More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0059 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf498  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.63 
 
 
458 aa  641    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.929082  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0059  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 
454 aa  924    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0359  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.27 
 
 
459 aa  672    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf256  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.07 
 
 
460 aa  677    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0564  F0F1 ATP synthase subunit beta  40.26 
 
 
464 aa  353  4e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.257197  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_503  ATP synthase F1, beta subunit  40.26 
 
 
464 aa  353  4e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0039983  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.48 
 
 
473 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.48 
 
 
473 aa  350  4e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.66 
 
 
468 aa  348  1e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0538  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.61 
 
 
464 aa  348  1e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.120643  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.66 
 
 
468 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.58 
 
 
469 aa  348  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.58 
 
 
469 aa  348  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.58 
 
 
469 aa  348  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.58 
 
 
469 aa  348  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1161  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.29 
 
 
518 aa  346  4e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.652698  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.36 
 
 
469 aa  346  5e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.58 
 
 
469 aa  345  7e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21400  ATP synthase, F1 beta subunit  39.48 
 
 
485 aa  345  8e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.66 
 
 
468 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1238  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.39 
 
 
480 aa  345  8.999999999999999e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  40.39 
 
 
468 aa  345  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.66 
 
 
468 aa  344  1e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0084  F0F1 ATP synthase subunit beta  40 
 
 
476 aa  345  1e-93  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0467  F0F1 ATP synthase subunit beta  40.04 
 
 
475 aa  345  1e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.83426  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1933  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.39 
 
 
469 aa  345  1e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.74 
 
 
468 aa  344  2e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.18 
 
 
476 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2668  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.37 
 
 
537 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  40.17 
 
 
468 aa  343  4e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1618  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.61 
 
 
474 aa  342  9e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.13 
 
 
464 aa  342  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4618  ATP synthase F1, beta subunit  39.65 
 
 
470 aa  341  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl115  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.74 
 
 
479 aa  341  2e-92  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2599  ATP synthase F1, beta subunit  39.07 
 
 
470 aa  341  2e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757842  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.34 
 
 
462 aa  340  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  40.71 
 
 
467 aa  341  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12050  ATP synthase, F1 beta subunit  39.13 
 
 
479 aa  341  2e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  39.05 
 
 
464 aa  341  2e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2797  F0F1 ATP synthase subunit beta  40.27 
 
 
459 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  38.91 
 
 
487 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1021  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.87 
 
 
470 aa  340  2.9999999999999998e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000575487  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1869  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.38 
 
 
466 aa  340  2.9999999999999998e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0485  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.74 
 
 
466 aa  340  4e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  38.41 
 
 
465 aa  339  5.9999999999999996e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1638  F0F1 ATP synthase subunit beta  39 
 
 
513 aa  339  7e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0091219  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2288  F0F1 ATP synthase subunit beta  40.65 
 
 
513 aa  338  8e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.966957  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  40.26 
 
 
465 aa  338  9e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0203  F0F1 ATP synthase subunit beta  40.22 
 
 
475 aa  338  9.999999999999999e-92  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.838406  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3049  F0F1 ATP synthase subunit beta  40.04 
 
 
487 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0424  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.53 
 
 
466 aa  338  9.999999999999999e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0745  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.43 
 
 
467 aa  337  1.9999999999999998e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2212  ATP synthase F1, beta subunit  39.25 
 
 
468 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.721667  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1024  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.56 
 
 
479 aa  338  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  40.26 
 
 
465 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0863  F0F1 ATP synthase subunit beta  41.13 
 
 
468 aa  337  3.9999999999999995e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.327939  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1045  ATP synthase F1, beta subunit  39.78 
 
 
483 aa  336  3.9999999999999995e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.711777  normal  0.102088 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0665  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.12 
 
 
504 aa  337  3.9999999999999995e-91  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000014903  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00570  conserved hypothetical protein  39.4 
 
 
547 aa  336  5e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0429252  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1298  ATP synthase F1, beta subunit  39.64 
 
 
493 aa  336  5e-91  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.713648 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1063  F0F1 ATP synthase subunit beta  37.94 
 
 
468 aa  336  5e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3511  F0F1 ATP synthase subunit beta  40.04 
 
 
468 aa  336  5.999999999999999e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.51 
 
 
462 aa  336  5.999999999999999e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1522  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.28 
 
 
484 aa  334  1e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000415981  hitchhiker  2.83591e-17 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  38.88 
 
 
467 aa  335  1e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0435  F0F1 ATP synthase subunit beta  37.44 
 
 
462 aa  335  1e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.575594  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03113  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.21 
 
 
468 aa  335  1e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  37.83 
 
 
471 aa  335  1e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04083  F0F1 ATP synthase subunit beta  40.53 
 
 
461 aa  334  2e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0301285  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0310  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.02 
 
 
459 aa  334  2e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.239632  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.1 
 
 
462 aa  334  2e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3875  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.6 
 
 
464 aa  334  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  41.72 
 
 
465 aa  334  2e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1709  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.61 
 
 
470 aa  333  3e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.118931  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0653  F0F1 ATP synthase subunit beta  37.63 
 
 
490 aa  333  3e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.903805 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4737  F0F1 ATP synthase subunit beta  40.21 
 
 
542 aa  333  4e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.603739  decreased coverage  0.00210198 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2430  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.38 
 
 
458 aa  333  5e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0681755  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.87 
 
 
482 aa  332  7.000000000000001e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  40.31 
 
 
484 aa  332  7.000000000000001e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.41 
 
 
472 aa  332  8e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3916  ATP synthase F1, beta subunit  39.06 
 
 
476 aa  332  8e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.876404  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.48 
 
 
462 aa  332  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2139  F0F1 ATP synthase subunit beta  37.96 
 
 
470 aa  331  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.12979  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2177  F0F1 ATP synthase subunit beta  37.96 
 
 
470 aa  331  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.104678  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3074  F0F1 ATP synthase subunit beta  39 
 
 
458 aa  331  2e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2336  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.21 
 
 
474 aa  331  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6136  F0F1 ATP synthase subunit beta  37.94 
 
 
478 aa  331  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.41 
 
 
462 aa  331  2e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.38 
 
 
462 aa  330  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.44 
 
 
465 aa  330  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4295  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.87 
 
 
461 aa  331  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.797845  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0900  ATP synthase F1 subunit beta  39.09 
 
 
482 aa  331  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474083  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2869  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.04 
 
 
458 aa  331  2e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.761227  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1954  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.65 
 
 
489 aa  331  2e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  39.39 
 
 
482 aa  331  2e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2382  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.13 
 
 
476 aa  330  3e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.94 
 
 
462 aa  330  3e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2188  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.55 
 
 
473 aa  330  4e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0174  F0F1 ATP synthase subunit beta  39.74 
 
 
476 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1313  F0F1 ATP synthase subunit beta  38.56 
 
 
493 aa  330  4e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455385  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>