More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0038 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0038  hypothetical protein  100 
 
 		 518 aa  1068    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003646  Rtn protein  42.65 
 
 		 498 aa  428  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.191935  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0821  EAL domain-containing protein  33.19 
 
 		 541 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0931  EAL domain-containing protein  35.5 
 
 		 518 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.363166  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3041  EAL domain-containing protein  37.84 
 
 		 518 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4145  hypothetical protein  33.33 
 
 		 500 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2398  periplasmic sensor diguanylate phophodiesterase  39.74 
 
 		 506 aa  190  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.625554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0374  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  35.71 
 
 		 516 aa  166  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0285785 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4205  EAL domain protein  35.84 
 
 		 535 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4488  EAL domain protein  36.56 
 
 		 534 aa  163  6e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0396  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  34.96 
 
 		 516 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0476649  hitchhiker  0.000376911 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0376  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  34.96 
 
 		 516 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000844741  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0383  hypothetical protein  34.59 
 
 		 516 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0298247  normal  0.0200463 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0436  cyclic diguanylate phosphodiesterase  34.96 
 
 		 516 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0237258  hitchhiker  0.0000188077 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1268  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  35.5 
 
 		 504 aa  158  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.585411 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05448  hypothetical protein  32.83 
 
 		 489 aa  158  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1264  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  31.41 
 
 		 521 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0322571  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2458  diguanylate phosphodiesterase  31.41 
 
 		 521 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.577985  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01143  conserved inner membrane protein  31.41 
 
 		 507 aa  156  7e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01151  hypothetical protein  31.41 
 
 		 507 aa  156  7e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3821  rtn protein  28.06 
 
 		 515 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1307  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  31.41 
 
 		 521 aa  155  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.654083  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1089  diguanylate phosphodiesterase  26.33 
 
 		 512 aa  156  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.725575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05545  sensory transduction protein kinase  35.66 
 
 		 506 aa  155  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03877  Putative signal protein with EAL domain  36.01 
 
 		 374 aa  154  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1616  diguanylate phosphodiesterase  33.09 
 
 		 500 aa  154  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.59158  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0409  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor  35.2 
 
 		 925 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.231334  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2480  diguanylate phosphodiesterase  31.09 
 
 		 521 aa  154  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0186873  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1286  hypothetical protein  34.12 
 
 		 521 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3245  hypothetical protein  34.81 
 
 		 528 aa  153  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0153368 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0777  EAL domain-containing protein  33.53 
 
 		 519 aa  151  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2920  diguanylate phosphodiesterase  31.78 
 
 		 511 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0937134  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2811  EAL domain-containing protein  38 
 
 		 538 aa  150  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14530  hypothetical protein  36.63 
 
 		 523 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1983  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  34.45 
 
 		 486 aa  150  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.123377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2384  diguanylate phosphodiesterase  34.52 
 
 		 532 aa  150  6e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5276  putative signal transduction protein  34.85 
 
 		 529 aa  150  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134868  normal  0.223865 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1425  hypothetical protein  34.17 
 
 		 532 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1646  diguanylate phosphodiesterase  32.39 
 
 		 501 aa  147  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1559  hypothetical protein  34.21 
 
 		 532 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02106  hypothetical protein  31.86 
 
 		 518 aa  147  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1481  diguanylate phosphodiesterase  31.86 
 
 		 518 aa  147  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0849847  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2314  hypothetical protein  31.86 
 
 		 518 aa  147  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1471  hypothetical protein  31.86 
 
 		 518 aa  147  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000861353  normal  0.0219942 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02065  hypothetical protein  31.86 
 
 		 518 aa  147  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4609  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  32.98 
 
 		 533 aa  147  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.18383  normal  0.98216 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3314  hypothetical protein  32.06 
 
 		 497 aa  147  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0795943  normal  0.253919 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0122  EAL  34.56 
 
 		 525 aa  147  6e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2474  hypothetical protein  31.86 
 
 		 518 aa  147  6e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.505117  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0782  hypothetical protein  31.86 
 
 		 518 aa  147  6e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4523  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  32.98 
 
 		 516 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3724  EAL-containing signal transduction protein  33.21 
 
 		 536 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03933  hypothetical protein  35.08 
 
 		 528 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.123718  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3931  EAL domain protein  35.08 
 
 		 528 aa  145  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4303  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  35.08 
 
 		 528 aa  145  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4985  sensory box protein  33.74 
 
 		 1534 aa  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2325  hypothetical protein  31.86 
 
 		 518 aa  145  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.802767  hitchhiker  0.00255877 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4659  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  31.46 
 
 		 533 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0122  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.5 
 
 		 515 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.907666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001909  GGDEF family protein  34.14 
 
 		 848 aa  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3729  diguanylate phosphodiesterase  37.28 
 
 		 506 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4614  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  35.08 
 
 		 528 aa  145  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03893  hypothetical protein  35.08 
 
 		 528 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3966  EAL domain-containing protein  35.08 
 
 		 528 aa  145  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0738656 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4608  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  32.98 
 
 		 533 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.342789 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3395  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.68 
 
 		 834 aa  145  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0265  EAL domain-containing protein  33.68 
 
 		 528 aa  144  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5564  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  34.68 
 
 		 528 aa  144  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.718753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3606  diguanylate phosphodiesterase  28.82 
 
 		 506 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1798  diguanylate phosphodiesterase  34.24 
 
 		 520 aa  144  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199517  normal  0.66089 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4515  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  32.63 
 
 		 533 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0408  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.79 
 
 		 862 aa  144  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4523  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  34.68 
 
 		 528 aa  143  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0705  diguanylate phosphodiesterase  28.57 
 
 		 506 aa  143  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3538  diguanylate phosphodiesterase  35.64 
 
 		 506 aa  143  9e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.506628  decreased coverage  0.0000122226 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2296  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.41 
 
 		 749 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00930711  normal  0.870348 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2785  hypothetical protein  35.04 
 
 		 526 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2284  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.41 
 
 		 749 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2339  aminoglycoside response regulator  33.45 
 
 		 526 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000320511  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4570  hypothetical protein  34.41 
 
 		 749 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2710  hypothetical protein  35.04 
 
 		 526 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1791  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.73 
 
 		 757 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2438  diguanylate phosphodiesterase  36.29 
 
 		 528 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0344  EAL domain-containing protein  32.85 
 
 		 530 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0114  GGDEF domain/EAL domain protein  34.09 
 
 		 554 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0959  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.64 
 
 		 744 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0391  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.93 
 
 		 1040 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.519884  normal  0.119604 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2042  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.41 
 
 		 749 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1677  EAL  31.67 
 
 		 523 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0048  EAL  32.46 
 
 		 538 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1018  GGDEF domain-containing protein  32.93 
 
 		 678 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00123246  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2206  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.41 
 
 		 752 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0814  EAL domain-containing protein  36.95 
 
 		 514 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2089  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.41 
 
 		 749 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0378  sensory box protein  35.18 
 
 		 1491 aa  141  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0214422 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01021  sensory box/GGDEF/EAL domain protein  33.74 
 
 		 1392 aa  141  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.44 
 
 		 743 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.766687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2455  hypothetical protein  33.07 
 
 		 518 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2409  hypothetical protein  33.07 
 
 		 518 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.948391  hitchhiker  0.000104823 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1614  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.68 
 
 		 771 aa  140  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0431388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>