31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0061 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0061  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  230  4.0000000000000004e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139615  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05304  hypothetical protein  59.79 
 
 		 101 aa  121  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000578  1,4-alpha-glucan branching enzyme  58.76 
 
 		 98 aa  117  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00704664  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5813  isoamylase N-terminal domain-containing protein  40.21 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1494  glycoside hydrolase family 13 domain protein  42.27 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00998  isoamylase protein-like protein  41.05 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.590602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3053  isoamylase N-terminal domain protein  41 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199592 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0815  glycoside hydrolase family 13 domain protein  36.73 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2682  isoamylase protein-like  39.08 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1855  glycoside hydrolase family 13 domain protein  38.71 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0255733  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0107  glycoside hydrolase family 13 domain protein  42.71 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.724495  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4079  glycoside hydrolase family 13 protein  44.32 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2047  isoamylase N-terminal domain-containing protein  40.7 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1470  glycoside hydrolase family 13 protein  41.84 
 
 		 98 aa  62  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1666  glycoside hydrolase family 13 domain protein  34.02 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0850  glycoside hydrolase family protein  37.5 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000054884  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2143  glycoside hydrolase family protein  39.18 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2301  glycoside hydrolase family 13 protein  31.76 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000000870464  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1368  glycoside hydrolase family 13 domain protein  37.5 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3886  glycoside hydrolase family 13 protein  29.89 
 
 		 223 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0366228 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1681  isoamylase N-terminal domain-containing protein  28 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0546611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3888  glycoside hydrolase family 13 protein  30.23 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  26.51 
 
 		 1162 aa  45.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1180  glycoside hydrolase family 13 protein  30.85 
 
 		 648 aa  44.7  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7533  hypothetical protein  28.95 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3793  glycoside hydrolase family 13 domain protein  29.41 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.079655  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3877  glycoside hydrolase family 13 domain protein  29.41 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106033  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3372  isoamylase N-terminal domain-containing protein  29.33 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.770177  hitchhiker  0.00400733 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0960  glycoside hydrolase family 13 protein  31.33 
 
 		 674 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677412  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3736  glycoside hydrolase family protein  28.38 
 
 		 206 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0979  glycoside hydrolase family 13 protein  30.12 
 
 		 674 aa  41.6  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0346401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>