21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0572 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0572  tRNA-Met  100 
 
 
79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0743  tRNA-Met  86.21 
 
 
77 bp  52  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R18  tRNA-Met  86.21 
 
 
77 bp  52  0.00002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-1  tRNA-Met  90.24 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.596909  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0034  tRNA-Met  90.24 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0564  tRNA-Met  90.24 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1221  tRNA-Met  90.24 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.379489  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1574  tRNA-Met  90.24 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1609  tRNA-Met  90.24 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.824013 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0030  tRNA-Met  90.24 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0174  tRNA-Met  90.24 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.453072  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0032  tRNA-Met  90.24 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-2  tRNA-Met  93.55 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.582141  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08640  tRNA-Met  91.43 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000480255  hitchhiker  0.000000163212 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0033  tRNA-Met  93.55 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt022  tRNA-Met  91.43 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000116471  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2480  tRNA-Met  89.47 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0019483  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2477  tRNA-Met  89.47 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00937631  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2794  tRNA-Met  89.47 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000175616  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2791  tRNA-Met  89.47 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000913036  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0039  tRNA-Ser  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>