18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0071 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0071  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  389  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001260  hypothetical protein  48.66 
 
 		 190 aa  190  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05135  hypothetical protein  47.06 
 
 		 190 aa  186  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0752  hypothetical protein  44.86 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3291  hypothetical protein  35.33 
 
 		 165 aa  98.6  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03097  putative Fimh-like protein  38.93 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3266  hypothetical protein  33.85 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1186  hypothetical protein  35.66 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.218554 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3265  hypothetical protein  32.98 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2546  hypothetical protein  40 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0388  protein of unknown function DUF1566  27.61 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470988  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2203  protein of unknown function DUF1566  35.48 
 
 		 165 aa  48.9  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000589172  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2072  protein of unknown function DUF1566  35.35 
 
 		 166 aa  48.5  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000064519  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  36.47 
 
 		 670 aa  46.2  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0672  hypothetical protein  30 
 
 		 253 aa  45.8  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1432  hypothetical protein  28.22 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000213962  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  26.52 
 
 		 746 aa  42.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1619  hypothetical protein  28.57 
 
 		 299 aa  41.2  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000971569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>