More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0633 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0633  50S ribosomal protein L11  100 
 
 
150 aa  297  4e-80  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00304315  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl609  50S ribosomal protein L11  61.76 
 
 
142 aa  169  1e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.220291  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0065  50S ribosomal protein L11  54.29 
 
 
142 aa  155  1e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf144  50S ribosomal protein L11  53.79 
 
 
147 aa  154  3e-37  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  52.52 
 
 
146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0422  50S ribosomal protein L11  48.92 
 
 
145 aa  145  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000957396  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00045  50S ribosomal protein L11  47.89 
 
 
146 aa  142  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0390  50S ribosomal protein L11  51.8 
 
 
145 aa  139  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1939  50S ribosomal protein L11  46.15 
 
 
145 aa  138  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3453  50S ribosomal protein L11  45.52 
 
 
149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00121261  normal  0.0330426 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0845  ribosomal protein L11  44.06 
 
 
147 aa  137  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.518378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4481  ribosomal protein L11  44.83 
 
 
147 aa  135  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00539416  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  47.83 
 
 
141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1706  ribosomal protein L11  44.06 
 
 
147 aa  134  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0216759  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3173  50S ribosomal protein L11  44.14 
 
 
147 aa  133  8e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  47.1 
 
 
140 aa  132  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2166  50S ribosomal protein L11P  45 
 
 
145 aa  132  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0218611  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  47.1 
 
 
140 aa  132  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  46.72 
 
 
141 aa  130  5e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  45.83 
 
 
143 aa  130  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  46.43 
 
 
143 aa  130  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  49.23 
 
 
141 aa  130  6e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  44.93 
 
 
140 aa  130  9e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  46.72 
 
 
141 aa  130  9e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1045  ribosomal protein L11  45.71 
 
 
142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0104784  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  46.38 
 
 
141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  45.65 
 
 
141 aa  127  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1823  50S ribosomal protein L11  48.87 
 
 
142 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0237  50S ribosomal protein L11  47.52 
 
 
143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.0118731 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  44.53 
 
 
141 aa  127  6e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  47.45 
 
 
140 aa  126  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0315  50S ribosomal protein L11  46.81 
 
 
143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000167318  normal  0.214276 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2645  50S ribosomal protein L11  47.52 
 
 
143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0183792  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3790  50S ribosomal protein L11  47.52 
 
 
143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3435  50S ribosomal protein L11  46.81 
 
 
143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0613372  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0254  50S ribosomal protein L11  46.43 
 
 
145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149943  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  46.04 
 
 
140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1910  50S ribosomal protein L11  47.52 
 
 
143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000051235  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3182  50S ribosomal protein L11  47.52 
 
 
143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000133089  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3080  50S ribosomal protein L11  47.52 
 
 
143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  44.53 
 
 
141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3465  50S ribosomal protein L11  47.52 
 
 
143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108139  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2771  50S ribosomal protein L11  46.81 
 
 
143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  45.83 
 
 
143 aa  125  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0264  50S ribosomal protein L11  46.81 
 
 
143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0928671  normal  0.597405 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0255  50S ribosomal protein L11  46.81 
 
 
143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0246755  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0336  50S ribosomal protein L11  46.81 
 
 
143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0811079  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3758  50S ribosomal protein L11  47.52 
 
 
143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00142247  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0308  50S ribosomal protein L11  50 
 
 
141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000373457  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3820  50S ribosomal protein L11  47.52 
 
 
143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1943  50S ribosomal protein L11  49.62 
 
 
142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0464106  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0038  50S ribosomal protein L11  46.43 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000123599  hitchhiker  0.0000000000171978 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0302  50S ribosomal protein L11  47.86 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000139433  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  45.26 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2852  50S ribosomal protein L11  48.23 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393005  normal  0.399654 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0308  50S ribosomal protein L11  50 
 
 
143 aa  124  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00601669  normal  0.0251359 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0847  50S ribosomal protein L11  44.53 
 
 
141 aa  124  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000114172  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0826  50S ribosomal protein L11  50 
 
 
143 aa  124  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222387  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  44.6 
 
 
141 aa  124  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0594  ribosomal protein L11  48.57 
 
 
142 aa  125  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000269533  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08720  50S ribosomal protein L11  50 
 
 
143 aa  124  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444282  hitchhiker  0.00204472 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0356  50S ribosomal protein L11  50 
 
 
143 aa  124  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000696128 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  46.15 
 
 
142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  44.2 
 
 
141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  44.2 
 
 
141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  44.2 
 
 
141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  44.2 
 
 
141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06120  50S ribosomal protein L11  49.25 
 
 
143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  44.2 
 
 
141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  44.2 
 
 
141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  44.2 
 
 
141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  47.52 
 
 
143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  44.2 
 
 
141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  44.2 
 
 
141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  44.2 
 
 
141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0042  50S ribosomal protein L11  46.1 
 
 
143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000150349  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  44.2 
 
 
141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1209  50S ribosomal protein L11  47.86 
 
 
142 aa  124  5e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0302  50S ribosomal protein L11  47.52 
 
 
143 aa  124  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0441199  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  46.72 
 
 
141 aa  124  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1248  50S ribosomal protein L11  47.86 
 
 
142 aa  124  6e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.208102  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  43.06 
 
 
144 aa  124  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  45.26 
 
 
140 aa  124  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0642  50S ribosomal protein L11  45.32 
 
 
144 aa  124  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.28286  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13461  Plastid ribosomal protein L11 large ribosomal subunit  46.21 
 
 
148 aa  124  6e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0579369  normal  0.218003 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  45.45 
 
 
143 aa  123  8.000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  45.26 
 
 
142 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  46.72 
 
 
141 aa  123  9e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  46.04 
 
 
140 aa  123  9e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  45.32 
 
 
140 aa  123  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  45.26 
 
 
141 aa  122  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  44.2 
 
 
141 aa  123  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0268  50S ribosomal protein L11P  48.94 
 
 
143 aa  122  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00815832  hitchhiker  0.0013988 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0745  50S ribosomal protein L11  47.86 
 
 
142 aa  122  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00286512  normal  0.949117 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0312  ribosomal protein L11  46.81 
 
 
143 aa  122  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000294677  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1531  50S ribosomal protein L11  46.76 
 
 
141 aa  122  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000330995  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3161  ribosomal protein L11  44.29 
 
 
143 aa  122  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.236872  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  44.53 
 
 
141 aa  122  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0349  ribosomal protein L11  48.46 
 
 
141 aa  122  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0127148  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3656  50S ribosomal protein L11  46.81 
 
 
143 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00490061  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>