30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0015 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0015  hypothetical protein  100 
 
 
421 aa  873    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2515  hypothetical protein  27.51 
 
 
401 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.59747  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1210  hypothetical protein  33.33 
 
 
225 aa  143  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.751098  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0327  ImpA domain-containing protein  25.93 
 
 
437 aa  74.7  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0400  ImpA domain-containing protein  25.93 
 
 
435 aa  74.7  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0233  ImpA domain protein  30.87 
 
 
469 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.845449  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2583  ImpA domain-containing protein  26.98 
 
 
455 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0225  ImpA domain-containing protein  30.87 
 
 
450 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.347157  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0227  ImpA domain-containing protein  30.87 
 
 
450 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527104  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2997  ImpA domain-containing protein  26.84 
 
 
455 aa  70.9  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000267091 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1217  ImpA domain-containing protein  30.43 
 
 
454 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.249719  normal  0.176595 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1098  ImpA domain protein  30.43 
 
 
453 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2485  ImpA domain-containing protein  26.4 
 
 
455 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2793  ImpA domain protein  28.34 
 
 
477 aa  67.4  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2906  ImpA domain-containing protein  22.67 
 
 
471 aa  66.6  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1804  ImpA domain-containing protein  22.09 
 
 
463 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.579437  normal  0.0143873 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3241  ImpA domain protein  25.95 
 
 
478 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1084  ImpA domain protein  25.95 
 
 
478 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3135  ImpA-related N-terminal domain-containing protein  21.7 
 
 
458 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0805  ImpA domain-containing protein  22.55 
 
 
465 aa  50.4  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3656  type VI secretion-associated protein  34.12 
 
 
527 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983598  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1094  ImpA domain protein  32.29 
 
 
411 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2813  hypothetical protein  27.59 
 
 
508 aa  48.9  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2910  ImpA domain-containing protein  28.57 
 
 
791 aa  48.5  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.401848 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0796  ImpA domain-containing protein  25.95 
 
 
534 aa  46.6  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000434  hypothetical protein  21.64 
 
 
437 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2590  type VI secretion-associated protein  28.85 
 
 
533 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2492  ImpA domain-containing protein  28.85 
 
 
533 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05856  hypothetical protein  27.27 
 
 
434 aa  43.9  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2990  ImpA domain-containing protein  27.88 
 
 
533 aa  43.1  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000813522 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>