21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0084 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001248  hypothetical protein  74.44 
 
 		 489 aa  783    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.27761  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0084  hypothetical protein  100 
 
 		 520 aa  1089    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332452  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05117  hypothetical protein  74.44 
 
 		 489 aa  773    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0456  conserved hypothetical protein, putative transposase  56.44 
 
 		 489 aa  590  1e-167  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5346  hypothetical protein  23.7 
 
 		 590 aa  139  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.696692 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2324  hypothetical protein  21.36 
 
 		 608 aa  89  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.601755  hitchhiker  0.00265307 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4387  hypothetical protein  23.27 
 
 		 375 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0052  hypothetical protein  24.51 
 
 		 481 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2860  hypothetical protein  21 
 
 		 453 aa  73.6  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0016  hypothetical protein  22.25 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.969858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1508  putative cytoplasmic protein  21.19 
 
 		 414 aa  66.6  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.371174 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0041  putative cytoplasmic protein  20.61 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.241451 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0042  putative cytoplasmic protein  21.44 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.814834  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0040  hypothetical protein  20.61 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.140825  hitchhiker  0.00714315 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0042  putative cytoplasmic protein  21.23 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.315374 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4438  hypothetical protein  22.16 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.944151  normal  0.141377 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4435  hypothetical protein  22.16 
 
 		 374 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4321  putative cytoplasmic protein  22.25 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3364  hypothetical protein  19.4 
 
 		 594 aa  53.5  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0040  hypothetical protein  20.39 
 
 		 417 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.204135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4351  hypothetical protein  21.18 
 
 		 348 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>