13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0091 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0091  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  524  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000127543  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05100  hypothetical protein  55.56 
 
 
248 aa  289  3e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001233  hypothetical protein  55.79 
 
 
268 aa  284  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4246  hypothetical protein  24.39 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2953  type IV pilus assembly PilZ  21.13 
 
 
222 aa  63.5  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2294  putative type IV pilus assembly (PilZ) protein  21.46 
 
 
224 aa  59.3  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0292  hypothetical protein  25 
 
 
225 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000146713  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0848  hypothetical protein  25.81 
 
 
221 aa  48.5  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.10808  normal  0.09437 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0992  hypothetical protein  25.81 
 
 
221 aa  48.5  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3596  type IV pilus assembly PilZ  23.08 
 
 
220 aa  47  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000532  hypothetical protein  27.27 
 
 
180 aa  43.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.890998  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2668  type IV pilus assembly PilZ  25.21 
 
 
236 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0801155 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2940  hypothetical protein  22.75 
 
 
222 aa  42.7  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>