43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0087 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0087  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  262  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00321975  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05112  hypothetical protein  81.82 
 
 		 128 aa  205  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001245  GTPase  75.97 
 
 		 126 aa  204  5e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0435  hypothetical protein  66.94 
 
 		 126 aa  175  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3017  hypothetical protein  58.73 
 
 		 138 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0114113 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3097  hypothetical protein  58.73 
 
 		 138 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.15154 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0872  hypothetical protein  56.45 
 
 		 139 aa  158  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000181159  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3194  hypothetical protein  58.21 
 
 		 138 aa  156  9e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15009 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0974  hypothetical protein  61.61 
 
 		 135 aa  153  6e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000285337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3299  hypothetical protein  61.74 
 
 		 126 aa  153  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1093  hypothetical protein  61.74 
 
 		 126 aa  153  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.592046 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0990  hypothetical protein  61.74 
 
 		 126 aa  153  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1060  hypothetical protein  61.74 
 
 		 126 aa  153  7e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0889  hypothetical protein  58.73 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1023  hypothetical protein  53.44 
 
 		 132 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.623609  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3694  hypothetical protein  61.06 
 
 		 115 aa  147  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.726429 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03393  hypothetical protein  62.5 
 
 		 107 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0126  hypothetical protein  62.5 
 
 		 107 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03442  conserved inner membrane protein  62.5 
 
 		 107 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4956  hypothetical protein  62.5 
 
 		 107 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0122  conserved hypothetical protein  62.5 
 
 		 107 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3791  hypothetical protein  62.5 
 
 		 107 aa  144  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4084  hypothetical protein  62.5 
 
 		 107 aa  144  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3913  hypothetical protein  62.5 
 
 		 107 aa  144  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3931  hypothetical protein  59.48 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.790566 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4096  hypothetical protein  61.74 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4015  hypothetical protein  61.74 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.808602  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03404  hypothetical protein  61.74 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4968  hypothetical protein  61.74 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.715689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0114  hypothetical protein  61.74 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.545237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3804  hypothetical protein  61.74 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.968341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0108  conserved hypothetical protein  61.74 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03453  predicted inner membrane protein  61.74 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0114  hypothetical protein  71.43 
 
 		 107 aa  141  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2806  hypothetical protein  57.03 
 
 		 125 aa  140  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0137  hypothetical protein  57.48 
 
 		 118 aa  140  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3251  hypothetical protein  57.39 
 
 		 117 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3900  inner membrane protein YiaW  56.9 
 
 		 120 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4039  hypothetical protein  68.6 
 
 		 113 aa  130  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3030  hypothetical protein  58.88 
 
 		 115 aa  125  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.254881  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3415  hypothetical protein  36.92 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0542319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2517  hypothetical protein  36.23 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1211  hypothetical protein  29.23 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>