198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0097 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  304  2.0000000000000002e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  56.82 
 
 
155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  50 
 
 
148 aa  135  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  38.24 
 
 
145 aa  111  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  45.69 
 
 
191 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  42.74 
 
 
162 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0541  hypothetical protein  39.53 
 
 
155 aa  99  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  43.24 
 
 
328 aa  98.2  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  36.11 
 
 
160 aa  97.8  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  39.72 
 
 
162 aa  97.4  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  36.3 
 
 
138 aa  97.1  7e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  44.23 
 
 
190 aa  95.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  35.92 
 
 
160 aa  94.4  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  35.92 
 
 
160 aa  94.4  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0810  hypothetical protein  35.92 
 
 
160 aa  94.4  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00181969  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  35.92 
 
 
160 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0905  hypothetical protein  36.89 
 
 
139 aa  93.6  8e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000768649  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  38.21 
 
 
140 aa  93.6  8e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  39.26 
 
 
160 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  38.06 
 
 
157 aa  92.8  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  39.26 
 
 
160 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  34.81 
 
 
150 aa  93.2  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3051  hypothetical protein  38.52 
 
 
159 aa  92  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  43 
 
 
187 aa  92  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0917  hypothetical protein  36.89 
 
 
139 aa  90.9  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000487122  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00576  hypothetical protein  42.28 
 
 
180 aa  90.9  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  36.43 
 
 
156 aa  90.5  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  35.76 
 
 
154 aa  90.1  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0987  hypothetical protein  36.07 
 
 
139 aa  89.4  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3566  hypothetical protein  39.42 
 
 
159 aa  88.2  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000659278  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  34.31 
 
 
160 aa  88.2  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  37.4 
 
 
265 aa  87.8  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1972  protein of unknown function DUF461  34.01 
 
 
147 aa  87.8  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0750  hypothetical protein  35.29 
 
 
160 aa  87.4  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  normal  0.044131 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4198  hypothetical protein  37.14 
 
 
158 aa  87.4  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00896972  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3239  hypothetical protein  35.29 
 
 
160 aa  87  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00124495  hitchhiker  0.00000947918 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  36.88 
 
 
142 aa  86.7  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  33.1 
 
 
161 aa  86.7  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  36.3 
 
 
173 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0722  hypothetical protein  35.29 
 
 
160 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000048039  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  36.99 
 
 
185 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  40 
 
 
204 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  35.4 
 
 
143 aa  85.5  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  34.31 
 
 
162 aa  85.1  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  34.51 
 
 
164 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  36.3 
 
 
162 aa  84.3  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  40 
 
 
203 aa  84.3  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  34.72 
 
 
158 aa  84  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  35.16 
 
 
157 aa  84.3  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  31.85 
 
 
179 aa  83.6  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  38.98 
 
 
170 aa  83.6  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0771  hypothetical protein  32.91 
 
 
158 aa  83.6  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000551146 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  33.1 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  32.86 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  32.89 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  35.62 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  31.11 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  33.11 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  32.24 
 
 
159 aa  82  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  32.06 
 
 
307 aa  81.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  34.15 
 
 
148 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  34.21 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  35.58 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  32.35 
 
 
195 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  32.89 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  32.89 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  33.06 
 
 
172 aa  79.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  31.17 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  35.16 
 
 
227 aa  79  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  33.08 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  33.8 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  40 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4208  hypothetical protein  34.88 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.438596  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  33.08 
 
 
161 aa  78.2  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3479  hypothetical protein  36.88 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.49381  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1136  conserved hypothetical protein (DUF461 domain protein)  39.42 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2684  hypothetical protein  33.06 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  32 
 
 
149 aa  77  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  32.43 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  37.29 
 
 
327 aa  77  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  33.09 
 
 
202 aa  77  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  33.9 
 
 
158 aa  77  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  35.29 
 
 
162 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  35.14 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0673  hypothetical protein  36.09 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0451444  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3578  protein of unknown function DUF461  41.58 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  37.72 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  29.37 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  31.58 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3228  hypothetical protein  33.82 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00349647  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2158  hypothetical protein  33.85 
 
 
168 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594619  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  33.59 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  29.75 
 
 
184 aa  73.9  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  32 
 
 
160 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  31.85 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  29.05 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  34.29 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04891  hypothetical protein  33.98 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00197754  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  33.04 
 
 
338 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2986  protein of unknown function DUF461  35.78 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00293351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>