124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0090 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0090  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  197  5e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000798856  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0844  hypothetical protein  54.55 
 
 
92 aa  114  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05101  acetyltransferase  56.98 
 
 
114 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001234  predicted acetyltransferase  56.98 
 
 
91 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.546036  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3439  acetyltransferase  39.44 
 
 
102 aa  66.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3541  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
94 aa  63.9  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0392636  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2946  hypothetical protein  37.35 
 
 
100 aa  61.6  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3266  hypothetical protein  35.8 
 
 
96 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.709169  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0804  hypothetical protein  38.03 
 
 
92 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00670  hypothetical protein  32.56 
 
 
92 aa  58.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83104  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0481  acetyltransferase  35.48 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2713  hypothetical protein  35.21 
 
 
95 aa  57.4  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550413  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3559  hypothetical protein  34.57 
 
 
94 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41930  hypothetical protein  34.57 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2206  hypothetical protein  34.48 
 
 
90 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.788583 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1537  hypothetical protein  27.91 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3817  hypothetical protein  34.48 
 
 
99 aa  56.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.4231  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1504  hypothetical protein  35.44 
 
 
98 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3447  hypothetical protein  36.14 
 
 
93 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000030181  hitchhiker  0.000684662 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1924  hypothetical protein  36.14 
 
 
93 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000705286  hitchhiker  0.00000000000000488804 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1764  hypothetical protein  36.14 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000155918  hitchhiker  0.000000000000406701 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1290  acetyltransferase-like protein  30.23 
 
 
109 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.4967 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4010  hypothetical protein  34.52 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000057579  normal  0.556915 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0681  hypothetical protein  31.46 
 
 
101 aa  55.1  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.126872 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2323  hypothetical protein  35.71 
 
 
143 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000526442  hitchhiker  0.0000374352 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2243  acetyltransferase-like protein  30.23 
 
 
93 aa  54.3  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02810  predicted acetyltransferase  27.59 
 
 
96 aa  54.7  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2768  hypothetical protein  32.58 
 
 
96 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4214  acetyltransferase-like protein  32.39 
 
 
95 aa  53.9  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17450  predicted acetyltransferase  29.17 
 
 
118 aa  53.5  0.0000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.107922  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2274  hypothetical protein  30.95 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000000180646  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1807  acetyltransferase-like  36.9 
 
 
110 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2553  acetyltransferase-like protein  33.72 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000305824  hitchhiker  0.000000000000131346 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3100  hypothetical protein  28.89 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386761  normal  0.125352 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2072  hypothetical protein  30.95 
 
 
117 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000410313  normal  0.04757 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1912  hypothetical protein  39.22 
 
 
79 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00117595  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1574  hypothetical protein  27.37 
 
 
98 aa  51.6  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2917  GCN5-related N-acetyltransferase  23.66 
 
 
97 aa  51.6  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0995  acetyltransferase  40.74 
 
 
112 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23120  hypothetical protein  33.73 
 
 
90 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000670372  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5465  hypothetical protein  32.18 
 
 
104 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1594  hypothetical protein  26.74 
 
 
97 aa  51.2  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0106902  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0562  hypothetical protein  39.22 
 
 
96 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0850  hypothetical protein  27.78 
 
 
106 aa  51.2  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.348433  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0652  hypothetical protein  30.77 
 
 
98 aa  51.2  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2744  acetyltransferase-like  32.5 
 
 
377 aa  51.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1955  acetyltransferase-like  28.24 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1960  hypothetical protein  31.91 
 
 
96 aa  50.8  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0165  acetyltransferase-like protein  29.55 
 
 
123 aa  50.4  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4571  acetyltransferase-like protein  31.52 
 
 
100 aa  50.4  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017414  normal  0.441667 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2664  hypothetical protein  31.11 
 
 
100 aa  50.4  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0595784 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0923  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000523362  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0132  hypothetical protein  28.57 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0054  hypothetical protein  25.84 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.064515  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0063  hypothetical protein  25.84 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.777718  normal  0.024281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0044  hypothetical protein  25.84 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209264  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0789  hypothetical protein  39.22 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0068  hypothetical protein  24.44 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2765  hypothetical protein  32.84 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1003  hypothetical protein  37.25 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709962  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0061  hypothetical protein  35.29 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.372722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4762  acetyltransferase-like protein  24.72 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2492  hypothetical protein  22.99 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416236  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1808  acetyltransferase  29.07 
 
 
93 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0141  hypothetical protein  27.27 
 
 
97 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1753  acetyltransferase  27.59 
 
 
100 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.363811  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1104  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
102 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1973  acetyltransferase-like protein  27.03 
 
 
114 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3163  hypothetical protein  31.34 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.919705  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3475  acetyltransferase  29.63 
 
 
111 aa  47  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3969  hypothetical protein  33.75 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2008  hypothetical protein  27.17 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4391  hypothetical protein  27.59 
 
 
90 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.946399  normal  0.0400185 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0079  hypothetical protein  29.11 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0163  GCN5-related N-acetyltransferase  33.82 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3553  hypothetical protein  28.57 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0082  hypothetical protein  29.11 
 
 
87 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 
834 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3739  acetyltransferase-like protein  26.44 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3098  hypothetical protein  35.29 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207624  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0071  hypothetical protein  31.65 
 
 
79 aa  45.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4721  hypothetical protein  28.75 
 
 
103 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534046  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0065  hypothetical protein  29.11 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1761  acetyltransferase  29.07 
 
 
123 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0128615  normal  0.0715534 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2724  hypothetical protein  31.34 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0839227  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2603  hypothetical protein  25.97 
 
 
93 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3077  putative acetyltransferase protein  30.12 
 
 
92 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.402192 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3334  putative acetyltransferase protein  29.07 
 
 
92 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.474868 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0085  hypothetical protein  27.85 
 
 
88 aa  44.3  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0155  acetyltransferase  28.57 
 
 
93 aa  43.5  0.0009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0921  hypothetical protein  39.58 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.513329  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2544  acetyltransferase-like protein  33.93 
 
 
94 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0495517  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2596  hypothetical protein  33.93 
 
 
94 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12480  predicted acetyltransferase  30 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.441566  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3505  hypothetical protein  30.67 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3774  acetyltransferase-like  30.77 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.463282  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2548  hypothetical protein  30.3 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17311  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3632  hypothetical protein  23.86 
 
 
111 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0080  hypothetical protein  27.85 
 
 
87 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0084  hypothetical protein  27.85 
 
 
87 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>