26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0055 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0055  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  810    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.319346  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000676  permease  61.08 
 
 		 402 aa  458  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.497175  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3065  putative permease  23.68 
 
 		 409 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2097  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 409 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2260  putative permease  24.28 
 
 		 409 aa  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2061  macrolide efflux protein  24.07 
 
 		 409 aa  95.9  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2303  putative permease  24.07 
 
 		 409 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0356106 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2123  permease  24.07 
 
 		 409 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.042179  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2277  permease  24.07 
 
 		 409 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.539842  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2311  permease, putative  23.71 
 
 		 409 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2057  macrolide efflux protein  24.07 
 
 		 409 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2387  putative permease  24.39 
 
 		 409 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.94664  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1033  hypothetical protein  23.27 
 
 		 273 aa  54.3  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3723  major facilitator superfamily permease  20.68 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  26.33 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  22.78 
 
 		 415 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  23.33 
 
 		 406 aa  51.6  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  23.15 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  23.01 
 
 		 446 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6155  major facilitator superfamily MFS_1  18.7 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.601983  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  22.78 
 
 		 441 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7077  major facilitator superfamily MFS_1  31.72 
 
 		 436 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  18.65 
 
 		 406 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  18.96 
 
 		 406 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  24.41 
 
 		 414 aa  43.9  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>