87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0099 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0099  putative phosphatidylglycerophosphatase B  100 
 
 
274 aa  556  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000115517  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06845  phosphatidylglycerophosphatase B  44.84 
 
 
241 aa  193  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000870  membrane-associated phospholipid phosphatase  44.24 
 
 
232 aa  177  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2007  phosphatidylglycerophosphatase B  35.85 
 
 
253 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.993627  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1917  phosphatidylglycerophosphatase B  33.02 
 
 
253 aa  94  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857525  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2232  phosphatidylglycerophosphatase B  33.02 
 
 
253 aa  94  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000384262  hitchhiker  0.00312553 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2028  phosphatidylglycerophosphatase B  33.02 
 
 
253 aa  94  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000921729  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2652  phosphatidylglycerophosphatase B  35.35 
 
 
257 aa  92  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000111048  unclonable  0.0000000410416 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2652  phosphatidylglycerophosphatase B  32.97 
 
 
258 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123614  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2370  phosphatidylglycerophosphatase B  32.43 
 
 
258 aa  89.4  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2190  phosphatidylglycerophosphatase B  31.8 
 
 
257 aa  89.4  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0128246  hitchhiker  0.0000491085 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1733  phosphatidylglycerophosphatase B  28.5 
 
 
257 aa  89  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00419578  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1897  phosphatidylglycerophosphatase B  33.33 
 
 
254 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00462631  hitchhiker  4.757070000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1834  phosphatidylglycerophosphatase B  33.33 
 
 
254 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.127293  hitchhiker  2.60377e-27 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1839  phosphatidylglycerophosphatase B  33.33 
 
 
254 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.030955  hitchhiker  0.000257274 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1439  phosphatidylglycerophosphatase B  33.33 
 
 
254 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000437206  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1620  phosphatidylglycerophosphatase B  33.33 
 
 
254 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00558855  hitchhiker  1.12329e-19 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1506  phosphatidylglycerophosphatase B  35.81 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148348  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1851  phosphatidylglycerophosphatase B  35.81 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000018502  unclonable  4.59635e-21 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2348  phosphatidylglycerophosphatase B  35.81 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000463864  unclonable  0.0000000183837 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1480  phosphatidylglycerophosphatase B  35.81 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000040898  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1389  phosphatidylglycerophosphatase B  35.81 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000467722  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1912  phosphatidylglycerophosphatase B  35.81 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000677496  unclonable  3.2959700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01266  hypothetical protein  35.81 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00208867  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2369  Phosphatidylglycerophosphatase  35.81 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000909296  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01255  phosphatidylglycerophosphatase B  35.81 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00156775  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1700  phosphatidylglycerophosphatase B  31.25 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000559502  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4154  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.69 
 
 
256 aa  72  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0302  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.91 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0354  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.06 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0462  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.46 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1042  phosphatidylglycerophosphatase  29.37 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0369  phosphatidylglycerophosphatase  27.49 
 
 
274 aa  67  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3657  phosphatidylglycerophosphatase  32.28 
 
 
271 aa  67  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0364  phosphatidylglycerophosphatase  32.28 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3275  phosphatidylglycerophosphatase B, putative  32.52 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4335  phosphatidylglycerophosphatase B, putative  31.01 
 
 
260 aa  62.8  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3606  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.22 
 
 
269 aa  54.7  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1778  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.93 
 
 
182 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1093  membrane-associated phospholipid phosphatase  33.33 
 
 
218 aa  52  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00170585  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3920  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.48 
 
 
260 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0878  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.25 
 
 
182 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.749948  hitchhiker  0.002123 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3997  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.27 
 
 
285 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4020  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.27 
 
 
285 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1039  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.37 
 
 
183 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4113  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.27 
 
 
285 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2635  bacitracin transport permease protein bcrc  24.3 
 
 
199 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183943 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7181  phosphoesterase PA-phosphatase related  47.3 
 
 
200 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.495224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3404  phosphoesterase PA-phosphatase related  45.45 
 
 
228 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2489  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.04 
 
 
199 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0315773  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6892  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.53 
 
 
251 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.757531 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4143  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.94 
 
 
201 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5915  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.36 
 
 
249 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.322864  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4117  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.94 
 
 
201 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1775  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.22 
 
 
187 aa  46.6  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9017  phosphoesterase PA-phosphatase related  44.44 
 
 
232 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  40 
 
 
194 aa  45.8  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2678  Pap2 superfamily protein, putative  35.11 
 
 
199 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129761  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0393  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.5 
 
 
219 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0402  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.5 
 
 
219 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0381  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.5 
 
 
219 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.257956  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0284  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  25.79 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.206751  hitchhiker  0.0000772388 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0037  PAP2 family protein  41.79 
 
 
245 aa  45.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2676  bacitracin transport permease protein bcrc  34.41 
 
 
199 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0639  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.42 
 
 
185 aa  45.4  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.198264  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0036  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.11 
 
 
273 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.5 
 
 
157 aa  45.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2748  phosphoesterase, PA-phosphatase-related protein  36.05 
 
 
248 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.572696  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5319  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.73 
 
 
220 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02498  PAP2 superfamily, putative  42.68 
 
 
138 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0399  phosphatase  30.34 
 
 
187 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.556092  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.41 
 
 
169 aa  43.5  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3908  putative phosphatase  35.48 
 
 
423 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3788  putative phosphatase  35.48 
 
 
423 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0423  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.54 
 
 
241 aa  43.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3969  putative phosphatase  35.48 
 
 
423 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2461  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.84 
 
 
254 aa  43.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2555  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.37 
 
 
271 aa  43.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.729938  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2844  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.56 
 
 
252 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0315  membrane-associated phospholipid phosphatase  32.95 
 
 
216 aa  42.7  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.770739  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2785  bacitracin transport permease  37.97 
 
 
199 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2391  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  23.33 
 
 
199 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.193299  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0021  PAP2 family protein  38.1 
 
 
220 aa  42.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2570  hypothetical protein  30 
 
 
227 aa  42  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2665  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  23.33 
 
 
199 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160204 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2716  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  23.33 
 
 
199 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.179676  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2430  PAP2 family protein  23.74 
 
 
199 aa  42  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000481219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>