89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0645 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0645  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 160 aa  314  3e-85  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.501453  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  34.38 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1728  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000419207  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0010  ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000437004  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1714  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000355019  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl080  30S ribosomal protein S6  35.19 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  1.25992e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2503  30S ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000597267  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  34.38 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  31.96 
 
 		 98 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf696  ribosomal protein S6  33.8 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1970  ribosomal protein S6  31.11 
 
 		 98 aa  53.1  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00222496  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 95 aa  52.4  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  27.83 
 
 		 117 aa  50.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0420  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000077892  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 95 aa  48.9  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 95 aa  48.9  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0007  30S ribosomal protein S6  26.88 
 
 		 98 aa  47.8  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132561  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  27.84 
 
 		 98 aa  47.8  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  27.84 
 
 		 98 aa  47.8  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0428  30S ribosomal protein S6  33.91 
 
 		 124 aa  47.4  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.531029 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 94 aa  47  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 95 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 95 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1512  30S ribosomal protein S6  29.47 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.589185  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0558  30S ribosomal protein S6  30.95 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.457125  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  31.9 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  31.9 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0891  30S ribosomal protein S6  29.47 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0007  30S ribosomal protein S6  26.32 
 
 		 98 aa  44.3  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068559  hitchhiker  0.0000000000002413 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2133  30S ribosomal protein S6  32.43 
 
 		 143 aa  44.3  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.226778  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 176 aa  44.3  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2303  30S ribosomal protein S6  31.25 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0024  30S ribosomal protein S6  29.13 
 
 		 137 aa  44.3  0.0008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  27.78 
 
 		 128 aa  44.3  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  30.93 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  27.84 
 
 		 98 aa  43.9  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1045  30S ribosomal protein S6  30.93 
 
 		 117 aa  43.9  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.146697 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 124 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2052  30S ribosomal protein S6  37.08 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 124 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 124 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0923  ribosomal protein S6  28.71 
 
 		 138 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46862  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 		 151 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1622  30S ribosomal protein S6  31.25 
 
 		 117 aa  42.4  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 124 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3038  30S ribosomal protein S6  27.08 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6205  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 124 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2512  30S ribosomal protein S6  29.59 
 
 		 126 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1352  30S ribosomal protein S6  28.57 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0105388  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  28.57 
 
 		 135 aa  41.6  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  25.81 
 
 		 95 aa  41.6  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 94 aa  41.6  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1228  30S ribosomal protein S6  32.17 
 
 		 125 aa  41.6  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  28.57 
 
 		 132 aa  41.6  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  31.3 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  30.11 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 124 aa  40.8  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1916  30S ribosomal protein S6  28.42 
 
 		 148 aa  40.8  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  29.17 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0898  30S ribosomal protein S6  27.37 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0179425 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1979  30S ribosomal protein S6  31.3 
 
 		 124 aa  40.8  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5229  30S ribosomal protein S6  31.3 
 
 		 120 aa  40.4  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1900  30S ribosomal protein S6  27.37 
 
 		 122 aa  40.4  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168881 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>