47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0064 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0064  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  323  6e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00060183  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000931  hypothetical protein  36.91 
 
 
151 aa  107  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06930  hypothetical protein  36.24 
 
 
170 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0086  hypothetical protein  36.04 
 
 
175 aa  92.8  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1722  hypothetical protein  36.04 
 
 
175 aa  92.8  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1675  hypothetical protein  38.1 
 
 
176 aa  92  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0934134  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1535  hypothetical protein  32.93 
 
 
164 aa  91.3  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.418999  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2875  oxidoreductase molybdopterin binding  34.81 
 
 
184 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3132  hypothetical protein  32.48 
 
 
168 aa  85.1  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2285  hypothetical protein  32.91 
 
 
162 aa  84  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0709741  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26980  hypothetical protein  35.61 
 
 
162 aa  84  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199345  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4409  hypothetical protein  37.5 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0914  hypothetical protein  35.43 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5601  hypothetical protein  34.62 
 
 
168 aa  79  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.971581  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1522  hypothetical protein  35.51 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2668  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4742  hypothetical protein  31.69 
 
 
171 aa  74.3  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0657446  normal  0.278144 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4734  oxidoreductase molybdopterin binding  37.5 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0961  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.17 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1061  hypothetical protein  35.54 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0521  hypothetical protein  32.43 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2384  hypothetical protein  30.69 
 
 
169 aa  62.8  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0101  oxidoreductase molybdopterin binding  28.83 
 
 
162 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.242171  normal  0.468495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4053  hypothetical protein  32.23 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5146  oxidoreductase, molybdopterin binding  30 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4898  hypothetical protein  31.54 
 
 
180 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0558894 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3313  hypothetical protein  32.67 
 
 
160 aa  57.8  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3349  oxidoreductase molybdopterin binding  31.53 
 
 
173 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000852363 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0634  hypothetical protein  32.76 
 
 
166 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1772  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421289  hitchhiker  0.00000126753 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2887  hypothetical protein  31.9 
 
 
167 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4799  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.9 
 
 
167 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3369  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.9 
 
 
167 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0496244  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3303  oxidoreductase molybdopterin binding  30.22 
 
 
167 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482013  decreased coverage  0.00329734 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4147  oxidoreductase molybdopterin binding  31.9 
 
 
167 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0617106  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0795  hypothetical protein  28.28 
 
 
166 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0783  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  28.28 
 
 
166 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0956  hypothetical protein  28.28 
 
 
166 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3572  hypothetical protein  33.33 
 
 
196 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5221  oxidoreductase molybdopterin binding  29.79 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3123  hypothetical protein  27.5 
 
 
194 aa  50.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1655  hypothetical protein  28.71 
 
 
195 aa  50.8  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.848445  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2581  hypothetical protein  28.87 
 
 
192 aa  50.8  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0546962  normal  0.025304 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6601  hypothetical protein  25 
 
 
198 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4633  hypothetical protein  25 
 
 
198 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.381896 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0917  hypothetical protein  25 
 
 
200 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4188  hypothetical protein  23.08 
 
 
181 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>