More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0039 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  100 
 
 		 123 aa  253  8e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  57.94 
 
 		 116 aa  127  7.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  50.47 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  49.55 
 
 		 116 aa  118  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  51.85 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  53.33 
 
 		 128 aa  107  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  42.15 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  45.22 
 
 		 129 aa  103  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  45.63 
 
 		 132 aa  103  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  44.35 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  45.92 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  44.66 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  44.66 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  40.87 
 
 		 127 aa  100  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  47.37 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  48.31 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  48.31 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  46.32 
 
 		 138 aa  95.1  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2476  rhodanese domain-containing protein  46.39 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1410  rhodanese-like protein  47.06 
 
 		 136 aa  88.6  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000874287  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2684  Rhodanese domain protein  39.62 
 
 		 101 aa  76.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245912  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0323  rhodanese domain-containing protein  37.96 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000826672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3701  rhodanese domain-containing protein  37.04 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000331812  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0318  rhodanese domain-containing protein  37.04 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000262088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3397  phage shock protein E  41.41 
 
 		 105 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0322  rhodanese domain-containing protein  37.04 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000003033  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2592  rhodanese domain-containing protein  45.45 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261053  normal  0.428361 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  48.61 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  36.36 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4394  phage shock protein E  37.04 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0327  Rhodanese domain protein  36.11 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000770666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0320  rhodanese domain-containing protein  36.11 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000759321  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  46.15 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  46.15 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  37.5 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  46.15 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0326  rhodanese domain-containing protein  36.11 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000194442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  43.84 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0075  rhodanese domain-containing protein  50.7 
 
 		 354 aa  70.9  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0073  rhodanese domain-containing protein  50.7 
 
 		 354 aa  70.9  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  34 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  43.9 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  44.19 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  36.04 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  36.11 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3904  rhodanese domain-containing protein  36.56 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000089939  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0308  rhodanese domain-containing protein  35.51 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000185007  hitchhiker  0.0000000893128 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3528  rhodanese domain-containing protein  36.11 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000546152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0930  hypothetical protein  43.02 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0119442  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  47.37 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  41.89 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  43.42 
 
 		 216 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  38.1 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0916  rhodanese-like protein  35.71 
 
 		 98 aa  67  0.00000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001684  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  36.27 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  39.36 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  33.02 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  41.89 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  31.97 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  41.89 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  41.89 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  41.89 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  41.89 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  41.89 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1561  rhodanese domain-containing protein  38.27 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.229111 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0715  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  42.31 
 
 		 566 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  41.89 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  33.9 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0918  Rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.112795 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  40.54 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0728  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  42.31 
 
 		 566 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  39.73 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  38.71 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0689  rhodanese-like domain-containing protein  34.55 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.152263  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0675  rhodanese-like domain-containing protein  34.55 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.852423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0873  rhodanese-like domain protein  34.55 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000378208 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  38.46 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  40.54 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  42.65 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  36.63 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_002950  PG1713  putative lipoprotein  44.59 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0689  rhodanese domain-containing protein  34.55 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0157  hypothetical protein  33.7 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  38.57 
 
 		 194 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  35.14 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  43.59 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1238  Rhodanese domain protein  40.58 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  39.71 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  37.23 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  37.93 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2346  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.79 
 
 		 549 aa  63.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.705893  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  37.18 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  40.54 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0833  rhodanese-like domain protein  33.64 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00574407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  40.54 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  35.14 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0263  Rhodanese domain protein  40.22 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  34.67 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  33.04 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>