More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0089 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0089  competence/damage-inducible protein CinA C- domain  100 
 
 
156 aa  309  1e-83  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  41.89 
 
 
156 aa  111  5e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  52.59 
 
 
411 aa  110  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  41.45 
 
 
413 aa  107  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  40.56 
 
 
415 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl205  competence-damage inducible protein  40.27 
 
 
152 aa  106  1e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.962311  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  36.71 
 
 
415 aa  106  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0880  competence/damage-inducible protein CinA  43.54 
 
 
166 aa  105  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0987  putative competence-damage protein  43.54 
 
 
166 aa  105  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0054  CinA domain protein  43.66 
 
 
163 aa  103  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1622  CinA-like  41.32 
 
 
165 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371737  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  39.61 
 
 
160 aa  102  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  40.16 
 
 
415 aa  100  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  39.86 
 
 
413 aa  100  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  41.29 
 
 
429 aa  99.8  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  43.18 
 
 
431 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4066  hypothetical protein  33.96 
 
 
203 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  45.54 
 
 
408 aa  97.8  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  33.11 
 
 
425 aa  98.2  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  36.94 
 
 
403 aa  97.8  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  34 
 
 
433 aa  97.4  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  44.44 
 
 
406 aa  97.4  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  43.18 
 
 
433 aa  96.7  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2574  CinA-like  33.55 
 
 
202 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1074  competence/damage-inducible protein CinA C-terminal domain protein  38.22 
 
 
169 aa  96.7  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.779028  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  43.24 
 
 
416 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  41.3 
 
 
412 aa  95.9  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  45.13 
 
 
418 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  44.95 
 
 
417 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  46.09 
 
 
411 aa  96.3  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  42.03 
 
 
412 aa  95.9  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  44.64 
 
 
408 aa  95.1  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  43.24 
 
 
416 aa  95.5  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1102  competence/damage-inducible protein cinA  38.06 
 
 
169 aa  94.7  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2886  CinA-like  35.71 
 
 
211 aa  95.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  34.53 
 
 
437 aa  94.7  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  33.11 
 
 
208 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  38.56 
 
 
415 aa  94.4  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1086  CinA domain-containing protein  40.8 
 
 
165 aa  94.4  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  39.84 
 
 
432 aa  94.4  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1291  competence/damage inducible protein CinA  36.94 
 
 
169 aa  93.6  8e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0461507  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  37.4 
 
 
413 aa  93.6  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  42.98 
 
 
412 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  42.98 
 
 
412 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2586  CinA-like  35.71 
 
 
208 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326299  hitchhiker  0.00472571 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1366  CinA-like  38.98 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.649556  normal  0.75874 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  44.25 
 
 
424 aa  92  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  45.37 
 
 
400 aa  92.8  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  40.71 
 
 
419 aa  92.8  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0852  CinA domain protein  37.68 
 
 
275 aa  92.8  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.168381  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  43.7 
 
 
412 aa  92.8  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  43.44 
 
 
408 aa  92  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1833  CinA-like  32.45 
 
 
208 aa  92  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.911534  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  35.76 
 
 
159 aa  92  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  42.98 
 
 
412 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  42.98 
 
 
412 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  32.69 
 
 
166 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  42.98 
 
 
412 aa  91.7  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  42.98 
 
 
412 aa  91.7  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  38.33 
 
 
415 aa  91.7  4e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  42.98 
 
 
412 aa  91.7  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0301  hypothetical protein  36.49 
 
 
416 aa  90.9  6e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.241188 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  42.86 
 
 
412 aa  90.9  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1438  CinA domain-containing protein  37.39 
 
 
166 aa  90.9  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.010805  hitchhiker  0.0000126181 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  41.82 
 
 
413 aa  90.5  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2859  CinA domain protein  32.26 
 
 
206 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  44.55 
 
 
421 aa  89.7  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4307  CinA domain-containing protein  36.76 
 
 
162 aa  90.1  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07190  competence/damage-inducible protein cinA  33.06 
 
 
173 aa  89.4  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372167  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  46.02 
 
 
425 aa  89  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  35.66 
 
 
184 aa  89  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  35.66 
 
 
162 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  35.66 
 
 
162 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  44.04 
 
 
408 aa  88.6  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  42.11 
 
 
412 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  39.17 
 
 
415 aa  88.6  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  37.41 
 
 
418 aa  88.2  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1563  CinA domain protein  32.91 
 
 
196 aa  88.2  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  33.81 
 
 
423 aa  87.8  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  38.3 
 
 
419 aa  87.8  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  38.18 
 
 
411 aa  87.8  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  44.55 
 
 
416 aa  87.8  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2816  CinA domain-containing protein  36.36 
 
 
175 aa  87.8  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.242047 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  33.33 
 
 
166 aa  87  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  37.19 
 
 
436 aa  87  8e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1462  CinA domain-containing protein  34.51 
 
 
161 aa  87  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100792  normal  0.368331 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  30.61 
 
 
414 aa  87  9e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1482  CinA domain-containing protein  38.98 
 
 
157 aa  87  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  42.99 
 
 
417 aa  86.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  39.67 
 
 
419 aa  86.3  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1808  CinA domain protein  30.13 
 
 
166 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101343 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2833  putative competence-damaged inducible protein  34.51 
 
 
161 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  35.61 
 
 
423 aa  85.9  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  32.69 
 
 
166 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  30.72 
 
 
168 aa  85.9  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  36.36 
 
 
162 aa  85.9  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0265  competence/damage-inducible protein CinA  32.47 
 
 
430 aa  85.9  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0226126 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  42.48 
 
 
412 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3043  CinA domain protein  35.77 
 
 
175 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22138  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  38.84 
 
 
420 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>