23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0012 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0012  putative lipoprotein  100 
 
 		 86 aa  178  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000725  hypothetical protein  48.28 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04925  hypothetical protein  54.02 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06136  hypothetical protein  54.9 
 
 		 51 aa  67  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0514  hypothetical protein  48.94 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3517  hypothetical protein  48.94 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3851  hypothetical protein  48.94 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3795  hypothetical protein  48.94 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0514  hypothetical protein  48.94 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0473  hypothetical protein  48.94 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.366214  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3977  hypothetical protein  48.94 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3191  hypothetical protein  48.21 
 
 		 58 aa  54.7  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0515  hypothetical protein  47.92 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3345  hypothetical protein  48.94 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0537  hypothetical protein  52.38 
 
 		 58 aa  53.9  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0449372  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0552  hypothetical protein  44 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3282  hypothetical protein  46.67 
 
 		 56 aa  51.6  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3590  hypothetical protein  63.64 
 
 		 58 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3360  hypothetical protein  60.61 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4085  hypothetical protein  60.61 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1456  hypothetical protein  33.33 
 
 		 52 aa  45.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2081  hypothetical protein  45.16 
 
 		 221 aa  41.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.442221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2704  hypothetical protein  40 
 
 		 239 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>