89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0085 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0085  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 		 379 aa  746    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  21.49 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl002  DNA polymerase III, beta chain  23.82 
 
 		 373 aa  67  0.0000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0002  DNA polymerase III subunit beta  20.37 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  23.78 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  23.28 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2720  DNA polymerase III, beta subunit  20.75 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2456  DNA polymerase III subunit beta  22.66 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115889  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  24.25 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  18.06 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1087  DNA polymerase III, beta subunit  21.51 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000722327  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  20.24 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  21.69 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0002  DNA polymerase III subunit beta  19.11 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  21.65 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.26 
 
 		 372 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  21.65 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12563  DNA polymerase III, beta chain  21.51 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.152259  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  22.16 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  20.22 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2720  DNA polymerase III subunit beta  23.03 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001463  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.24 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.140323  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  21.04 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0002  DNA polymerase III, beta subunit  21.97 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.105928  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0002  DNA-directed DNA polymerase  24.49 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  21.97 
 
 		 393 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  21.97 
 
 		 393 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  21.89 
 
 		 367 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2604  DNA polymerase III subunit beta  21.58 
 
 		 376 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.756021  hitchhiker  0.0000491978 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  22.19 
 
 		 390 aa  55.8  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1429  DNA polymerase III subunit beta  22.52 
 
 		 375 aa  55.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2499  DNA polymerase III subunit beta  21.92 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000103767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2684  DNA polymerase III subunit beta  21.92 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  21.5 
 
 		 375 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2750  DNA polymerase III subunit beta  21.92 
 
 		 376 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1752  DNA polymerase III, beta subunit  20.96 
 
 		 374 aa  54.7  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.236146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  21.24 
 
 		 375 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  20.89 
 
 		 375 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  22.62 
 
 		 385 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0815  DNA polymerase III, beta subunit  22.22 
 
 		 375 aa  53.5  0.000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  unclonable  0.000000015774  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2706  DNA polymerase III subunit beta  21.69 
 
 		 376 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.2 
 
 		 372 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3235  DNA polymerase III, beta subunit  21.07 
 
 		 374 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0867918 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  22.01 
 
 		 382 aa  52.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0002  DNA polymerase III subunit beta  20.61 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000320383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2699  DNA polymerase III subunit beta  21.28 
 
 		 376 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000020623 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0002  DNA polymerase III, beta subunit  21.26 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0002  DNA polymerase III subunit beta  19.32 
 
 		 380 aa  51.2  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.376275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2460  DNA polymerase III subunit beta  20.51 
 
 		 376 aa  50.4  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000810658  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.94 
 
 		 372 aa  50.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5506  DNA polymerase III, beta subunit  29.15 
 
 		 479 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.399861 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  20.73 
 
 		 367 aa  50.4  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000485336  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1067  DNA polymerase III, beta subunit  21.36 
 
 		 365 aa  50.1  0.00007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0458358  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  19.63 
 
 		 374 aa  50.1  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  20.86 
 
 		 374 aa  49.7  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.55 
 
 		 372 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000138199  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  24.34 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0002  DNA polymerase III subunit beta  20.4 
 
 		 372 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  22.71 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  22.75 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  22.28 
 
 		 366 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  22.28 
 
 		 366 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.1 
 
 		 373 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00126039  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2430  DNA polymerase III subunit beta  21.02 
 
 		 376 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000841235  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  18.7 
 
 		 385 aa  47.8  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0002  DNA-directed DNA polymerase  22.09 
 
 		 367 aa  47.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  21.47 
 
 		 376 aa  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  20.45 
 
 		 370 aa  47.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1171  DNA polymerase III, beta subunit  21.69 
 
 		 370 aa  47.4  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00934789  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00001  DNA polymerase III subunit beta  22.92 
 
 		 386 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0002  DNA polymerase III, beta subunit  22.1 
 
 		 366 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00540998  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0662  DNA polymerase III, beta subunit  20 
 
 		 366 aa  47.4  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000326321  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  19.62 
 
 		 378 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  21.52 
 
 		 388 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  20.64 
 
 		 372 aa  46.6  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0002  DNA polymerase III, beta subunit  19.52 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  17.84 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0162  DNA polymerase III subunit beta  21.57 
 
 		 372 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281652  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1009  DNA polymerase III, beta subunit  21.85 
 
 		 369 aa  44.7  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1328  DNA polymerase III subunit beta  21.3 
 
 		 386 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  20.6 
 
 		 367 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0686  DNA polymerase III, beta subunit  19.48 
 
 		 366 aa  43.5  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0347365  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0708  DNA polymerase III subunit beta  23.49 
 
 		 371 aa  43.9  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.147601  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0002  DNA polymerase III subunit beta  18.26 
 
 		 365 aa  43.5  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000590568  unclonable  0.00000000000512174 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0002  DNA polymerase III subunit beta  19.82 
 
 		 372 aa  43.5  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0730917  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  23.75 
 
 		 394 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  21.43 
 
 		 370 aa  43.5  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000729086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  20 
 
 		 365 aa  43.5  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  0.0000599685 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0002  DNA polymerase III subunit beta  19.82 
 
 		 372 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120269  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>