More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0523 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0925  DNA topoisomerase IV subunit B  53.27 
 
 		 666 aa  662    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.305492  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  54.32 
 
 		 654 aa  710    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf020  topoiosmerase IV subunit B  54.23 
 
 		 637 aa  681    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1154  DNA topoisomerase IV subunit B  52.84 
 
 		 653 aa  691    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  54.32 
 
 		 654 aa  710    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  54.32 
 
 		 654 aa  711    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000033182  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl309  DNA topoisomerase IV subunit B  52.54 
 
 		 647 aa  673    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.747062  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  54.32 
 
 		 654 aa  711    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1443  DNA topoisomerase IV subunit B  53.2 
 
 		 663 aa  670    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0710964  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1609  DNA topoisomerase IV subunit B  54 
 
 		 654 aa  701    Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000967673  decreased coverage  0.000000000000694445 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3608  DNA topoisomerase IV subunit B  54.32 
 
 		 654 aa  711    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.88333e-33 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3285  DNA topoisomerase IV subunit B  54.32 
 
 		 654 aa  708    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  54.32 
 
 		 654 aa  710    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0457  DNA topoisomerase IV, B subunit  54.4 
 
 		 643 aa  676    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.576082  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2247  DNA topoisomerase IV subunit B  53.85 
 
 		 654 aa  699    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000227299  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0782  DNA topoisomerase IV subunit B  52.35 
 
 		 674 aa  656    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000186449  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1416  DNA topoisomerase IV subunit B  53.2 
 
 		 665 aa  670    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0092743  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0523  DNA topoisomerase IV subunit B  100 
 
 		 642 aa  1308    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3624  DNA topoisomerase IV subunit B  54.32 
 
 		 654 aa  710    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000439989  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3706  DNA topoisomerase IV subunit B  54.32 
 
 		 654 aa  704    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2558  DNA topoisomerase IV subunit B  55.05 
 
 		 645 aa  706    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1065  DNA topoisomerase IV subunit B  54.26 
 
 		 644 aa  708    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0137081  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1026  DNA topoisomerase IV subunit B  53.87 
 
 		 674 aa  642    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0999  DNA topoisomerase IV subunit B  53.52 
 
 		 661 aa  686    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0633  DNA topoisomerase IV subunit B  53.3 
 
 		 649 aa  677    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.144503  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1617  DNA topoisomerase IV subunit B  55.23 
 
 		 656 aa  711    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000200667  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  51.11 
 
 		 650 aa  629  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  50.32 
 
 		 636 aa  629  1e-179  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  50 
 
 		 636 aa  628  1e-178  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  49.84 
 
 		 647 aa  620  1e-176  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  51.44 
 
 		 634 aa  615  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1364  DNA topoisomerase IV subunit B  50.79 
 
 		 687 aa  615  9.999999999999999e-175  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0683915  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  52.31 
 
 		 637 aa  607  9.999999999999999e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  49.53 
 
 		 633 aa  603  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  49.36 
 
 		 628 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  48.88 
 
 		 640 aa  598  1e-170  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  52.24 
 
 		 633 aa  596  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  50.08 
 
 		 644 aa  598  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  49.22 
 
 		 652 aa  595  1e-169  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  49.92 
 
 		 650 aa  594  1e-168  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  47.21 
 
 		 649 aa  590  1e-167  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  49.61 
 
 		 648 aa  589  1e-167  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  48.51 
 
 		 637 aa  588  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  49.53 
 
 		 651 aa  591  1e-167  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0177  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  48.74 
 
 		 641 aa  585  1e-166  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.724108  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2676  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  47.48 
 
 		 638 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000429732  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  49.52 
 
 		 641 aa  584  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  48.6 
 
 		 650 aa  579  1e-164  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  47.85 
 
 		 632 aa  581  1e-164  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  49.52 
 
 		 633 aa  580  1e-164  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  50.16 
 
 		 640 aa  579  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  48.73 
 
 		 645 aa  579  1e-164  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  48.01 
 
 		 642 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0087  DNA gyrase subunit B  47.51 
 
 		 650 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  47.77 
 
 		 635 aa  571  1e-161  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00060  DNA gyrase subunit B  47.52 
 
 		 654 aa  570  1e-161  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0159442  normal  0.243862 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0006  DNA gyrase, B subunit  48.13 
 
 		 649 aa  568  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  47.28 
 
 		 648 aa  567  1e-160  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  46.96 
 
 		 640 aa  566  1e-160  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf800  DNA gyrase subunit B  46.33 
 
 		 647 aa  566  1e-160  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2927  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  47.6 
 
 		 643 aa  565  1e-160  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.192259 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0041  DNA gyrase, B subunit  48.18 
 
 		 634 aa  567  1e-160  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  46.5 
 
 		 644 aa  568  1e-160  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  45.69 
 
 		 636 aa  568  1e-160  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  49.68 
 
 		 640 aa  568  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0335  DNA gyrase, B subunit  47.13 
 
 		 645 aa  567  1e-160  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  48.39 
 
 		 636 aa  567  1e-160  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  47.06 
 
 		 635 aa  565  1.0000000000000001e-159  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  48.57 
 
 		 635 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0005  DNA gyrase subunit B  48.98 
 
 		 672 aa  562  1.0000000000000001e-159  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.78617  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10005  DNA gyrase subunit B  46.72 
 
 		 714 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0006  DNA gyrase, B subunit  48.96 
 
 		 635 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.98095 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  49.61 
 
 		 649 aa  560  1e-158  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  48.48 
 
 		 633 aa  560  1e-158  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  49.68 
 
 		 642 aa  559  1e-158  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0006  DNA gyrase subunit B  46.28 
 
 		 695 aa  558  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000061906 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0005  DNA gyrase, B subunit  45.05 
 
 		 686 aa  560  1e-158  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  48.64 
 
 		 627 aa  559  1e-158  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  46.58 
 
 		 637 aa  560  1e-158  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  48.65 
 
 		 638 aa  560  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  49.21 
 
 		 640 aa  555  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0005  DNA gyrase, B subunit  46.4 
 
 		 685 aa  558  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  44.64 
 
 		 653 aa  558  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  47.12 
 
 		 642 aa  555  1e-157  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  48.43 
 
 		 643 aa  553  1e-156  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  44.16 
 
 		 645 aa  553  1e-156  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  48.89 
 
 		 640 aa  553  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  48.5 
 
 		 640 aa  553  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0006  DNA gyrase subunit B  45.98 
 
 		 696 aa  555  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  47.36 
 
 		 650 aa  554  1e-156  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  48.42 
 
 		 640 aa  550  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  45.69 
 
 		 637 aa  551  1e-155  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  48.42 
 
 		 640 aa  550  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  48.42 
 
 		 640 aa  550  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  48.42 
 
 		 640 aa  550  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  48.58 
 
 		 640 aa  550  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  48.42 
 
 		 640 aa  550  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4986  DNA gyrase, B subunit  45.44 
 
 		 651 aa  550  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  48.42 
 
 		 640 aa  550  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  49.05 
 
 		 638 aa  551  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>