53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0228 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0228  50S ribosomal protein L23  100 
 
 		 105 aa  211  2.9999999999999995e-54  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.194384  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  38.89 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  37.84 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  39.39 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1136  ribosomal protein L25/L23  35.87 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000719358  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  43.33 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0933  Ribosomal protein L25/L23  41.27 
 
 		 111 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0289  50S ribosomal protein L23  37.97 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0312226  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0662  50S ribosomal protein L23  32.29 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0694  50S ribosomal protein L23  35.8 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1187  Ribosomal protein L25/L23  34.94 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.102596 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf441  50S ribosomal protein L23  31.73 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  35.71 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3433  Ribosomal protein L25/L23  37.84 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0955  ribosomal protein L25/L23  36.36 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000594054  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1838  Ribosomal protein L25/L23  31.46 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000383843  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0228  ribosomal protein L25/L23  41.38 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  30.34 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  36.9 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2063  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000000993724  normal  0.203735 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  35.71 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  32.5 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0257  ribosomal protein L23  36.36 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5047  50S ribosomal protein L23  37.21 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185864  normal  0.262037 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  36.67 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00350  ribosomal protein, putative  34.09 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6612  50S ribosomal protein L23  35.14 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0983  Ribosomal protein L25/L23  32.58 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.285455  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  31.46 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3756  Ribosomal protein L25/L23  33.73 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.267631  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1557  ribosomal protein L25/L23  41.94 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271789  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1307  50S ribosomal protein L23  37.21 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433832  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  39.29 
 
 		 100 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl125  50S ribosomal protein L23  41.67 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000058644  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08856  60S ribosomal protein L23 (AFU_orthologue; AFUA_5G05630)  33.33 
 
 		 153 aa  42  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  32.1 
 
 		 103 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1149  Ribosomal protein L25/L23  38.33 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000523481  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0194  Ribosomal protein L25/L23  37.8 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  37.5 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  33.78 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0788  ribosomal protein L25/L23  35.87 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1042  50S ribosomal protein L23  34.88 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1032  50S ribosomal protein L23  34.88 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1015  50S ribosomal protein L23  34.88 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04000  50S ribosomal protein L23  35.14 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  43.64 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10717  50S ribosomal protein L23  36.49 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.215764 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2685  50S ribosomal protein L23  36.51 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.85807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2973  50S ribosomal protein L23  36.51 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.505088  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  33.93 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  30.95 
 
 		 101 aa  40  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4313  ribosomal protein L25/L23  36.49 
 
 		 100 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689927  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  39.73 
 
 		 97 aa  40  0.01  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>