125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0005 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0005  pnuC protein  100 
 
 
244 aa  492  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00212076  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000335  ribosyl nicotinamide transporter PnuC-like protein  80.58 
 
 
243 aa  372  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.258606  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06139  hypothetical protein  79.51 
 
 
245 aa  372  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3795  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  73.53 
 
 
244 aa  362  2e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0549  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  73.53 
 
 
244 aa  362  2e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0544  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  73.53 
 
 
244 aa  362  3e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2864  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  59.5 
 
 
241 aa  288  6e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1404  intergral membrane NMN transport protein PnuC  59.5 
 
 
241 aa  288  6e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2952  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  59.5 
 
 
241 aa  288  6e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000727328  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1283  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  60.5 
 
 
241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000492562  hitchhiker  0.00161907 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3081  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  64.22 
 
 
241 aa  280  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.368722  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4138  intergral membrane NMN transport protein PnuC  59.92 
 
 
243 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1255  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  63.79 
 
 
241 aa  280  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0973983  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4123  intergral membrane NMN transport protein PnuC  60.33 
 
 
243 aa  278  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0852  NMN family, nucleoside/purine/pyrimidine transporter  60.5 
 
 
239 aa  275  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00354956  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0884  hypothetical protein  60.5 
 
 
239 aa  275  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.200323  normal  0.769102 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0916  protein PnuC  60.08 
 
 
239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.74639 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0793  protein PnuC  60.5 
 
 
239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000546447  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0821  PnuC protein  60.5 
 
 
239 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229981  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1242  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  60.42 
 
 
239 aa  270  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00177208  normal  0.230051 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1162  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  59.07 
 
 
241 aa  268  7e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.264602  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0854  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  59.24 
 
 
239 aa  267  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00364593  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00704  predicted nicotinamide mononucleotide transporter  59.24 
 
 
239 aa  266  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00368961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2891  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  59.24 
 
 
239 aa  266  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135178  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2911  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  59.24 
 
 
239 aa  266  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal  0.283606 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00693  hypothetical protein  59.24 
 
 
239 aa  266  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00374424  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0775  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  58.82 
 
 
239 aa  265  4e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000228392  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0805  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  59.23 
 
 
234 aa  259  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000506847  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0779  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  59.23 
 
 
234 aa  259  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000733463  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0673  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  58.8 
 
 
234 aa  256  3e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000252701  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2897  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  55.88 
 
 
241 aa  252  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000827134  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0513  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  33.04 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5744  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  30.21 
 
 
209 aa  120  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000549247  normal  0.596683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5815  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  31.93 
 
 
224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0122  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.1 
 
 
204 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.537648  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0012  nicotinamide mononucleotide transporter  30.77 
 
 
187 aa  103  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0199  nucleoside transporter  29.58 
 
 
216 aa  96.3  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0199  nucleoside transporter  29.58 
 
 
216 aa  96.3  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0218  nucleoside transporter, PnuC family  29.58 
 
 
216 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0219  nucleoside transporter  28.14 
 
 
216 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0186  nicotinamide mononucleotide transporter  29.58 
 
 
216 aa  95.9  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0751  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.44 
 
 
212 aa  95.9  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0189  nucleoside transporter  29.58 
 
 
216 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3131  nicotinamide mononucleotide transporter  31.22 
 
 
189 aa  95.5  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0241  nucleoside transporter, PnuC family  29.58 
 
 
216 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2175  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.14 
 
 
228 aa  94.7  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.993278  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0387  putative nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.44 
 
 
225 aa  94  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0605919  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0183  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.63 
 
 
216 aa  94.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2829  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.91 
 
 
188 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.707138  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0257  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.18 
 
 
197 aa  90.1  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2860  nicotinamide mononucleotide transporter  28.44 
 
 
188 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1089  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.51 
 
 
223 aa  89.7  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0298367  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2172  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.23 
 
 
189 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0259968  hitchhiker  0.00534825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2600  nicotinamide mononucleotide transporter  27.59 
 
 
187 aa  89  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.23973  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5421  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.23 
 
 
203 aa  89  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0179823  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3696  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.23 
 
 
209 aa  89.4  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39200  putative transporter  28.16 
 
 
191 aa  89  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.308671  normal  0.183121 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3577  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.23 
 
 
203 aa  89  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162448  normal  0.0889798 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5035  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.88 
 
 
203 aa  88.2  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4490  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.27 
 
 
214 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0408441  normal  0.0360062 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4688  nicotinamide mononucleotide transporter  28.16 
 
 
214 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0881597  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3675  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.16 
 
 
214 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.859752  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3847  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.16 
 
 
214 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.975456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2921  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.96 
 
 
188 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.833545  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3339  putative transporter  26.79 
 
 
191 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.572847  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2435  nicotinamide mononucleotide transporter  27.32 
 
 
210 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.906428  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02689  PnuC protein  25.24 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.719379  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2568  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.11 
 
 
220 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102879 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0693  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.83 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0149  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.24 
 
 
189 aa  79  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3448  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.77 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3009  nicotinamide mononucleotide transporter  26.47 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.229843  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2777  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.81 
 
 
234 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32260  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.11 
 
 
220 aa  77  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.323942  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1442  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.92 
 
 
201 aa  77  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.189058  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2849  putative transporter  27.36 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.705156  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3134  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.7 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3142  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC, putative  25.12 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0307  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.18 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.007136 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2760  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.62 
 
 
192 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1096  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.7 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000531611  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1413  nicotinamide mononucleotide transporter  23.04 
 
 
252 aa  68.6  0.00000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.211581  normal  0.406253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0720  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  22.87 
 
 
211 aa  68.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.258508 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1541  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.62 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1830  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  22.32 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.030494  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1585  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.75 
 
 
207 aa  65.1  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.651822  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01590  nicotinamide mononucleotide transporter  24.24 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.702697 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1453  transporter, putative  23.72 
 
 
215 aa  63.9  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.894692  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2066  nicotinamide mononucleotide transporter  25.59 
 
 
197 aa  63.5  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0274  N-ribosylnicotinamide transporter  24.88 
 
 
205 aa  63.2  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1920  nicotinamide mononucleotide transporter family protein  24.88 
 
 
205 aa  63.2  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00740685  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1346  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  22.38 
 
 
215 aa  62.8  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.418347  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2713  transporter, putative  21.55 
 
 
221 aa  62.8  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0065  putative nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  21.68 
 
 
217 aa  62  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2378  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  21.12 
 
 
221 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.35104  normal  0.833863 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1668  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.61 
 
 
239 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000502354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1796  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.14 
 
 
217 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874639  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1843  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.59 
 
 
217 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.144027  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1804  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.59 
 
 
217 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2482  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.59 
 
 
217 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.060877  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>