More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0235 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0235  30S ribosomal protein S17  100 
 
 
84 aa  169  1e-41  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  62.34 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  60.24 
 
 
91 aa  99  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  57.14 
 
 
84 aa  99.4  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0328  SSU ribosomal protein S17P  60 
 
 
88 aa  98.6  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.11157e-25  unclonable  0.0000000432201 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  57.83 
 
 
85 aa  97.8  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0431  30S ribosomal protein S17  55.42 
 
 
86 aa  97.4  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000081271  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0120  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 
87 aa  97.4  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326224  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0067  30S ribosomal protein S17  57.83 
 
 
86 aa  96.7  9e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.1837  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6040  30S ribosomal protein S17  57.83 
 
 
102 aa  95.9  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216935  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl132  30S ribosomal protein S17  57.83 
 
 
85 aa  96.7  1e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  58.23 
 
 
88 aa  96.3  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0687  30S ribosomal protein S17  57.83 
 
 
85 aa  96.7  1e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  57.32 
 
 
96 aa  96.7  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0604  SSU ribosomal protein S17P  57.32 
 
 
88 aa  96.7  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000107316  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  57.32 
 
 
89 aa  95.5  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1716  30S ribosomal protein S17  56.63 
 
 
86 aa  95.5  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  61.04 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1898  30S ribosomal protein S17  57.83 
 
 
86 aa  95.5  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0030957  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  54.76 
 
 
84 aa  95.1  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1049  SSU ribosomal protein S17P  53.66 
 
 
99 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672161  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1022  SSU ribosomal protein S17P  53.66 
 
 
99 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0401706  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0697  ribosomal protein S17  59.04 
 
 
94 aa  95.1  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2393  30S ribosomal protein S17  56.63 
 
 
86 aa  94.7  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000222065  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1039  SSU ribosomal protein S17P  53.66 
 
 
99 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0891213  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1314  ribosomal protein S17  53.66 
 
 
98 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.959285  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3329  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 
89 aa  94.4  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000398832  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1132  ribosomal protein S17  56.1 
 
 
107 aa  94  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  52.44 
 
 
89 aa  94  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  57.83 
 
 
93 aa  94  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 
90 aa  93.6  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3308  30S ribosomal protein S17  57.83 
 
 
92 aa  94  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000182432  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  57.32 
 
 
96 aa  93.6  8e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0347  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 
89 aa  93.6  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.451528  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3134  ribosomal protein S17  59.76 
 
 
99 aa  93.2  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4306  30S ribosomal protein S17  57.32 
 
 
91 aa  93.2  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174188  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0596  ribosomal protein S17  55.42 
 
 
90 aa  92.8  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.729409  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  57.32 
 
 
93 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3986  ribosomal protein S17  58.33 
 
 
86 aa  92.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3990  30S ribosomal protein S17  56.41 
 
 
98 aa  92.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165652 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1565  ribosomal protein S17  55.42 
 
 
86 aa  92.4  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00149156  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0591  30S ribosomal protein S17  56.1 
 
 
102 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  54.22 
 
 
85 aa  92  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1474  SSU ribosomal protein S17P  56.1 
 
 
88 aa  92.8  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000677491  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0940  ribosomal protein S17  56.63 
 
 
93 aa  92.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138584  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1276  ribosomal protein S17  57.14 
 
 
84 aa  92.4  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3914  30S ribosomal protein S17  57.32 
 
 
91 aa  92  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0282  30S ribosomal protein S17  52.44 
 
 
89 aa  91.7  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000313457  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04070  SSU ribosomal protein S17P  56.1 
 
 
93 aa  91.7  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3170  30S ribosomal protein S17  57.83 
 
 
92 aa  92  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000175324  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2678  ribosomal protein S17  54.22 
 
 
101 aa  91.7  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4312  ribosomal protein S17  56.1 
 
 
94 aa  91.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.572719  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 
99 aa  91.7  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1175  ribosomal protein S17  61.54 
 
 
94 aa  91.7  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00103981  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0116  30S ribosomal protein S17  56.1 
 
 
87 aa  92  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0287  30S ribosomal protein S17  52.44 
 
 
89 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000277089 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5040  ribosomal protein S17  51.22 
 
 
98 aa  92  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0780546  normal  0.167049 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10724  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 
135 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706337  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0300  30S ribosomal protein S17  51.22 
 
 
88 aa  91.3  4e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.633045  unclonable  6.524050000000001e-29 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2568  30S ribosomal protein S17  61.43 
 
 
83 aa  91.7  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  53.01 
 
 
84 aa  90.9  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  54.76 
 
 
84 aa  90.9  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3712  ribosomal protein S17  60 
 
 
86 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0205  30S ribosomal protein S17  56.1 
 
 
88 aa  90.9  5e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2169  ribosomal protein S17  50.6 
 
 
86 aa  90.5  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.277733  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0400  30S ribosomal protein S17  52.44 
 
 
89 aa  90.9  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2831  30S ribosomal protein S17  58.02 
 
 
90 aa  90.5  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000151537  normal  0.471664 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0724  ribosomal protein S17  54.22 
 
 
85 aa  90.5  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  54.76 
 
 
84 aa  90.9  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0113  30S ribosomal protein S17  57.32 
 
 
87 aa  90.5  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000389804  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0700  30S ribosomal protein S17  58.57 
 
 
81 aa  90.1  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000459062  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  52.38 
 
 
84 aa  90.1  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  54.22 
 
 
86 aa  90.1  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2941  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 
89 aa  90.1  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00001015  hitchhiker  0.00000362348 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3288  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 
89 aa  90.1  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000278806  hitchhiker  0.00000199578 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5133  30S ribosomal protein S17  57.32 
 
 
90 aa  90.1  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.768581 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5186  30S ribosomal protein S17  56.1 
 
 
87 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000132516  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3635  30S ribosomal protein S17  56.79 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000372531  decreased coverage  0.00000000000123606 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0119  30S ribosomal protein S17  56.1 
 
 
87 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000418138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0119  30S ribosomal protein S17  56.1 
 
 
87 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0115  30S ribosomal protein S17  56.1 
 
 
87 aa  89.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.46917e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0113  30S ribosomal protein S17  56.1 
 
 
87 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152828  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0114  30S ribosomal protein S17  56.1 
 
 
87 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000376744  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  55.42 
 
 
98 aa  89.7  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0131  30S ribosomal protein S17  56.1 
 
 
87 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.17978e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0119  30S ribosomal protein S17  56.1 
 
 
87 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000491132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0150  30S ribosomal protein S17  56.1 
 
 
87 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108118  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0323  30S ribosomal protein S17  56.79 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000666609  decreased coverage  0.00233353 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17070  SSU ribosomal protein S17P  51.81 
 
 
93 aa  90.1  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000664642  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0285  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405514  normal  0.0233018 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  54.88 
 
 
100 aa  89.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0276  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000137406  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0140  30S ribosomal protein S17  56.1 
 
 
87 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000717207  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2966  SSU ribosomal protein S17P  53.01 
 
 
102 aa  89.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649614  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2650  30S ribosomal protein S17  54.88 
 
 
96 aa  89.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1845  30S ribosomal protein S17  51.28 
 
 
120 aa  89.4  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.48409e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0407  ribosomal protein S17  49.4 
 
 
90 aa  89  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3767  30S ribosomal protein S17  56.79 
 
 
90 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000138754  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2750  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 
90 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000100032  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1409  ribosomal protein S17  53.09 
 
 
89 aa  89  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>