26.84 
 
 		 303 aa  122  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  30.3 
 
 		 286 aa  119  9e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  29.71 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  28.51 
 
 		 280 aa  116  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  29.85 
 
 		 275 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  25.4 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 297 aa  112  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  27.44 
 
 		 298 aa  112  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  24.8 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2482  putative signal transduction protein  29.28 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  28.24 
 
 		 274 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  26.25 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1703  putative signal transduction protein  29 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151129 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  31.98 
 
 		 352 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  26.61 
 
 		 297 aa  105  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  26.54 
 
 		 279 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  24.89 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1469  putative signal transduction protein  27.27 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  32.24 
 
 		 397 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  27.95 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  23.51 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  24.19 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  29.41 
 
 		 351 aa  96.3  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1569  putative signal transduction protein  28.57 
 
 		 283 aa  96.3  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  23.31 
 
 		 279 aa  95.9  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  30.81 
 
 		 378 aa  95.5  9e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.23 
 
 		 412 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  27.92 
 
 		 289 aa  94.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  29.68 
 
 		 353 aa  94  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0899  putative signal transduction protein  26.82 
 
 		 297 aa  93.6  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  26.32 
 
 		 293 aa  93.6  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  28.79 
 
 		 415 aa  93.2  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1996  putative signal transduction protein  26.01 
 
 		 274 aa  92.8  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.490329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1708  putative signal transduction protein  26.01 
 
 		 274 aa  93.2  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.538449  normal  0.498965 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  29.21 
 
 		 280 aa  92.4  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  28.19 
 
 		 455 aa  92.4  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  26.82 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  28.71 
 
 		 285 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  29.84 
 
 		 505 aa  91.3  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 283 aa  90.5  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0100  signal transduction protein  26.67 
 
 		 546 aa  90.5  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114046  normal  0.288231 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  29.44 
 
 		 284 aa  90.1  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.52 
 
 		 634 aa  90.5  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  25.85 
 
 		 285 aa  90.5  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1203  response regulator  29.74 
 
 		 634 aa  89.7  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1364  serine/threonine protein kinase  32.37 
 
 		 790 aa  89.7  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.498929  normal  0.194256 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0393  metal dependent phosphohydrolase  23.38 
 
 		 283 aa  89.4  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1772  metal dependent phosphohydrolase  24.4 
 
 		 440 aa  89.4  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0702712  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  24.42 
 
 		 427 aa  89  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  30.46 
 
 		 790 aa  88.6  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  29.32 
 
 		 292 aa  88.2  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  25.71 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  27.56 
 
 		 291 aa  88.2  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  27.04 
 
 		 369 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1043  putative signal transduction protein  27.14 
 
 		 288 aa  88.2  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  30.64 
 
 		 283 aa  87.4  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  26.43 
 
 		 340 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  22.86 
 
 		 407 aa  87  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  31.41 
 
 		 281 aa  87  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  27.11 
 
 		 291 aa  86.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5311  putative signal transduction protein  28.43 
 
 		 467 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0528676 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2242  putative signal transduction protein  27.27 
 
 		 317 aa  87  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  30.57 
 
 		 276 aa  86.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  26.67 
 
 		 313 aa  86.7  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  24.62 
 
 		 283 aa  86.7  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  25.58 
 
 		 287 aa  86.3  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5220  putative signal transduction protein  28.43 
 
 		 467 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.743433 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  29.2 
 
 		 716 aa  85.9  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  29.63 
 
 		 285 aa  85.9  7e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3043  putative signal transduction protein  32.86 
 
 		 276 aa  85.9  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.211419  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  26.27 
 
 		 284 aa  85.5  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  25.7 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0714  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  27.05 
 
 		 524 aa  84.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0064  hypothetical protein  27.32 
 
 		 465 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  25.85 
 
 		 456 aa  84.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  30.4 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  25.35 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  29.61 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0460  putative signal transduction protein  26.96 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.798096  normal  0.334543 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5359  putative signal transduction protein  27.94 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>