260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0083 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0083  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  100 
 
 
326 aa  662    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf854  PP-loop superfamily ATPase/cell cycle protein  35.71 
 
 
307 aa  167  2e-40  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl673  lysidine synthetase  44.93 
 
 
398 aa  158  1e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0014  hypothetical protein  44.1 
 
 
401 aa  150  4e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.709368  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0062  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.41 
 
 
462 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0340332  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0104  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  30.32 
 
 
455 aa  95.5  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2474  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.11 
 
 
469 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0791  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.32 
 
 
458 aa  94.7  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000325177  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2788  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.68 
 
 
469 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0062  hypothetical protein  34.78 
 
 
476 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0058  cell cycle protein  34.78 
 
 
476 aa  94  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0093  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.87 
 
 
457 aa  94  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167197  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0062  hypothetical protein  34.78 
 
 
476 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223025  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0071  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.78 
 
 
476 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3018  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.09 
 
 
450 aa  93.2  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0144  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.16 
 
 
472 aa  92.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175887  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0158  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.8 
 
 
457 aa  90.5  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0865096  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0058  cell cycle protein  33.7 
 
 
476 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.85 
 
 
464 aa  90.1  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1551  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.01 
 
 
241 aa  90.1  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000725449 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0061  hypothetical protein  33.7 
 
 
476 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.625972  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0074  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.7 
 
 
476 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0125987  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0357  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.25 
 
 
414 aa  89  9e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.173835  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.72 
 
 
476 aa  88.2  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.16 
 
 
476 aa  87.8  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0079  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.84 
 
 
509 aa  88.2  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0339  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.88 
 
 
419 aa  87.4  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0228  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.69 
 
 
473 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5217  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.89 
 
 
444 aa  87  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2255  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.89 
 
 
470 aa  87  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000164425  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0257  tRNA(Ile)-lysidine synthase (tRNA(Ile)-lysidinesynthetase) (tRNA(Ile)-2-lysyl-cytidine synthase)  32.55 
 
 
318 aa  86.7  5e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5246  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.52 
 
 
476 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.320432  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0207  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.24 
 
 
423 aa  85.9  9e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.716943  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1746  MesJ protein  28.5 
 
 
354 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0622  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.15 
 
 
456 aa  85.1  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.336141  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0640  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.72 
 
 
456 aa  84.3  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.180708  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2138  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.16 
 
 
436 aa  84.3  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.87877  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0070  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.98 
 
 
476 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0086  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.19 
 
 
470 aa  82.4  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0266  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.32 
 
 
464 aa  82  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0402  tRNA(Ile)-lysidine synthetase, MesJ  31.89 
 
 
430 aa  82  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0260657  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0878  cell cycle protein MesJ  26.24 
 
 
433 aa  81.6  0.00000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.42 
 
 
471 aa  80.1  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0862311  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0581  ATP/GTP hydrolase  31.07 
 
 
330 aa  80.5  0.00000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1229  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.05 
 
 
476 aa  79.3  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0198  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.82 
 
 
475 aa  79.3  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.723741  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2046  hypothetical protein  27.85 
 
 
454 aa  78.6  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000839704 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1786  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.75 
 
 
321 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0598  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.78 
 
 
334 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.070597 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1097  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.95 
 
 
434 aa  77.4  0.0000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0275  tRNA(Ile)-lysidine synthetase, MesJ  31.5 
 
 
431 aa  77.4  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.538522 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1626  PP-loop family protein  32.51 
 
 
321 aa  77  0.0000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1004  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.07 
 
 
521 aa  76.6  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.925519  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2624  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.51 
 
 
442 aa  75.9  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0846  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.42 
 
 
469 aa  75.9  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00012547  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1429  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.51 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.41369 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0012  putative cell-cycle protein, MesJ/Ycf62 family  27.18 
 
 
421 aa  75.5  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0704  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.34 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1446  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.02 
 
 
321 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1421  PP-loop family protein  26.45 
 
 
470 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0094  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.05 
 
 
454 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00560  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.71 
 
 
468 aa  74.3  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0427403  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1203  PP-loop  26.02 
 
 
476 aa  73.9  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0872  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31 
 
 
311 aa  73.2  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.203605  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0579  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.44 
 
 
431 aa  73.2  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.992157  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0228  MesJ/Ycf62 family protein  29.23 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.131932  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0626  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.14 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3626  hypothetical protein  21.24 
 
 
454 aa  72.8  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0712602  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1373  tRNA(Ile)-lysidine synthase (tRNA(Ile)-lysidinesynthetase) (tRNA(Ile)-2-lysyl-cytidine synthase)  28.64 
 
 
336 aa  73.2  0.000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0541  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.53 
 
 
336 aa  72.8  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.41194  normal  0.862893 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2187  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  30.05 
 
 
444 aa  72.4  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150034  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1198  hypothetical protein  29.35 
 
 
454 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0013516 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0964  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.41 
 
 
461 aa  72  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1556  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.16 
 
 
306 aa  72.4  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1310  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.52 
 
 
446 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.615384  normal  0.623923 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1815  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.96 
 
 
450 aa  71.2  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.195712  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1810  cell cycle protein MesJ, putative  26.74 
 
 
471 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0106411  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1618  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.85 
 
 
524 aa  70.1  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0950801 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09873  putative cell-cycle protein  29.1 
 
 
436 aa  70.1  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.55826  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4744  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  28.08 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.925373  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1609  MesJ protein  25.33 
 
 
332 aa  69.7  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0869  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.71 
 
 
455 aa  69.3  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1594  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.5 
 
 
457 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0978  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  30.98 
 
 
422 aa  68.9  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0172584  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2640  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27 
 
 
457 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2018  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  22.5 
 
 
375 aa  68.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0014  MesJ/Ycf62 family protein  26.07 
 
 
424 aa  67.8  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2362  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  26.46 
 
 
430 aa  67.4  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54755  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4334  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.73 
 
 
345 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.114566 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3027  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.36 
 
 
486 aa  67  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00722625  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0434  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.27 
 
 
331 aa  67  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1341  hypothetical protein  26.62 
 
 
460 aa  66.6  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.181704  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1738  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  29.02 
 
 
329 aa  66.6  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0818  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.48 
 
 
440 aa  66.6  0.0000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00477647  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2711  tRNA(Ile)-lysidine synthase  26.06 
 
 
371 aa  66.2  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.658001  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3762  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.2 
 
 
445 aa  66.2  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0801202  hitchhiker  0.00083153 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1891  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  27.07 
 
 
468 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000460009  hitchhiker  0.0000000000638883 
 
 
-
 
NC_002978  WD1254  cell cycle protein MesJ, putative  23.78 
 
 
431 aa  65.1  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0068  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.04 
 
 
480 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.552857  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1598  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  26.71 
 
 
284 aa  64.7  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.331107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>