More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0226 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0226  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 233 aa  470  1e-132  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  hitchhiker  0.00275796  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  47.85 
 
 		 211 aa  198  7e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  49.29 
 
 		 209 aa  195  6e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  49.03 
 
 		 217 aa  194  7e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  49.05 
 
 		 210 aa  191  7e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0696  50S ribosomal protein L3  47.16 
 
 		 223 aa  191  8e-48  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372092  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl123  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 238 aa  187  9e-47  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  9.499549999999999e-37  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 212 aa  187  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  48.57 
 
 		 211 aa  185  5e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  48.56 
 
 		 208 aa  185  6e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0291  50S ribosomal protein L3  49.05 
 
 		 209 aa  185  7e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000100637  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0981  ribosomal protein L3  48.57 
 
 		 215 aa  184  9e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.843676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  48.34 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  48.34 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  48.34 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  48.34 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  48.1 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  48.34 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  48.34 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  46.7 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  48.34 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  48.34 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  48.34 
 
 		 210 aa  182  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  48.34 
 
 		 210 aa  182  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  48.1 
 
 		 210 aa  181  7e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  45.5 
 
 		 207 aa  181  1e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  48.56 
 
 		 208 aa  181  1e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  46.19 
 
 		 210 aa  180  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  46.95 
 
 		 212 aa  180  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  48.1 
 
 		 209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  47.55 
 
 		 213 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0196  50S ribosomal protein L3  43.97 
 
 		 228 aa  178  4.999999999999999e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0113604  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  46.45 
 
 		 209 aa  178  7e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  45.83 
 
 		 217 aa  177  9e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  44.6 
 
 		 216 aa  177  9e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  45.83 
 
 		 217 aa  177  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  45.83 
 
 		 217 aa  177  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  44.55 
 
 		 222 aa  177  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  44.13 
 
 		 213 aa  177  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  46.92 
 
 		 211 aa  175  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  44.24 
 
 		 218 aa  175  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  46.23 
 
 		 219 aa  175  6e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3703  50S ribosomal protein L3  47.87 
 
 		 212 aa  175  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  45.02 
 
 		 213 aa  174  8e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2318  50S ribosomal protein L3  44.8 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000223614  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2619  50S ribosomal protein L3  46.41 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0132285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0595  50S ribosomal protein L3P  48.8 
 
 		 247 aa  174  9.999999999999999e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000158145  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  44.55 
 
 		 216 aa  174  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  47.14 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  45.02 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  44.23 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  43.54 
 
 		 206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4276  ribosomal protein L3  46.7 
 
 		 212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000028687  unclonable  0.00000000000491767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  44.91 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  43.66 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  44.98 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1831  50S ribosomal protein L3  43.89 
 
 		 220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000207996  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  43.52 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  44.34 
 
 		 211 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf444  50S ribosomal protein L3  41.78 
 
 		 272 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  42.65 
 
 		 219 aa  171  7.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1483  50S ribosomal protein L3  46.19 
 
 		 219 aa  171  9e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000163613  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  41.43 
 
 		 218 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  41.43 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2659  50S ribosomal protein L3  45.02 
 
 		 219 aa  169  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  44.55 
 
 		 219 aa  169  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1418  ribosomal protein L3  43.35 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.710723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  45.71 
 
 		 209 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2277  50S ribosomal protein L3  43.89 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000105261  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  43.33 
 
 		 207 aa  169  4e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  43.33 
 
 		 207 aa  169  4e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  45.24 
 
 		 209 aa  169  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  45.75 
 
 		 220 aa  169  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1955  50S ribosomal protein L3  41.43 
 
 		 218 aa  168  6e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  45.24 
 
 		 211 aa  168  7e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2155  50S ribosomal protein L3P  43.37 
 
 		 205 aa  168  8e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00587716  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  44.81 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0627  ribosomal protein L3  42.18 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  43.6 
 
 		 210 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1340  50S ribosomal protein L3  42.03 
 
 		 205 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0249  50S ribosomal protein L3  44.55 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.587373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0252  50S ribosomal protein L3  44.55 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  44.08 
 
 		 216 aa  166  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0194  50S ribosomal protein L3  44.29 
 
 		 210 aa  165  6.9999999999999995e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000719285  normal  0.0489845 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  46.26 
 
 		 209 aa  165  6.9999999999999995e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  44.08 
 
 		 205 aa  164  8e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0079  50S ribosomal protein L3  44.12 
 
 		 209 aa  164  8e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145283 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  44.08 
 
 		 211 aa  164  8e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  44.08 
 
 		 216 aa  164  9e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  43.81 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2372  ribosomal protein L3  43.54 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  43.33 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  44.13 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  43.19 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  46.73 
 
 		 209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  45.41 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6049  50S ribosomal protein L3  41.55 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185718  normal  0.220559 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  43.66 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  44.88 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  42.18 
 
 		 210 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>